KAKEN — 研究課題をさがす | 研究者番号: 10437262

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1. 遺伝的素因、生活習慣、腸内細菌叢の多面的解析に基づく前立腺癌の早期診断戦略の構築

研究課題

研究種目	基盤研究(B)
審査区分	小区分56030:泌尿器科学関連
研究機関	大阪大学
研究代表者	野々村祝夫大阪大学, 大学院医学系研究科, 教授
研究期間 (年度)	2022-04-01 – 2026-03-31交付
キーワード	prostate cancer / microbiome / life style / metabolome analysis / short chain fatty acid / metagenome analysis / lifestyle / GWAS / 前立腺癌 / 腸内細菌 / メタゲノム解析 / メタボローム解析
研究開始時の研究の概要	腸内細菌叢解析から得られたメタボローム解析結果における男性ホルモン様物質産生細菌の同定と、男性ホルモン様物質が本当に前立腺癌の増殖に促進的に作用するのかどうかの検証をin vitro, in vivoの実験系で行う。その他の代謝産物に関しても検討する。
研究実績の概要	ショットガン解析では前立腺生検で陰性であった58名と前立腺癌と診断された104名の合計162名の直腸診時の便スワブよりDNAを抽出し、ショットガン解析を行った。その結果前立腺癌と統計学的に有意に関係のある特定の細菌は認めなかった。また特定の遺伝子も認めなかった。一方Gene Set Enrichme ...
現在までの達成度 (区分)	2: おおむね順調に進展している

この課題の研究成果物	雑誌論文 (10件うち査読あり 10件、オープンアクセス 3件) 学会発表 (14件うち招待講演 2件)

2. 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

研究課題

研究種目	学術変革領域研究(学術研究支援基盤形成)
研究機関	国立遺伝学研究所
研究代表者	黒川顕国立遺伝学研究所, 情報研究系, 教授
研究期間 (年度)	2022-04-01 – 2028-03-31交付
キーワード	ゲノム / メタゲノム / オミックス解析 / シングルセル解析 / バイオインフォマティクス / 次世代シーケンサー / ゲノム・メタゲノム / RNA解析 / エピゲノム / 空間的オミックス解析 / スーパーコンピュータ
研究開始時の研究の概要	先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム（略称「先進ゲノム支援」）は、1)先端技術開発と試行部分での支援の重点化、2)シーケンシングから情報解析までを一体化、3)次世代型の解析に対応した情報解析支援の拡充、を基本として、実験・情報解析の両面での大規模かつ最先端の解析システムを整備し、科研費課題等から適 ...
研究実績の概要	①総括支援活動では支援課題の公募を実施し生命系のほぼ全分科から合計347件の応募がありそのうち148課題を採択した。今年度の応募数は、同じく年1回公募だった昨年度を24件上回った。一方で採択率は、先進ゲノム支援として初めて50%超を実現した昨年度を下回り、第1期先進ゲノム支援の時と同様の 42.7% ...
現在までの達成度 (区分)	2: おおむね順調に進展している

この課題の研究成果物	国際共同研究 (12件) 雑誌論文 (382件うち国際共著 72件、査読あり 348件、オープンアクセス 289件) 学会発表 (820件うち国際学会 226件、招待講演 285件) 図書 (15件) 備考 (9件) 産業財産権 (7件うち外国 1件) 学会・シンポジウム開催 (1件)

3. 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

研究課題

研究種目	新学術領域研究（研究領域提案型）『学術研究支援基盤形成』
研究機関	国立遺伝学研究所
研究代表者	小原雄治情報・システム研究機構国立遺伝学研究所先端ゲノミクス推進センター, 特任教授
研究期間 (年度)	2016 – 2021完了
キーワード	次世代DNAシーケンサー / 新規ゲノム配列決定 / リシーケンシング / エピゲノム / RNA-Seq / 1細胞解析 / メタゲノム解析 / スーパーコンピューター / ゲノムアッセンブル / ゲノム多型 / メタゲノム / ゲノムアノテーション
研究成果の概要	科研費採択課題を対象に毎年支援公募を行い、新規ゲノム解読、変異解析、エピゲノム解析、RNA解析、メタゲノム解析、1細胞解析など最先端のゲノム解析技術を支援した。総数1,988の応募があり912が支援課題となった。生命科学のほぼすべての分野をカバーし、理工系や環境系などにも広がった。成果論文も順調に増 ...

この課題の研究成果物	国際共同研究 (36件) 雑誌論文 (761件うち国際共著 195件、査読あり 738件、オープンアクセス 595件) 学会発表 (1760件うち国際学会 491件、招待講演 614件) 図書 (78件) 備考 (107件) 産業財産権 (6件うち外国 3件) 学会・シンポジウム開催 (2件)

4. メタゲノム解析による切迫早産例、子宮内膜症例における腟内ならびに腸内細菌叢の解析

研究課題

研究種目	挑戦的萌芽研究
研究分野	産婦人科学
研究機関	富山大学
研究代表者	齋藤滋富山大学, 大学院医学薬学研究部(医学), 教授
研究期間 (年度)	2014-04-01 – 2017-03-31完了
キーワード	腸内細菌叢 / 早産 / 子宮内膜症 / 炎症性疾患 / 産科学 / 生殖医学
研究成果の概要	早産ならびに子宮内膜炎は炎症性疾患である。最近の研究により炎症性疾患では腸内細菌叢が変化し炎症を惹起させることが判ってきた。そこで両疾患の腸内細菌叢をメタゲノム解析した。群間比較では有意な変化を示すgenus/speciesは検出できなかったが、早産例でEscherichia/Shigellaが多い ...

この課題の研究成果物	雑誌論文 (25件うち国際共著 2件、査読あり 17件、謝辞記載あり 2件) 学会発表 (17件うち国際学会 3件、招待講演 15件)

5. ヒト腸内細菌叢代謝機構の解明

研究課題

研究種目	若手研究(A)
研究分野	ゲノム生物学
研究機関	東京工業大学
研究代表者	山田拓司東京工業大学, 生命理工学研究科, 講師
研究期間 (年度)	2013-04-01 – 2016-03-31完了
キーワード	バイオインフォマティクス / メタゲノミクス / ヒト腸内細菌 / データベース / 腸内細菌 / メタゲノム / 代謝ネットワーク
研究成果の概要	腸内代謝経路データベースの基盤構築、及び代謝経路中における遺伝子未知の反応に対する遺伝子予測ツールを構築することができた。特に腸内代謝経路データベースは詳細な文献調査にもとづいて構築されており、これまで登録されている既知の反応情報と比較して、その２倍以上の反応経路を本研究によりデータ化している。また ...

この課題の研究成果物	国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (3件うち国際共著 2件、査読あり 3件、オープンアクセス 2件、謝辞記載あり 2件) 学会発表 (7件うち国際学会 2件、招待講演 7件)

6. 真菌類ゲノムからの新規酵素遺伝子発見

公募研究

研究種目	新学術領域研究(研究領域提案型)
審査区分	理工系
研究機関	東京工業大学
研究代表者	山田拓司東京工業大学, 生命理工学研究科, 講師
研究期間 (年度)	2013-04-01 – 2015-03-31完了
キーワード	遺伝子予測 / 酵素 / 応用微生物 / バイオインフォマティクス
研究実績の概要	本研究では真菌類ゲノムを用いて、遺伝子が未定義の酵素反応に対する遺伝子配列を明らかにしていくことを目的としている。代表者らは先行研究において、微生物ゲノムを用い100種類以上の遺伝子未知酵素反応について対応する遺伝子を計算機的に予測し、2例については実験的にその酵素活性を実証している。真核生物に関し ...
研究領域	生合成マシナリー：生物活性物質構造多様性創出システムの解明と制御

この課題の研究成果物	雑誌論文 (1件うち査読あり 1件、オープンアクセス 1件)