• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

高変異縦列反復配列とその近傍配列情報を統合した最高度多型マーカー解析法の確立

研究課題

研究課題/領域番号 16390193
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 法医学
研究機関京都大学

研究代表者

玉木 敬二  京都大学, 医学研究科, 教授 (90217175)

研究分担者 鶴山 竜昭  京都大学, 医学研究科, 講師 (00303842)
飯野 守男  京都大学, 医学研究科, 助手 (80362466)
山本 敏充  名古屋大学, 医学研究科, 助教授 (50260592)
後藤 宙人  京都大学, 医学研究科, 助手 (40378625)
研究期間 (年度) 2004 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
13,000千円 (直接経費: 13,000千円)
2005年度: 4,500千円 (直接経費: 4,500千円)
2004年度: 8,500千円 (直接経費: 8,500千円)
キーワードミニサテライト / DNA多型 / CEB1 / MS32 / 個人識別
研究概要

法医実務では変性して断片化したDNA試料の場合が多く、比較的長さの大きいフラグメントのローカスでは検出できなくなってしまう。16年度は現在最も高変異なヒトミニサテライトであるCEB1について、初めて日本人における性状解析を行った。その結果、ミニサテライトは長さによるヘテロ接合度が85%に達し、アリル長は平均69リピートの一峰性分布を示した。また、CEB1にはアリル近傍に多数のSNPsが欧米人のアリルにおいて報告されているが、我々は、日本人において新しいSNPをアリル近傍下流に発見した。さらに、アリル3'末端側のリピート構造を分析したところ、各アリル内および各アリル間でリピート構造は全て異なっており、従来の報告以外の位置でも塩基置換、挿入/欠失がみられた。17年度は、MS32(D1S8)のアリル構造について、今まで分析されていないタイ人についておこなった。まず、ミニサテライトの5´末端付近の近傍配列の一塩基多型(SNP)のハプロタイピングをおこなった。その結果、タイ人は日本人に比べてアリル頻度はやや異なるが、いずれの部位も多型性を有していた。このSNPを利用してアリル特異的MVR-PCRを行い、アリルのマッピングをおこなった。マッピングされた106例のうち102個のアリルは全て異なっていた。このため、MS32はタイ人においても、極めて有用な個人識別マーカーとなりうることが示された。さらに、ドット・マトリクス法で、今までマッピングされた世界の民族アリルのデータと構造を比較したところ、有意な類似性を示してグループを作成するものが半数以上あった。タイ人アリルに最も似ているアリルに日本人アリルが選ばれる場合が、コーカシアンアリルに比べ2倍以上あり、また、アフリカンアリルに最も似ているという結果を示したアリルは見られなかった。このように、MS32はタイ人においても多型マーカーとして極めて有用なローカスであることが示された。今後は、B6.7など他のローカスや他の集団に分析を拡げて、高度なミニサテライト解析法を確立したいと考えている

報告書

(3件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2006 2005 2004

すべて 雑誌論文 (11件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] ミニサテライトの解析法-DNAフィンガーブリントからMVR-PCRまで.2006

    • 著者名/発表者名
      玉木 敬二
    • 雑誌名

      臨床検査 50

      ページ: 317-326

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Minisatellite and microsatellite DNA typing analysis2006

    • 著者名/発表者名
      Tamaki K.
    • 雑誌名

      Molecular Forensics (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Methods for analysing human minisatellites (in Japanese)2006

    • 著者名/発表者名
      Tamaki K.
    • 雑誌名

      Rinsho Kensa 50

      ページ: 317-326

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Comparative analysis of MS32 alleles between Thais and Japanese.2005

    • 著者名/発表者名
      Yuan Q-H
    • 雑誌名

      Rechtsmedizin 15

      ページ: 285-285

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Human tandem repeat sequences in forensic DNA typing.2005

    • 著者名/発表者名
      Tamaki K
    • 雑誌名

      Legal Med 7

      ページ: 244-250

    • NAID

      10027261270

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Comparative analysis of MS32 alleles between Thais and Japanese.2005

    • 著者名/発表者名
      Yuan Q-H et al.
    • 雑誌名

      Rechtsmedizin 15

      ページ: 285-285

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Human tandem repeat sequences in forensic DNA typing.2005

    • 著者名/発表者名
      Tamaki K.
    • 雑誌名

      Legal Med 7

      ページ: 244-250

    • NAID

      10027261270

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] ミニサテライトの解析法-DNAフィンガープリントからMVR-PCRまで.2005

    • 著者名/発表者名
      玉木 敬二
    • 雑誌名

      臨床検査 (印刷中)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 高変異ミニサテライトCEBl (D2S90)の多型分析2004

    • 著者名/発表者名
      後藤 宙人
    • 雑誌名

      DXA多型 12

      ページ: 95-98

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Polymorphic analysis of hypermutable minisatellite CEB1 (D2S90)2004

    • 著者名/発表者名
      Goto H et al.
    • 雑誌名

      DNA polymorphism 12

      ページ: 95-98

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 高変異ミニサテライトCEB1(D2S90)の多型分析2004

    • 著者名/発表者名
      後藤 宙人
    • 雑誌名

      DNA多型 12

      ページ: 95-98

    • NAID

      10013660826

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [図書] Molecular Forensics2006

    • 著者名/発表者名
      Tamaki K
    • 出版者
      Minisatellite and microsatellite DNA typing analysis(印刷中)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要

URL: 

公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi