• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

構造生物学によるミトコンドリア翻訳装置の構築原理の解明

研究課題

研究課題/領域番号 11308024
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関東京大学

研究代表者

渡辺 公綱  東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 教授 (00134502)

研究分担者 大槻 高史  東京大学, 大学院・工学系研究科, 助手 (80321735)
鈴木 勉  東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 講師 (20292782)
研究期間 (年度) 1999 – 2001
研究課題ステータス 完了 (2001年度)
配分額 *注記
34,720千円 (直接経費: 32,800千円、間接経費: 1,920千円)
2001年度: 8,320千円 (直接経費: 6,400千円、間接経費: 1,920千円)
2000年度: 8,000千円 (直接経費: 8,000千円)
1999年度: 18,400千円 (直接経費: 18,400千円)
キーワード翻訳システム / ミトコンドリア / EF-Tu / tRNA / セリルtRNAシンテターゼ / 線虫 / リボソーム / X線解析 / in vitro翻訳システム / tRNA^<Ser>GCU / tRNA^<Ser>UGA / セリルtRNAシンテータゼ / X線構造解析 / 機能構造 / ミトコンドリアtRNA / トランスホルミラーゼ / リボソーム蛋白質 / X線結晶解析 / SerRS / 異常構造 / リボソームタンパク質
研究概要

本研究の目標は、現存する生物のうちでもっとも単純と思われる、動物ミトコンドリアの特異な翻訳システムにおける個々の装置の機能特性と構造的な異常性に焦点を当て、それらの機能構造の詳細な解析と実行可能なものからその立体構造を解明し、機能発現に必要な構造を探ることをにより、ミトコンドリア翻訳システムの構築原理を解明することである。主たる研究成果は以下の通りである。(1)ウシ・ミトコンドリアのin vitro翻訳システムを構築し、系の最適化を計った結果、ポリ(U)依存ポリ(Phe)合成で大腸菌のものと比肩し得る活性を示す系を確立した。(2)tRNAと翻訳因子をセットにする限り、またL7/L12蛋白質のみ大腸菌由来のものを使う限り、大腸菌とミトコンドリア・リボソームに互換性があるので、本質的にリボソーム機能は両者で等価である。(3)異常な2次構造をもつ2種類のセリンtRNAが低いながらも翻訳機能をもつことを実証した。特に片腕を欠くtRNAの効率の低さはA部位への結合に欠陥のあるためであった。(4)これら2種類のセリンtRNAは単一のセリルtRNAシンテターゼ(SeRRS)でアミノアシル化されることを明らかにし、その認識部位を特定した。(5)線虫ミトコンドリアに存在する大部分のTアーム欠損tRNAを認識する特殊なEF-Tuを発見した。それはC末端に57アミノ酸の延長部をもち、それが欠けたTアーム部分を補完していた。また2種類のDアーム欠損セリンtRNAに対応する別のEF-Tuはアミノ酸部分をも認識していた。(6)これらの翻訳因子の結晶化を行い、SerRSでは針状結晶を得た。tRNA-EF-Tu複合体の結晶化とともに、これらのX線解析を行う。

報告書

(4件)
  • 2001 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2000 実績報告書
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (36件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (36件)

  • [文献書誌] Hanada, T., Watanabe, K et al.: "Translation ability of mitochondrial tRNA_s^<ser> with unusual structures in an in vitro ・・・"Genes to Cells. 6. 1019-1030 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuko T., Watanabe K. et al.: "Structural compensation for deficut of rRNA with proteins in memmalian mitochondrial netosome"J. Biol. Chem. 276. 21724-21736 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yokogawa, T., Watanabe K. et al.: "Characterization and tRNA recognition of mammolian mitochondrial seryl-tRNA synthetase"J. Biol. chem. 275. 19913-19920 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ohtsuki, T., Watanabe K. et al.: "An "Elongated" Tranlction Elongation Factor Tu for Truncated tRNA in Nemasode Mitochondria"J. Biol. Chem.. 276. 21571-21577 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Takeuchi, N., Watanabe K. et al.: "Recognition of tRNAs by methionyl tRNA trans-formylase from mommalian Mitochondria"J. Biol. Chem.. 276. 20064-20068 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki T., Watanabe, K. et al.: "Proteomic analysis of the mammalian mitochendrial Ritaosome"J. Biol. Chem.. 276. 33181-33195 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 渡辺公綱, 鈴木勉(分担): "志村, 渡辺編「RNA研究の最前線」"シュプリンガーフェアラーク東京. 238 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki, Ts., Suzuki, Ta., Ueda, T., and Watanabe, K.: "High sensitive analysis of modified nucleosides by LC/MS using ESI/Iontrap mass spectrometry"J. Mass Spectrom. Soc. Jpn.. 47. 168-176 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yokogawa, T., Shimada, N., Takeuchi, N., Ueda, T., Nishikawa, K., Spremulli, L., and Watanabe K.: "Characterization and tRNA recognition of mammalian mitochondrial Seryl tRNA synthetase"J. Biol. Chem.. 275. 19913-19920 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki, T., Terasaki, M., Takemoto-Hori, C., Hanada, T., Ueda, T., Wada, A., and Watanabe, K.: "Structural compensation for deficit of rRNA with proteins in mammalian mitochondrial ribosome; systematic analysis of protein components of the large ribosomal subunit from mammalian mitochondria"J. Biol. Chem.. 276. 21724-21736 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki, T., Terasaki, M., Takemoto-Hori, C., Hanada, T., Ueda, T., Wada, A. and Watanabe, K.: "Proteomic Analysis of the Mammalian Mitochondrial Ribosome; Identification of protein components in the 28S Small Subunit"J. Biol. Chem.. 276. 33181-33195 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shimada, N., Suzuki, T. and Watanabe, K.: "Dual mode recognition of two isoacceptor tRNAs by mammalian mitochondrial seryl-tRNA synthetase (2001)"J. Biol Chem.. 276. 46770-46778 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hanada, T., Suzuki, T., Yokogawa, T., Takemoto-Hori, C., Sprinzl, M. and Watanabe, K.: "Translation ability of mitochondrial tRNAs^<Ser> with unusual secondary structures in an in vitro translation system of bovine mitochondria"Genes Cells. 6. 1019-1030 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ohtsuki, T., Watanabe, Y., Takemoto, C., Kawai, G., Ueda, T., Kita, K., Kojima, S., Kaziro, Y., Nyborg, J and Watanabe, K.: "An "Elongated" Translation Elongation Factor Tu for Truncated tRNAs in Nematode Mitochondria"J. Biol. Chem.. 276. 21571-21577 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Takeuchi, N., Vial, L., Panvert, M., Schmidt, E., Watanabe K., mechulam Y. and Blanquet, S.: "Recognition of tRNAs by Methionyl-tRNA Transformylase from mammalian Mitochondria"J. Biol. Chem.. 276. 20064-20068 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ohtsuki, T., Watanabe K. et al.: "An "elongated" translation elongation factor Tm for truncated tRNAs in rametode mitocondoria"J. Biol. Chem.. 276. 21571-21577 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Suzuki, T., Watanabe K. et al.: "Structural Compensation for the Deficit of rRNA with Proteins in the Mammalian Mitochondrial ribosome"J. Biol. Chem.. 276. 21724-21736 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Suzuki, T., Watanabe K. et al.: "Proteinic analysis of the mammalian int ribosome"J. Biol. Chem.. 276. 331185-33195 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Yasukawa, T., Watanabe K. et al.: "Wobble modification defect disturbs codon-anticodon in teraction in a mitochondrial disease"EMBO J.. 20. 4794-4802 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Hanada, H., Suzuki, T., Watanabe K. et al.: "Translation ability of mt tRNAs^<Ser> with unusual secondary structures in an in vitro translation"Genes to Cells. 6. 1019-1030 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Saito, H., Watanabe, K., Suga, H: "Concurrent molecular recognition of the amino acid and tRNA by a ribozyme"RNA. 7. 1867-1878 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] 志村, 渡辺共編: "RNA研究の最前線"スプリングフェアラーク東京. 238 (2000)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Suzuki,T. et al.: "Structural compensation for deficit of tRNA with proteins in mammalian mitochondrial ribosome"J.Biol.Chem.. (印刷中). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Yokobori,S.,Suzuki,T.and Watanabe,K.: "Evolution of Genetic code : tRNA as a major determinant of Genetic code plasticity"J.Med.Evol. (印刷中). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Tin,O.F. et al.: "Proteolytic fragmentation of polypeptide release factor 1 of Thermus thermophilus and crystallization of the stable fragments."Biochimie. 82. 765-772 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Yasukawa,T. et al.: "A pathogenic point mutation reduce stability of mitochondrial mutant tRNA^<Ile>"Nucleic Acids Res.. 28・19. 3779-3784 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Tomari,Y. et al: "The Role of tightly bound ATP in Escherichia coli tRNA nucleotidyltransferase"Genes to Cells. 5. 689-698 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Tomita, K. et al.: "A cytotoxic ribonuclease which specifically cleaved four isoaccepting arginine tRNAs at their anticodon loops"Proc.Natl.Acad.Sci.,USA. 97・15. 8278-8283 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 吉村令郎,渡辺公綱 共編: "RNA研究の最前線"シュブリンガーフェアラーク東京. 238 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Yasukawa T. et al.: "Defect in modification at the anticodon wobble nucleotide of mitochondrial tRNA^<Lys> with the MERRF emcephalomyopathy"FEBS Letters. 467. 175-178 (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Yasukawa T. et al.: "Modification defect at anticodon wobble nucleotide of mitocondrial tRNAs^<Len>(UOR) with pathogenic mutation"J. Biol. Chem.. 275. 4251-4257 (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Tomita,K. et al.: "Codon reading patterns in prosephila melanogaster mitochondria based on theier tRNA sequences ; a unique wobble rule"Nucleic Acido Res.. 2721. 4291-4297 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Yokobori S. et al.: "Complete DNA sequence of the mitochondrial genome of the ascidian Halocynthia roretzi"Genetics. 153. 1851-1862 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Kondou A. et al.: "An extra tRNA^<Gly>(V^*CU) found in ascidian mitochondria responsible for decoding non-universal codons AGA/AGG as Gly"Nucleic Acido Res.. 2T12. 2554-2559 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Ogawa T. et al.: "A cytotoxic ribronuclease targetting specific transfer RNA anticodons"Science. 283. 2097-2100 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Editor in Chief T. Creighton (分担): "The Encyclo pedia of Molecular Biology"WILEY. 3500 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書

URL: 

公開日: 1999-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi