インフルエンザウイルスの抗原変異に伴う立体構造変化の解析

• 研究課題/領域番号: 21780272
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 応用獣医学
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 五十嵐 学 北海道大学, 人獣共通感染症サーチセンター, 特任助教 (10374240)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• 研究課題ステータス: 完了 (2010年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2010年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2009年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
• キーワード: 人畜共通感染症 / インフルエンザ / ウイルス / 感染症 / 生体生命情報学 / 計算科学 / 分子シミュレーション / 糖鎖 / 蛋白質

研究概要

インフルエンザの流行を効率よく制御するためには、抗原変異の機序を理解し、予測することが必要である。本研究では、インフルエンザウイルスの主要抗原であるヘマグルチニン(HA)の立体構造に焦点をあて、構造バイオインフォマティクス的手法により、抗原変異に伴うHAの抗原構造の変遷を解析した。また結果に基づき、パンデミック2009(H1N1)ウイルスの抗原変異に伴う今後のアミノ酸置換を予測した。

研究成果

• [雑誌論文] Characterization of influenza A viruses isolated from wild waterfowls in Zambia (2011)
  • 著者名/発表者名: Simulundu E, Ishii A, Igarashi M, Mweene A, Suzuki Y, Hang'ombe B, Namangala B, Moonga L, Manzoor R, Ito K, Nakamura I, Sawa H, Sugimoto C, Kida H, Simukonda C, Chansa W, Chulu J, Takada A
  • 雑誌名: J Gen Virol. in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of viral envelope GP2 in Ebola virus entry into cells expressing the macrophage galactose-type C-type lectin. (2011)
  • 著者名/発表者名: Usami K, Matsuno K, Igarashi M, Denda-Nagai K, Takada A, Irimura T
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 407 ページ: 74-78
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prediction of the antigenic changes of the pandemic (H1N1) 2009 influenza virus hemagglutinin. (2011)
  • 著者名/発表者名: Igarashi M, Ito K, Yoshida R, Tomabechi D, Kida H, Takada A
  • 雑誌名: Influenza and other respiratory viruses 5(supple.1) ページ: 402-404
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic characterization and susceptibility on poultry and mammal of H7N6 subtype avian influenza virus isolated in Japan in 2009. (2011)
  • 著者名/発表者名: Uchida Y, Kanehira K, Mase M, Takemae N, Watanabe C, Ito T, Igarashi M, Ito K, Takada A, Sakoda Y, Okamatsu M, Yamamoto Y, Nakamura K, Kida H, Hiromoto Y, Tsuda T, Saito T
  • 雑誌名: Vet Microbiol. 147(1-2) ページ: 1-10
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic characterization and susceptibility on poultry and mammal of H7N6 subtype avian influenza virus isolated in Japan in 2009 (2011)
  • 著者名/発表者名: Uchida Y, Kanehira K, Mass M, Takemae N, Watanabe C, Ito T, Igarashi M, Ito K, Takada A, Sakoda Y, Okamatsu M, Yamamoto Y, Nakamura K, Kida H, Hiromoto Y, Tsuda T, Saito T
  • 雑誌名: Vet Microbiol. 巻: 147(1-2) ページ: 1-10
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of viral envelope GP2 in Ebola virus entry into cells expressing the macrophage galactose-type C-type lectin (2011)
  • 著者名/発表者名: Usami K, Matsuno K, Igarashi M, Denda-Nagai K, Takada A, Irimura T
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 巻: (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of influenza A viruses isolated from wild waterfowls in Zambia (2011)
  • 著者名/発表者名: Simulundu E, Ishii A, Igarashi M, Mweene A, Suzuki Y, Hang'ombe B, Namangala B, Moonga L, Manzoor R, Ito K, Nakamura I, Sawa H, Sugimoto C, Kida H, Simukonda C, Chansa W, Chulu J, Takada A
  • 雑誌名: J Gen Virol 巻: (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Construction of an infectious cDNA clone for Omsk Hemorrhagic fever virus, and characterization of mutations in NS2A and NS5. (2010)
  • 著者名/発表者名: Yoshii K, Igarashi M, Ito K, Kariwa H, Holbrook MR, Takashima I
  • 雑誌名: Virus Research 155(1) ページ: 61-68
  • NAID: 120002834769
  • 査読あり
• [雑誌論文] Enzyme-linked immunosorbent assay for the detection of filovirus species-specific antibodies. (2010)
  • 著者名/発表者名: Nakayama E, Yokoyama A, Miyamoto H, Igarashi M, Kishida N, Matsuno K, Marzi A, Feldmann H, Ito K, Saijo M, Takada A
  • 雑誌名: Clinical and Vaccine Immunology 17(11) ページ: 1723-1728
  • NAID: 120002973852
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transcellular transport of West Nile virus-like particles across human endothelial cells depends on residues 156 and 159 of envelope protein. (2010)
  • 著者名/発表者名: Hasebe R, Suzuki T, Makino Y, Igarashi M, Yamanouchi S, Maeda A, Horiuchi M, Sawa H, Kimura T
  • 雑誌名: BMC Microbiol. 10(1) ページ: 165-165
  • NAID: 120002261736
  • 査読あり
• [雑誌論文] J.Virol. (2010)
  • 著者名/発表者名: Matsuno K, Kishida N, Usami K, Igarashi M, Yoshida R, Nakayama E, Shimojima M, Feldmann H, Irimura T, Kawaoka Y, Takada A
  • 雑誌名: Different potential of C-type lectin-mediated entry between Marburg virus strains. 84(10) ページ: 5140-5147
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel copper(II) coordination at His186 in full-length murine prion protein. (2010)
  • 著者名/発表者名: Watanabe Y, Hiraoka W, Igarashi M, Ito K, Shimoyama Y, Horiutchi M, Yamamori T, Yasui H, Kuwabara M, Inagaki F, Inanam O
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 394(3) ページ: 522-528
  • NAID: 120002148672
  • 査読あり
• [雑誌論文] Predicting the Antigenic Structure of the Pandemic (H1N1) 2009 Influenza Virus Hemagglutinin. (2010)
  • 著者名/発表者名: Igarashi M, Ito K, Yoshida R, Tomabechi D, Kida H, Takada A
  • 雑誌名: PLoS One 5(1)
  • NAID: 120001804925
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transcellular transport of West Nile virus-like particles across human endothelial cells depends on residues 156 and 159 of envelope protein (2010)
  • 著者名/発表者名: Hasebe R, Suzuki T, Makino Y, Igarashi M, Yamanouchi S, Maeda A, Horiuchi M, Sawa H, Kimura T
  • 雑誌名: BMC Microbiol 巻: 10(1) ページ: 165-165
  • NAID: 120002261736
  • 査読あり
• [雑誌論文] Enzyme-linked immunosorbent assay for the detection of filovirus species-specific antibodies (2010)
  • 著者名/発表者名: Nakayama E, Yokoyama A, Miyamoto H, Igarashi M, Kishida N, Matsuno K, Marzi A, Feldmann H, Ito K, Saijo M, Takada A
  • 雑誌名: Clinical and Vaccine Immunology 巻: 17(11) ページ: 1723-1728
  • NAID: 120002973852
  • 査読あり
• [雑誌論文] Construction of an infectious cDNA clone for Omsk Hemorrhagic fever virus, and characterization of mutations in NS2A and NS5 (2010)
  • 著者名/発表者名: Yoshii K, Igarashi M, Ito K, Kariwa H, Holbrook MR, Takashima I
  • 雑誌名: Virus Research 巻: 155(1) ページ: 61-68
  • NAID: 120002834769
  • 査読あり
• [雑誌論文] Predicting the Antigenic Structure of the Pandemic(H1N1)2009 Influenza Virus Hemagglutinin (2010)
  • 著者名/発表者名: Manabu Igarashi, Kimihito Ito, Reiko Yoshida, Daisuke Tomabechi, Hiroshi Kida, Ayato Takada
  • 雑誌名: PLoS One 5(1)
  • NAID: 120001804925
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel copper(II)coordination at His186 in full-length murine prion protein (2010)
  • 著者名/発表者名: Yasuko Watanabe, Wakako Hiraoka, Manabu Igarashi, Kimihito Ito, Yuhei Shimoyama, Motohiro Horiutchi, Tohru Yamamori, Hironobu Yasui, Mikinori Kuwabara, Fuyuhiko Inagaki, Osamu Inanam
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun (in press)
  • NAID: 120002148672
  • 査読あり
• [雑誌論文] Different potential of C-type lectin-mediated entry between Marburg virus strains (2010)
  • 著者名/発表者名: Keita Matsuno, Noriko Kishida, Katsuaki Usami, Manabu Igarashi, Reiko Yoshida, Eri Nakayama, Masayuki Shimojima, Heinz Feldmann, Tatsuro Irimura, Yoshihiro Kawaoka, Ayato Takada
  • 雑誌名: J.Virol (in press)
  • 査読あり
• [学会発表] パンデミックインフルエンザAウイルス(H1N1)ヘマグルチニンに対するモノクローナル抗体の性状解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉田玲子, 他
  • 学会等名: 第58回日本ウイルス学術集会
  • 発表場所: 徳島(徳島県郷土文化会館)
  • 年月日: 2010-10-08
• [学会発表] フィロウイルス種特異抗体検出ELISA法の開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中山絵里, 他
  • 学会等名: 第58回日本ウイルス学術集会
  • 発表場所: 徳島(徳島県郷土文化会館)
  • 年月日: 2010-10-08
• [学会発表] H3N2インフルエンザウイルスHAに付加された糖鎖は周辺エピトープを覆い隠していたか?～糖鎖付加部位周辺アミノ酸残基の多様性変化の解析～ (2010)
  • 著者名/発表者名: 五十嵐学, 他
  • 学会等名: 第58回日本ウイルス学術集会
  • 発表場所: 徳島(徳島県郷土文化会館)
  • 年月日: 2010-10-08
• [学会発表] パンデミックインフルエンザA ウイルス(H1N1)ヘマグルチニンに対するモノクローナル抗体の性状解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉田玲子、苫米地大輔、五十嵐学、宮本洋子、加瀬哲男、喜田宏、高田礼人
  • 学会等名: 第58回日本ウイルス学術集会
  • 発表場所: 徳島(徳島県郷土文化会館)
  • 年月日: 2010-10-08
• [学会発表] Prediction of the Antigenic Change of the Pandemic (H1N1) 2009 Influenza Virus Hemagglutinin (2010)
  • 著者名/発表者名: Igarashi M, 他
  • 学会等名: Options for the Control of Influenza VII
  • 発表場所: China (Hong Kong SAR)
  • 年月日: 2010-09-06
• [学会発表] Prediction of Antigenic Structure of Hemagglutinin of Pandemic (H1N1) 2009 Influenza Virus (2010)
  • 著者名/発表者名: Ito K, 他
  • 学会等名: 14th International Negative Strand Virus Meeting
  • 発表場所: Belgium (Bruges)
  • 年月日: 2010-06-23
• [学会発表] インフルエンザウイルスの抗原変異予測と亜型間交差感染防御 (2010)
  • 著者名/発表者名: 高田礼人, 他
  • 学会等名: 日本薬学会第130年会
  • 発表場所: 岡山(就実大学)
  • 年月日: 2010-03-28
• [学会発表] ホモロジーモデリング法による新型H1N1インフルエンザウイルスのヘマグルチニンの抗原構造の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 五十嵐学, 他
  • 学会等名: 第57回日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 東京(都市センターホテル)
  • 年月日: 2009-10-26
• [学会発表] インフルエンザウイルスのヘマグルチニンのMDS解析と変異予測への応用 (2009)
  • 著者名/発表者名: 伊藤公人, 他
  • 学会等名: 第57回日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 東京(都市センターホテル)
  • 年月日: 2009-10-26
• [学会発表] 愛知県でウズラから分離されたH7N6亜型鳥インフルエンザウイルスの遺伝子解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 内田裕子, 他
  • 学会等名: 第57回日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 東京(都市センターホテル)
  • 年月日: 2009-10-26
• [学会発表] MGL/CD301を介するエボラウイルス感染増強に関わる表層糖蛋白質の構造的特徴 (2009)
  • 著者名/発表者名: 宇佐美克明, 他
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸(ポートアイランド)
  • 年月日: 2009-10-24
• [学会発表] マウスプリオンタンパク質ヒスチジン186周辺の銅イオン結合部位に関する構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 稲波修, 他
  • 学会等名: 第148回日本獣医学会学術集会
  • 発表場所: 鳥取(とりぎん文化会館)
  • 年月日: 2009-09-25
• [学会発表] インフルエンザウイルスのヘマグルチニンの進化解析と変異予測への応用 (2009)
  • 著者名/発表者名: 伊藤公人, 他
  • 学会等名: 第11回日本進化学会大会
  • 発表場所: 札幌(北海道大学)
  • 年月日: 2009-09-03
• [学会発表] インフルエンザウイルスヘマグルチニンの糖鎖付加ポテンシャルの予測 (2009)
  • 著者名/発表者名: 五十嵐学, 他
  • 学会等名: 第23回インフルエンザ研究者交流の会シンポジウム
  • 発表場所: 東京(東京大学医科学研究所)
  • 年月日: 2009-07-03
• [学会発表] インフルエンザウイルスHA亜型間交差中和活性を有するモノクローナル抗体 (2009)
  • 著者名/発表者名: 吉田玲子, 他
  • 学会等名: 第23回インフルエンザ研究者交流の会シンポジウム
  • 発表場所: 東京(東京大学医科学研究所)
  • 年月日: 2009-07-03