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microRNAの多様性と脊椎動物の系統進化

研究課題

研究課題/領域番号 21770257
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 進化生物学
研究機関神戸大学

研究代表者

日下部 りえ  神戸大学, 大学院・理学研究科, 助教 (70373298)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2010年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2009年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
キーワード機能性RNA / microRNA / ヤツメウナギ / メダカ / 形態進化 / 脊椎動物 / 脊索動物
研究概要

脊椎動物の各系統での小分子機能性RNAの重複の度合いや機能の変遷を解明するため、複数の動物でmicroRNAの同定と機能解析を行った。平成22年度はまず、尾索動物ホヤで筋肉細胞特異的に発現するmiR-1, miR-133について、発現パターンと転写制御機構を解析した。ノザンブロット実験により各成熟型miRの発現を検出したところ、1)miR-133は変態前の胚発生過程において発現するが、miR-1は発現しないこと、2)成体では、miR-133は体壁筋のみに、miR-1は体壁筋と心筋の両方に発現することが明らかになった。さらに、miR-1/miR-133は単一の一次産物として、尾芽胚の筋肉細胞の核に局在し、その発現はmiR-1の上流領域に制御されることが見出された。現在・真骨魚類メダカについても前駆体型から成熟型へのプロセシングについて解析中である。
またヤツメウナギに関し、一個のmiR-1と二個のmiR-133の相同遺伝子を同定し、前駆体の二次構造を予測した。成熟型miR-133についてノザンブロット解析を行ったところ、筋肉の発生過程で発現していた。
以上の知見から、1)miR-1/miR-133は脊索動物の共通祖先においてすでに、遺伝子対としてゲノム上の近傍に位置するようになり、一続きの前駆体として筋肉特異的に産生されるようになったこと、2)脊索動物の共通祖先においてこの遺伝子対は一個しかなかったが、脊椎動物の多様化・複雑化と平行して、そのコピー数を増し、筋肉細胞種ごとに異なる制御を受けるようになったことが示唆された。これらはmicroRNAの多様性と形態進化との関わりに関する先駆的な知見である。

報告書

(2件)
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2011 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (14件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Expression and interaction of muscle-related genes in the lamprey imply the evolutionary scenario for vertebrate skeletal muscle, in association with the acquisition of the neck and fins.2011

    • 著者名/発表者名
      Kusakabe, R., Kuraku, S., Kuratani, S.
    • 雑誌名

      Developmental Biology

      巻: 第350巻 ページ: 217-227

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genomic organization and embryonic expression of miR-430 in medaka (Oryzias latipes) : insights into the post-transcriptional gene regulation in early development.2010

    • 著者名/発表者名
      Tani, S.
    • 雑誌名

      Gene 第449巻第1号

      ページ: 41-49

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Development and Evolution of Muscles : Contractile Proteins, Transcription Factors and microRNAs2011

    • 著者名/発表者名
      Kusakabe, R.
    • 学会等名
      Joint Meeting of the German and Japanese Societies of Developmental Biologists
    • 発表場所
      ドレスデン工科大学(ドイツ)
    • 年月日
      2011-03-24
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Evolution of Complex Skeletal Muscles of Vertebrates : Molecular Evidences from the Cyclostome Lamprey2011

    • 著者名/発表者名
      Kusakabe, R.
    • 学会等名
      The 20^<th> CDB Meeting : Molecular Bases for Evolution of Complex Traits
    • 発表場所
      独立行政法人理化学研究所(兵庫県)
    • 年月日
      2011-02-24
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] カタユウレイボヤ脳胞におけるpiwiの新規機能の解析2010

    • 著者名/発表者名
      島井光太郎
    • 学会等名
      (社)日本動物学会第81回大会
    • 発表場所
      東京大学教養学部駒場キャンパス(東京都)
    • 年月日
      2010-09-23
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] メダカの神経系発生過程におけるmiR-124の機能2010

    • 著者名/発表者名
      加藤裕美子
    • 学会等名
      (社)日本動物学会第81回大会
    • 発表場所
      東京大学教養学部駒場キャンパス(東京都)
    • 年月日
      2010-09-23
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Evolution of vertebrate skeletal myogenesis : insights from the cyclostome lamprey.2010

    • 著者名/発表者名
      Kusakabe, R.
    • 学会等名
      2010 SDB-JSDB Joint Meeting
    • 発表場所
      Convention Center, Albuquerque, New Mexico,(USA)
    • 年月日
      2010-08-05
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 脊椎動物の筋肉発生制御機構と進化2010

    • 著者名/発表者名
      日下部りえ
    • 学会等名
      第5回メダカセミナー
    • 発表場所
      京都大学農学部(京都府)(招待講演)
    • 年月日
      2010-07-30
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Evolution of Myogenesis : Insights from the Lamprey2010

    • 著者名/発表者名
      Kusakabe, R.
    • 学会等名
      The BRH Seminar "Evolution & Diversity of Fishes"
    • 発表場所
      JT生命誌研究館(大阪府)(招待講演)
    • 年月日
      2010-06-24
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Genomic organization, expression and evolution of muscle specific microRNAs2010

    • 著者名/発表者名
      日下部りえ
    • 学会等名
      The 19th CDB Meeting-RNA Sciences in Cell and Developmental Biology
    • 発表場所
      独立行政法人理化学研究所(兵庫県)
    • 年月日
      2010-05-10
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 脊索動物microRNAの発生過程における発現と進化2010

    • 著者名/発表者名
      日下部りえ
    • 学会等名
      第1回甲南大学 モレキュラーサイエンスワークショップ
    • 発表場所
      甲南大学(兵庫県)
    • 年月日
      2010-03-04
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] microRNAの多様性と脊椎動物の進化2010

    • 著者名/発表者名
      日下部りえ
    • 学会等名
      第3回甲南大学生物学科シンポジウム
    • 発表場所
      甲南大学(兵庫県)
    • 年月日
      2010-01-13
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Embryonic expression and function of miR-430 in medakaメダカ初期胚におけるmiR-430の発現と機能2009

    • 著者名/発表者名
      谷沙織
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      2009-12-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 筋肉ではたらくmicroRNAの機能と進化2009

    • 著者名/発表者名
      日下部りえ
    • 学会等名
      第15回小型魚類研究会
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)
    • 年月日
      2009-09-13
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Evolution of vertebrate myogenesis, with special reference to the morphological variety of skeletal muscles2009

    • 著者名/発表者名
      Kusakabe, R.
    • 学会等名
      International Society for Developmental Biology
    • 発表場所
      エジンバラ(英国)
    • 年月日
      2009-09-06
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Evolution and developmental expression of chordate microRNAs2009

    • 著者名/発表者名
      Kusakabe, R.
    • 学会等名
      日本発生生物学会第42回大会
    • 発表場所
      新潟コンベンションセンター朱鷺メッセ(新潟県)
    • 年月日
      2009-05-30
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [図書] Medaka-Biology, Management, and Experimental Protocols2009

    • 著者名/発表者名
      Kinoshita, M.
    • 総ページ数
      419
    • 出版者
      Wiley-Blackwell
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.research.kobe-u.ac.jp/fsci-rna/

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.research.kobe-u.ac.jp/fsci-rna/

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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