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細菌における細胞システムの構築原理の研究

研究課題

研究課題/領域番号 17017026
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関奈良先端科学技術大学院大学

研究代表者

小笠原 直毅  奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 教授 (10110553)

研究分担者 森 浩禎  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (90182203)
金谷 重彦  奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 教授 (90224584)
大島 拓  奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 助教 (50346318)
石川 周  奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 助教 (30359872)
小林 和夫  奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 助手 (70324978)
研究期間 (年度) 2005 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
200,400千円 (直接経費: 200,400千円)
2009年度: 41,700千円 (直接経費: 41,700千円)
2008年度: 40,100千円 (直接経費: 40,100千円)
2007年度: 39,600千円 (直接経費: 39,600千円)
2006年度: 39,000千円 (直接経費: 39,000千円)
2005年度: 40,000千円 (直接経費: 40,000千円)
キーワード細菌細胞 / 枯草菌 / 大腸菌 / 転写制御 / ChIP-chip解析 / 必須タンパク質 / タンパク質複合体 / システム生物学 / 遺伝子発現制御 / タイリングチップ / 細胞システム
研究概要

細菌細胞の増殖を支える遺伝子・タンパク質のネットワークがどのように構築されているか、その基本原理の解明を目指して、2大モデル細菌である枯草菌・大腸菌を対象として、タイリングチップを用いたChIP-chip解析や質量分析法を用いた複合来解析等の新たな研究手法の導入を進め、新たな必須遺伝子機能、必須遺伝子産物間の機能ネットワーク、転写調節タンパク質と核様体タンパク質による転写制御ネットワーク、核様体タンパク質による細胞周期制御、代謝ネットワークのモデル化等について、多くの新たな知見を明らかにした。

報告書

(6件)
  • 2009 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (96件)

すべて 2010 2009 2008 2007 2006 2005

すべて 雑誌論文 (49件) (うち査読あり 38件) 学会発表 (43件) 図書 (4件)

  • [雑誌論文] Update on the Keio collection of Escherichia coli single-gene deletion mutants.2009

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto, N., Nakahigashi, K., Nakamichi, T., Yoshino, M., Takai, Y., Touda, Y., Furubayashi, A., Kinjo, S., Dose, H., Hasegawa, M., Datsenko, K.A., Nakayashiki, T., Tomita, M., Wanner, B.L., Mori H.
    • 雑誌名

      Mol Syst Biol 5,335

    • NAID

      120005830849

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Assessment of transcriptional responses in Bacillus subtilis cells to an antibiotic, Enduracidin, interfering with cell wall synthesis, by using a high-density tilling chip.2009

    • 著者名/発表者名
      Rukmana, A., Morimoto, T., Takahashi, H., Giyanto, Ogasawara, N.
    • 雑誌名

      Gene Genet Sys 84

      ページ: 253-267

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Noc protein binds to specific DNA sequences to coordinate cell division with chromosome segregation.2009

    • 著者名/発表者名
      Wu, L.J., Ishikawa, S., Kawai, Y., Oshima, T., Ogasawara, N., Errington, J.
    • 雑誌名

      EMBO J 28

      ページ: 1940-1952

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Systematic genome-wide scanning for genes involved in ATP generation in Escherichia coli.2009

    • 著者名/発表者名
      Hara, K.Y., Shimodate, N., Ito, M., Baba, T., Mori, H.
    • 雑誌名

      Metab Eng 11

      ページ: 1-7

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Differential binding profiles of StpA in wild-type and hns mutant cells: a comparative analysis of cooperative partners by ChIP-chip analysis.2009

    • 著者名/発表者名
      Uyar, E., Kurokawa, K., Yoshimura, M., Ishikawa, S., Ogasawara, N., Oshima, T.
    • 雑誌名

      J Bacteriol 191

      ページ: 2388-2391

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Noc protein binds to specific DNA sequences to coordinate cell division with chromosome segregation2009

    • 著者名/発表者名
      Wu, L.J.
    • 雑誌名

      EMBO J 28

      ページ: 1940-1952

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Assessment of transcriptional responses of Bacillus subtilis cells to the antibiotic enduracidin, which interferes with cell wall synthesis, using a high-density tiling chip2009

    • 著者名/発表者名
      Rukmana, A.
    • 雑誌名

      Genes Gent Sys 84

      ページ: 253-267

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Differential binding profiles of StpA in wild-type and has mutantcells : a comparative analysis of cooperative partners by chromatin immunoprecipitation-microarray analysis2009

    • 著者名/発表者名
      Uyar, E.
    • 雑誌名

      J Bacteriol 191

      ページ: 2388-2391

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] eSGA: E. coli synthetic genetic array analysis.2008

    • 著者名/発表者名
      Butland, G., Babu, M., Diaz-Mejia, J.J., Bohdana, F., Phanse, S., Gold, B., Yang, W., Li, J., Gagarinova, A.G., Pogoutse, O., Mori, H., Wanner, B.L., Lo, H., Wasniewski, J., Christopolous, C., Ali, M., Venn, P., Safavi-Naini, A., Sourour, N., Caron, S., Choi, J.Y., Laigle, L., Nazarians-Armavil, A., Deshpande, A., Joe, S., Datsenko, K.A.,Yamamoto, N., Andrews, B.J., Boone, C., Ding, H., Sheikh, B., Moreno-Hagelseib, G., Greenblatt, J.F., Emili, A.
    • 雑誌名

      Nat Methods 5

      ページ: 789-795

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High-throughput, quantitative analyses of genetic interactions2008

    • 著者名/発表者名
      Typas, A., Nichols, R.J., Siegele, D.A., Shales, M., Collins, S.R., Lim, B., Braberg, H., Yamamoto, N., Takeuchi, R., Wanner, B.L., Mori, H., Weissman, J.S., Krogan, N.J., Gross, C.A.
    • 雑誌名

      E. coli. Nat Methods 5

      ページ: 781-787

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Metabolomics approach for determining growth-specific metabolites based on Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry2008

    • 著者名/発表者名
      Takahashi H, Kai K, Shinbo Y, Tanaka K, Ohta D, Oshima T, Altaf-Ul-Amin M, Kurokawa K, Ogasawara N, Kanaya S.
    • 雑誌名

      Anal Bioanal Chem 391

      ページ: 2769-2782

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The functional analysis of YabA, which interacts with DnaA and regulates initiation of chromosome replication in Bacillus subtils.2008

    • 著者名/発表者名
      Cho, E., Ogasawara, N., Ishikawa, S.
    • 雑誌名

      Gene Genet Sys 83

      ページ: 111-125

    • NAID

      10024395781

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Global regulation by horizontally transferred regulators establishes the pathogenicity of Escherichia coli.2008

    • 著者名/発表者名
      Abe, H., Miyahara, A., Oshima, T., Tashiro, K., Ogura, Y., Kuhara, S., Ogasawara, N., Hayashi, T., Tobe, T.
    • 雑誌名

      DNA Res 15

      ページ: 25-38

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The functional analysis of YabA, which interacts with DnaA and regulates initiation of chromosome replication in Bacillus subtils2008

    • 著者名/発表者名
      Cho, E.
    • 雑誌名

      Genes Genet Sys 83

      ページ: 111-125

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Metabolomics approach for determining growth-specific metabolites based on Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry2008

    • 著者名/発表者名
      Takahashi, H.
    • 雑誌名

      Anal Bioanal Chem 391

      ページ: 2769-2782

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Global regulation by horizontally transferred regulators establishes the pathogenicity of Escherichia coli2008

    • 著者名/発表者名
      Abe, H.
    • 雑誌名

      DNA Res 15

      ページ: 25-38

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Predicting state transitions in the transcriptome and metabolome using a linear dynamic system model.2007

    • 著者名/発表者名
      Morioka, R., Kanaya, S.,, Hirai, M., Yano, M., Ogasawara, N., Saito, K.
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics 8,343

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Distribution of stable DnaA-binding sites on the Bacillus subtilis genome detected using a modified ChIP-chip method.2007

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa, S., Ogura, Y., Yoshimura, M., Okumura, H., Cho, E., Kawai, Y., Kurokawa, K., Oshima, T., Ogasawara, N.
    • 雑誌名

      DNA Res 14

      ページ: 155-168

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The GTP-binding protein YqeH participates in biogenesis of the 30S ribosome subunit in Bacillus subtilis.2007

    • 著者名/発表者名
      Loh, P.C., Morimoto, T., Matsuo, Y., Oshima, T., Ogasawara, N.
    • 雑誌名

      Gene Genet Sys 82

      ページ: 281-289

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation and characterization of a dominant negative mutant of Bacillus subtilis GTP-binding protein, YlqF, essential for biogenesis and maintenance of the 50S ribosomal subunit.2007

    • 著者名/発表者名
      Matsuo, Y., Oshima, T., Loh, P.C., Morimoto, T., Ogasawara, N.
    • 雑誌名

      J Biol Chem 282

      ページ: 25270-25277

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamic simulation of an in vitro multi-enzyme system.2007

    • 著者名/発表者名
      Ishii, N., Suga, Y., Hagiya, A., Watanabe, H., Mori, H., Yoshino, M., Tomita, M.
    • 雑誌名

      FEBS Lett 581

      ページ: 413-420

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Multiple high-throughput analyses monitor the response of E. coli to perturbations.2007

    • 著者名/発表者名
      Ishii, N., Nakahigashi, K., Baba, T., Robert, M., Soga, T., Kanai, A., Hirasawa, T., Naba, M., Hirai, K., Hoque, A., Ho, P.Y., Kakazu, Y., Sugawara, K., Igarashi, S., Harada, S., Masuda, T., Sugiyama, N., Togashi, T., Hasegawa, M., Takai, Y., Yugi, K., Arakawa, K., Iwata, N., Toya, Y., Nakayama, Y., Nishioka, T., Shimizu, K., Mori, H., Tomita, M.
    • 雑誌名

      Science 316

      ページ: 593-597

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Involvement of the YneS/YgiH and PlsX proteins in phospholipid biosynthesis in both Bacillus subtilis and Escherichia coli.2007

    • 著者名/発表者名
      Yoshimura, M., Oshima, T., Ogasawara, N.
    • 雑誌名

      BMC Microbiol 7,69

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The entire organization of transcription units on the Bacillus subtilis genome.2007

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi, H., Akitomi, J., Fujii, N., Kobayashi, K., Altaf-Ul-Amin, M., Kurokawa, K., Ogasawara, N., Kanaya, S.
    • 雑誌名

      BMC Genomics 8,197

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The entire organization of transcription units on the Bacillus subtilis genome2007

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi, H.
    • 雑誌名

      BMC Genomics 8

      ページ: 197-197

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Involvement of the YneS/YgiH and PlsX proteins in phospholipid biosynthesis in both Bacillus subtilis and Escherichia coli2007

    • 著者名/発表者名
      Yoshimura, M
    • 雑誌名

      BMC Microbiol 7

      ページ: 69-69

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Multiple high-throughput analyses monitor the response of E. coli to perturbations2007

    • 著者名/発表者名
      Ishii, N.
    • 雑誌名

      Science 316

      ページ: 593-597

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamic simulation of an in vitro multi-enzyme system2007

    • 著者名/発表者名
      Ishii, N.
    • 雑誌名

      FEBS Lett 581

      ページ: 413-420

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation and characterization of a dominant negative mutant of Bacillus subtilis GTP-binding protein, YlqF, essential for biogenesis and maintenance of the 50S ribosomal subunit2007

    • 著者名/発表者名
      Matsuo, Y.
    • 雑誌名

      J Biol Chem 282

      ページ: 25270-25277

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The GTP-binding protein YqeH participates in biogenesis of the 30S ribosome subunit in Bacillus subtilis2007

    • 著者名/発表者名
      Loh, P.C.
    • 雑誌名

      Gene Genet Sys 82

      ページ: 281-289

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Distribution of stable DnaA-binding sites on the Bacillus subtilis genome detected using a modified ChIP-chip method2007

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa, S.
    • 雑誌名

      DNA Res 14

      ページ: 155-168

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Predicting state transitions in the transcriptome and metabolome using a linear dynamic system model2007

    • 著者名/発表者名
      Morioka, R.
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics 8

      ページ: 343-343

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Escherichia coli histone-like protein H-NS preferentially binds to horizontally acquired DNA in association with RNA polymerase.2006

    • 著者名/発表者名
      Oshima, T., Ishikawa, S., Kurokawa, K., Aiba, H., Ogasawara, N.
    • 雑誌名

      DNA Res 13

      ページ: 141-153

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A new FtsZ-interacting protein, YlmF, complements the activity of FtsA during progression of cell division in Bacillus subtilis.2006

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa, S., Kawai, Y., Hiramatsu, K., Kuwano, M., Ogasawara, N.
    • 雑誌名

      Mol Microbiol 60

      ページ: 1364-1380

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Bacillus subtilis EzrA and FtsL synergistically regulate FtsZ ring dynamics during cell division.2006

    • 著者名/発表者名
      Kawai, Y., Ogasawara, N.
    • 雑誌名

      Microbiology 152

      ページ: 1129-1141

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The GTP-binding Protein YlqF Participates in the Late Step of 50 S Ribosomal Subunit Assembly in Bacillus subtilis.2006

    • 著者名/発表者名
      Matsuo, Y., Morimoto, T., Kuwano, M., Loh, P.C., Oshima, T., Ogasawara, N.
    • 雑誌名

      J Biol Chem 281

      ページ: 8110-8117

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Construction of Escherichia coli K-12 in-frame, single-gene knockout mutants: the Keio collection.2006

    • 著者名/発表者名
      Baba, T., Ara, T., Hasegawa, M., Takai, Y., Okumura, Y., Baba, M., Datsenko, K.A., Tomita, M., Wanner, B.L., Mori, H.
    • 雑誌名

      Mol Sys Biol 2

      ページ: 8-8

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Functional dissection of YabA, a negative regulator of DNA replication initiation in Bacillus subtilis.2006

    • 著者名/発表者名
      Noirot-Gros, M.F., Velten, M., Yoshimura, M., McGovern, S., Morimoto, T., Ehrlich, S.D., Ogasawara, N., Polard, P., Noirot, P.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA 103

      ページ: 2368-2373

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The GTP-binding protein, YlqF, participates in the late step of 50S ribosomal subunit assembly in Bacillus subtilis2006

    • 著者名/発表者名
      Matsuo, Y.
    • 雑誌名

      J Biol Chem 281・12

      ページ: 8110-8117

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Bacillus subtilis EzrA and FtsL synergistically regulate FtsZ ring dynamics during cell division2006

    • 著者名/発表者名
      Kawai, Y.
    • 雑誌名

      Microbiol 152・4

      ページ: 1129-1141

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] A new FtsZ-interacting protein, YlmF, complements the activity of FtsA during progression of cell division in Bacillus subtilis2006

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa, S.
    • 雑誌名

      Mol Microbiol 60・6

      ページ: 1364-1380

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Escherichia coli histone-like protein H-NS preferentially binds to horizontally acquired DNA in association with RNA polymerase2006

    • 著者名/発表者名
      Oshima, T.
    • 雑誌名

      DNA Res 13・4

      ページ: 141-153

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Construction of Escherichia coli K-12 in-frame, single-gene knockout mutants : the Keio collection2006

    • 著者名/発表者名
      Baba, T.
    • 雑誌名

      Mol Syst Biol 2

      ページ: 20060008-20060008

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] タイリングチップを用いた細菌ゲノム機能研究の可能性2006

    • 著者名/発表者名
      大島 拓
    • 雑誌名

      細胞工学 25・10

      ページ: 1155-1160

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Functional dissection of YabA, a negative regulator of DNA replication initiation in Bacillus subtilis2006

    • 著者名/発表者名
      Noirot-Gros, M.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA 103

      ページ: 2368-2373

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] The GTP-binding protein, YlqF, participates in the late step of 50S ribosomal subunit assembly in Bacillus subtilis2006

    • 著者名/発表者名
      Matsuo, Y.
    • 雑誌名

      J Biol Chem (in press)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Bacillus subtilis EzrA and FtsL synergistically regulate FtsZ ring dynamics during cell division2006

    • 著者名/発表者名
      Kawai, Y.
    • 雑誌名

      Microbiol (in press)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Synergistic regulation of competence development in Bacillus subtilis by two Rap-Phr systems2005

    • 著者名/発表者名
      Bongiorni, C
    • 雑誌名

      J Bacteriol 187

      ページ: 4353-4361

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Bacillus subtilis YabA is involved in determining the timing and synchrony of replication initiation2005

    • 著者名/発表者名
      Hayashi, M.
    • 雑誌名

      FEMS Microbiol Lett 247

      ページ: 73-79

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌O157:H7 sakaiおよびK12株のFur結合プロファイルのChIP-chip解析による比較2010

    • 著者名/発表者名
      大島拓
    • 学会等名
      第4回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2010-03-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌核様体タンパク質LRPとH-NS間の協同的な働き2010

    • 著者名/発表者名
      上田剛士
    • 学会等名
      第4回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2010-03-07
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] ChIP-qPCR法による大腸菌K-12の銅耐性機構の解析2009

    • 著者名/発表者名
      草合千嘉子
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2009-12-12
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] ChAP-chip解析を用いたin vivoにおける枯草菌RNA polymerase α subunit(RoA)と相互作用するゲノム部位の網羅解析2009

    • 著者名/発表者名
      村山智彦
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2009-12-12
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] ChIP-chip解析による異なる大腸菌種におけるFurの結合領域の比較解析2009

    • 著者名/発表者名
      加賀山陽子
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2009-12-12
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] FtsZのアクセサリー蛋白質と核様体閉鎖によるZ-ring形成の制御2009

    • 著者名/発表者名
      石川周
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2009-12-11
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Search of nucleoid proteins in Bacillus subtilis : comparative analysis using ChAP(ChIP)-chip analysis between in B.subtilis and E.coli.2009

    • 著者名/発表者名
      大島拓
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2009-12-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌における新規核様体蛋白質の同定2009

    • 著者名/発表者名
      Ying Lei
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2009-12-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌の細胞分裂におけるFtsZ複合体のメカニズム解明2009

    • 著者名/発表者名
      調真里子
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2009-12-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] The initiation complex of Bacillus subtilis RNA polymerase is rapidly converted to the elongation complex in vivo2009

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa, S.
    • 学会等名
      5th Internatinal Conference on Gram-positive Microorizamsms
    • 発表場所
      San Diego, CA USA
    • 年月日
      2009-06-16
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Involvement of DnaA in the organization of B.subtilis nucleoid structure2009

    • 著者名/発表者名
      Okumura, H.
    • 学会等名
      5th Internatinal Conference on Gram-positive Microorganisms
    • 発表場所
      San Diego, CA USA
    • 年月日
      2009-06-15
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 細菌の細胞分裂の分子メカニズム2009

    • 著者名/発表者名
      石川周
    • 学会等名
      日本農芸化学会2009年度大会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-03-29
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ChIP-chip法による大腸菌・枯草菌の核様体タンパク質の研究2009

    • 著者名/発表者名
      小笠原直毅
    • 学会等名
      第3回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-03-07
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌染色体のDnaA結合配列の機能2009

    • 著者名/発表者名
      奥村元
    • 学会等名
      第3回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-03-07
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Control of RNA polymerase dynamics by GreA in B. subtilis2009

    • 著者名/発表者名
      楠屋陽子
    • 学会等名
      第3回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-03-06
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Gene-to gene and gene-to-metabolite network analysis based on the time lag between gene and metabolite in Escherichia coli.2009

    • 著者名/発表者名
      Takahashi, H., Morikawa, R., Kai, K., Ohta, D., Oshima, T., Altaf-Ul-Amin, M., Ogasawara, N., Kanaya, S.
    • 学会等名
      4th European Conference on Prokaryotic Genomics
    • 発表場所
      Gottingen, Germany
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Involvement of DnaA in the organization of B. subtilis nucleoid structure.2009

    • 著者名/発表者名
      Okumura, H., Yoshimura, M., Ishikawa, S., Ogasawara, N.
    • 学会等名
      15th International Conference on Bacilli (5th International Conference on Gram-positive Microorganisms)
    • 発表場所
      San Diego, CA USA
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Distribution of stable DnaA binding sites on the Bacillus subtilis genome2008

    • 著者名/発表者名
      Okumura, H.
    • 学会等名
      XX International Congress of Genetics
    • 発表場所
      Berlin, Germany
    • 年月日
      2008-07-15
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Distribution of RNA polymerase on the Bacillus subtilis genome2008

    • 著者名/発表者名
      Kusuya, Y.
    • 学会等名
      XX International Congress of Genetics
    • 発表場所
      Berlin, Germany
    • 年月日
      2008-07-14
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Distribution of StpA across the E. coli genome and functionalrelationship with H-NS2008

    • 著者名/発表者名
      Uya, E.
    • 学会等名
      XX International Congress of Genetics
    • 発表場所
      Berlin, Germany
    • 年月日
      2008-07-14
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] A novel regulation mechanism for the initiation of replication in Bacillus subtilis2008

    • 著者名/発表者名
      Cho, E.
    • 学会等名
      EMBO Conference on Replication and Segregation of Chromosomes
    • 発表場所
      Geilo, Norway
    • 年月日
      2008-06-18
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Distribution of RNA polymerase on the Bacillus subtilis genome2008

    • 著者名/発表者名
      Ogasawara, N.
    • 学会等名
      GENOMES 2008, Furictional Genomics of Microorganisms
    • 発表場所
      Paris, France
    • 年月日
      2008-04-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Distribution of StpA across the E. coli genome and functional relationship with H-NS.2008

    • 著者名/発表者名
      Uya, E., Oshima, T., Ogasawara, N.
    • 学会等名
      XX International Congress of Genetics
    • 発表場所
      Berlin, Germany
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] A novel regulation mechanism for the initiation of replication in Bacillus subtilis.2008

    • 著者名/発表者名
      Cho, E., Ishikawa, S., Ogasawara, N.
    • 学会等名
      EMBO Conference on Replication and Segregation of Chromosomes
    • 発表場所
      Geilo, Norway
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Distribution of RNA polymerase on the Bacillus subtilis genome.2008

    • 著者名/発表者名
      Kusuya, Y., Oshima, T., Ishikawa, S., Kurokawa, K., Ogasawara, N.
    • 学会等名
      Functional Genomics of Microorganisms
    • 発表場所
      Paris, France
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 枯草菌の50Sリボソームサブユニットの生合成におけるGTP結合タンパク質の結合モデルの提案2008

    • 著者名/発表者名
      松尾 芳隆
    • 学会等名
      第2回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Distribution of StpA across the E. coli genome and its functional relationship with H-NS2008

    • 著者名/発表者名
      EBRU UYAR
    • 学会等名
      第2回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 転写伸長因子NusAとGreAの枯草菌ゲノム上での分布2008

    • 著者名/発表者名
      楠屋 陽子
    • 学会等名
      第2回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌染色体のDnaA結合配列の機能2008

    • 著者名/発表者名
      奥村 元
    • 学会等名
      第2回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Distribution of RNA polymerase on the Bacillus subtilis genome2008

    • 著者名/発表者名
      Ogasawara, N.
    • 学会等名
      Functional Genomics of Microorganisms
    • 発表場所
      Paris, France
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] N-terminal deletion mutant of YlqF, which is essential GTP-binding protein, displays dominant negative phenotype in Bacillus subtilis.2007

    • 著者名/発表者名
      Matsuo, Y., Loh, P.C., Morimoto, T., Oshima, T., Ogasawara, N.
    • 学会等名
      14th International Conference on Bacilli
    • 発表場所
      Pisa, Italy
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Regulation of initiation of replication of the Bacillus subtilis genome by DnaA and YabA2007

    • 著者名/発表者名
      Cho, E.
    • 学会等名
      14th Conference on Functional Genomics of Gram-Positive Microorganisms
    • 発表場所
      Pisa, Italy
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Distribution of stable DnaA binding sites on the Bacillus subtilis genome revealed by a modified ChIP-chip method2007

    • 著者名/発表者名
      Okumura, H.
    • 学会等名
      14th Conference on Functional Genomics of Gram-Positive Microorganisms
    • 発表場所
      Pisa, Italy
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] N-terminal deletion mutant of YlqF, which is essential GTP-binding protein, displays dominant negative phenotype in Bacillus subtilis2007

    • 著者名/発表者名
      Matsuo, Y.
    • 学会等名
      14th Conference on Functional Genomics of Gram-Positive Microorganisms
    • 発表場所
      Pisa, Italy
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] The GTP-binding protein YqeH is essential for the biogenesis of 30S ribosome subunit in Bacillus subtilis2007

    • 著者名/発表者名
      Loh, P. C.
    • 学会等名
      14th Conference on Functional Genomics of Gram-Positive Microorganisms
    • 発表場所
      Pisa, Italy
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Distribution of Transcription Elongation Factor NusA and GreA in Bacillus subtilis2007

    • 著者名/発表者名
      Kusuya, Y.
    • 学会等名
      14th Conference on Functional Genomics of Gram-Positive Microorganisms
    • 発表場所
      Pisa, Italy
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] In vivo dynamics of the Bacillus subtilis RNA polymerase on the genome2007

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa, S.
    • 学会等名
      14th Conference on Functional Genomics of Gram-Positive Microorganisms
    • 発表場所
      Pisa, Italy
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌の細胞システムのゲノムからの理解2007

    • 著者名/発表者名
      小笠原 直毅
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌の細胞分裂初期にFtsZに直接結合するFtsA、YlmFの分子機能の解析2007

    • 著者名/発表者名
      大藤 仁夢
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌核様体タンパクLhpのChIP-chip解析2007

    • 著者名/発表者名
      中川 隆生
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌核様体タンパク質H-NSの高浸透圧下でのゲノムへの分布と遺伝子発現制御機構の解析2007

    • 著者名/発表者名
      上田 剛士
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌のリン酸飢餓時に発現するグローバル調節因子PhoPの標的部位の網羅的解析2007

    • 著者名/発表者名
      川岸 敏也
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] The GTP-binding protein YqeH participates in the biogenesis of 30S ribosome subunit in Bacillus subtilis.2006

    • 著者名/発表者名
      Loh, P.C., Morimoto, T., Matsuo, Y., Ogasawara, N.
    • 学会等名
      Translational Control
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor, NY USA
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] 枯草菌でシステム生物学(吉川寛、堀寛編, 研究を支えるモデル生物)2009

    • 著者名/発表者名
      小笠原直毅
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] 大腸菌でシステム生物学(吉川寛、堀寛編, 研究を支えるモデル生物)2009

    • 著者名/発表者名
      森浩禎
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] 蛋白質核酸酵素(細菌の細胞分裂の分子メカニズム, 53)2008

    • 著者名/発表者名
      石川周、小笠原直毅
    • 出版者
      共立出版
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] 細胞工学(タイリングチップを用いた細菌ゲノム機能研究の可能性, 25)2006

    • 著者名/発表者名
      大島拓、石川周、黒川顕、小笠原直毅
    • 出版者
      秀潤社
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2018-03-28  

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