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生物の環境適応と感覚受容体の進化

研究課題

研究課題/領域番号 19045010
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関総合研究大学院大学

研究代表者

颯田 葉子  総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 教授 (20222010)

研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
5,600千円 (直接経費: 5,600千円)
2008年度: 2,900千円 (直接経費: 2,900千円)
2007年度: 2,700千円 (直接経費: 2,700千円)
キーワード温度受容体 / 霊長類 / 皮膚 / 遺伝子発現 / 塩基多様度 / 遺伝子系図 / TMRCA / coalescence process / 遺伝子 / ゲノム / 遺伝子発現パターン / 生息環境 / 感覚受容 / 進化 / 機能的制約
研究概要

本年度は以下の3項目について研究を推進した
1) 霊長類皮膚での温度受容体の発現プロフィルの比較 : ヒトの皮膚組織由来のmRNAでTRPV1, 3, 4の他にTRPV2, TRPM2, 4, 5, 8の発現を確認するために、異なるヒト由来の2サンプル(成人と胎児)での発現を比較した。その結果8種類すべての遺伝子の発現が確認された。これらの発現をチンパンジーの皮膚サンプルで調べてみると、発現量の種差は認められるたが、8種類の発現が検出された。さらに同様の遺伝子発現をアカゲザル7個体について調べたところ、発現の個体変異が大きいことがわかった。TRPV2, 3, 4については全ての個体での発現が確認できたが、TRPM5、TRPM8では発現はほとんど検出できない。またTRPV1に関しては、一個体で発現が確認できなかった。
2) 配列決定を進めていた世界各地の民族32個体のTRPV1遺伝子についてexon9と10を含む3.5kbの領域を比較し多型解析をした。この中で、カプサイシンの受容に関わる511番と512番のアミノ酸に変異は認められなかった。面白いことに、この系統関係は160万年ほど前に2分岐し、その一方は現在のアフリカそして他方は、アジア・ヨーロッパのサンプルで保持されている。また、この2分岐はexon9とexon10それぞれのアミノ酸多型と完全にリンクしている。32個体由来のサンプルの塩基多様度は0.4%とヒト集団の平均よりも5倍ほど大きい。おそらくこの2分岐が影響しているものと考えられる。
3) TRPMサブファミリーの起源と機能分化の過程を明らかにするために、現在入手可能なゲノムの塩基配列中で、TRPM1〜8のオーソログを探索した。その結果、TRPMサブファミリーの起源は脊椎動物出現以前にさかのぼるものの各系統でのbirth and deathも頻繁であった。

報告書

(2件)
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (2件) 学会発表 (2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] 感覚分子からみたヒトの進化2007

    • 著者名/発表者名
      颯田葉子
    • 雑誌名

      ファルマシア 43

      ページ: 405-409

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] 五感の遺伝子からみたヒトの進化2007

    • 著者名/発表者名
      郷康広・颯田葉子
    • 雑誌名

      別冊日経サイエンス 157

      ページ: 8-17

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] TRPM6/7における進化的特性の解析2008

    • 著者名/発表者名
      西岡輔、高畑尚之、颯田葉子
    • 学会等名
      日本遺伝学会第80回大会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2008-09-03
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝子-私たちが祖先から受け継いだ遺産2007

    • 著者名/発表者名
      颯田 葉子
    • 学会等名
      第79回日本遺伝学会 公開市民講座
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2007-09-22
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考] 現在Webページを構築・整備中

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2018-03-28  

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