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機械学習に基づく新しい創薬インフォマティクス-医薬品化合物の分子設計

研究課題

研究課題/領域番号 25540015
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 統計科学
研究機関統計数理研究所

研究代表者

吉田 亮  統計数理研究所, モデリング研究系, 准教授 (70401263)

研究分担者 伊庭 幸人  統計数理研究所, モデリング研究系, 教授 (30213200)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2014年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2013年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワード化学情報学 / 創薬 / 分子設計 / ベイズ統計 / カーネル法 / マルコフ連鎖モンテカルロ法
研究成果の概要

医薬分子の設計は、約10~60個の化合物からなる広大な化合物空間から新薬候補分子を発掘する作業である。研究の目的は、ベイズ統計および機械学習を基盤とする分子設計手法の開発である。(1)実験データを活用して化学構造から性質(物性や薬理活性)のフォーワード予測モデルを構築し、(2)フォーワードモデルをベイズ則で反転し、性質から構造のバックワード予測(事後分布)を導く。事後分布から化学構造を生成し、目的の性質を有する埋蔵分子を発掘する。データサイエンスの発想に基づく新たな分子設計手法を開発し、医薬品化合物の分子設計に適用して、その潜在的有用性を実証した。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 4件)

  • [雑誌論文] Atom Environment Kernels on Molecules2014

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Yamashita, Tomoyuki Higuchi, Ryo Yoshida
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Information and Modeling

      巻: 未定 号: 5 ページ: 1289-1300

    • DOI

      10.1021/ci400403w

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書 2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ライフサイエンス分野におけるベイズ統計の先端応用2015

    • 著者名/発表者名
      吉田亮
    • 学会等名
      バイオスーパーコンピューティング研究会 ウィンタースクール2015
    • 発表場所
      愛知県休暇村伊良湖
    • 年月日
      2015-01-30 – 2015-01-31
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ライフサイエンスにおけるベイズ統計学の戦略的応用分野の開拓

    • 著者名/発表者名
      吉田亮
    • 学会等名
      第一回腫瘍分子生物学・生命情報共同セミナー
    • 発表場所
      金沢大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ベイズ統計学入門:システムズバイオロジー、分子設計、バイオイメージングの応用例を中心に

    • 著者名/発表者名
      吉田亮
    • 学会等名
      第23回大阪大学生命機能数理モデル検討会
    • 発表場所
      大阪大学免疫学フロンティア研究センター
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ベイズ統計学とバイオサイエンスの協働

    • 著者名/発表者名
      吉田亮
    • 学会等名
      JST・CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」第2回領域会議 産総研セミナー・数理デザイン道場
    • 発表場所
      日本科学未来館
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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