• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

地球生物圏フロンティア(深海底と地底)の微生物相-分類と生態

研究課題

研究課題/領域番号 11833012
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究機関広島大学

研究代表者

長沼 毅  広島大学, 生物生産学部, 助教授 (70263738)

研究分担者 岩月 輝希  核燃料サイクル開発機構, 東濃地科学センター, 研究員
河野 憲治  広島大学, 生物生産学部, 助教授 (50034476)
研究期間 (年度) 1999 – 2000
研究課題ステータス 完了 (2000年度)
配分額 *注記
3,500千円 (直接経費: 3,500千円)
2000年度: 1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
1999年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
キーワード深海微生物 / 地下生物圏 / 地底微生物 / 16S rRNA遺伝子 / 系統分類 / 炭酸固定 / RuBisCO / 硫酸還元 / 深海底 / 海底深部 / 微生物 / 地下水
研究概要

本研究では,深海底と地底という地球生物圏における2つの大きな未踏領域に生息する微生物の生態と分類を明らかにするために,潜水調査船を使った深海調査および調査試錐孔・調査坑道を使った陸上地下調査などにより微生物試料を採取し,微生物の分離・培養あるいは微生物相の生化学的解析や遺伝子解析などを行った。本研究で得られた結果概要を以下に挙げる:
〇熱水噴出孔やメタン湧水帯など特異な生物群集が形成されている深海底に生息する微生物相について、分子系統分類で多用される16S rRNA遺伝子解析を行ったところ、化学合成微生物であるイオウ酸化細菌(チオトロフ)やメタン酸化細菌(メタノトロフ)の存在が確認され、これらの微生物が特異な深海生物群集の生存を支えているという考えを再確認した。
〇さらに、深海底での化学合成炭酸固定に関与する酵素ルビスコの遺伝子を解析したところ、深海底には嫌気条件で機能する原始的なルビスコ遺伝子が広く分布することが分かり、深海底における化学合成が遍在的であることが示唆された。
〇また、海底の嫌気条件における主要な反応である硫酸還元に関与する酵素DSRの遺伝子を解析したところ、従来知られていなかったDSR系統群(真正細菌)の存在が確認されたほか、古細菌型DSRを有する系統群の存在も新たに確認された。
〇上記と同様の遺伝子解析を地下試料についても行ったところ、多様な化学合成微生物種や嫌気呼吸微生物種の存在が確認されたほか、それらの遺伝子を有する微生物を生きたまま回収し、純粋培養することに成功した。これらについては現在解析・同定等を進めているところである。

報告書

(3件)
  • 2000 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (25件)

  • [文献書誌] Hosam Elsaied & Takeshi Naganuma: "Phylogenetic diversity of ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large-subunit genes from deep-sea microorganisms"Applied and Environmental Microbiology. 67(4)(in press). (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Okamoto T,Fujioka K & Naganuma T: "Phylogenetic similarity of aerobic gram-negative halophilic bacteria from a deep-sea hydrothermal mound and Antarctic habitats"Polar Bioscience. 13(in press). (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 高杉秀美,長沼毅,金松敏也,池原研,沖野郷子,藤岡換太郎: "堆積物脂肪酸を用いた深海帯微生物相の解析"JAMSTEC深海研究. 15(1). 25-33 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 村上由記,長沼毅: "地下深部に広がる微生物ハビタット-地下生物圏"Microbes and Environment. 15. 125-131 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 長沼毅,岡本拓士: "海底熱水噴出孔からサブベント生物圏へ"月刊海洋. 号外23. 121-126 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 村上由記,長沼毅,岩月輝希: "深部地質環境における微生物群集-東濃地域を例として"原子カバックエンド研究. 5. 59-66 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 長沼毅(分担執筆): "NHKスペシャル宇宙-未知への大紀行第1巻天に満ちる生命"NHK「宇宙プロジェクト」編,日本放送出版協会. 240 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Naganuma T(分担執筆): "Extremophiles in Deep-Sea Environments"Horikoshi K and Tsujii K (eds),,Springer-Verlag,Tokyo. 316 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Naganuma T, Meisel CJ, Wada H, Kato Y, Takeuchi A, Fujikura K, Naka J and Fujioka K: "Sea-floor fissures, biological communities and sediment fatty acids of the Northern Okushiri Ridge, Japan Sea : Implications for possible methane seepage"Island Arc. 8. 232-244 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Murakami Y and Naganuma T: "Globally spread microbial habitat in the lithosphere : deep subsurface biosphere"Microbes and Environments. 15 (2)(in Japanese with English abstract). 125-131 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Elsaied H and Naganuma T: "Phylogenetic diversity of ribulose-1, 5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (RuBisCO) large subunit genes of deep-sea microorganisms"Applied and Environmental Microbiology. 67 (4)(in press). (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Okamoto T Fujioka K & Naganuma T: "Phylogenetic similarity of aerobic gram-negative halophilic bacteria from a deep-sea hydrothermal mound and Antarctic habitats"Polar Bioscience. 13 (in press). (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hosam Elsaied & Takeshi Naganuma: "Phylogenetic diversity of ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large-subunit genes from deep-sea microorganisms"Applied and Environmental Microbiology. 67(4)(in press). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Okamoto T,Fujioka K & Naganuma T: "Phylogenetic similarity of aerobic gram-negative halophilic bacteria from a deep-sea hydrothermal mound and Antarctic habitats"Polar Bioscience. 13(in press). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 高杉秀美,長沼毅,金松敏也,池原研,沖野郷子,藤岡換太郎: "堆積物脂肪酸を用いた深海帯微生物相の解析"JAMSTEC深海研究. 15(1). 25-33 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 村上由記,長沼毅: "地下深部に広がる微生物ハビタットー地下生物圏"Microbes and Environment. 15. 125-131 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 長沼毅,岡本拓士: "海底熱水噴出孔からサブベント生物圏へ"月刊海洋. 号外23. 121-126 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 村上由記,長沼毅,岩月輝希: "深部地質環境における微生物群集-東濃地域を例として"原子カバックエンド研究. 5. 59-66 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 長沼毅(分担執筆): "NHKスペシャル宇宙-未知への大紀行 第1巻 天に満ちる生命"NHK「宇宙プロジェクト」編,日本放送出版協会. 240 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Naganuma T (分担執筆): "Extremophiles in Deep-sea Environments"Horikoshi K and Tsujii K (eds),,Springer-Verlag,Tokyo. 316 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 村上由記,岩月輝希,長沼毅: "深部地下環境における微生物生態系"月刊海岸. 号外19. 108-115 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 長沼毅,木村浩之,高杉秀美,植田浩義,小山田潔,竹原竜大: "ベントナイト微生物学-地球深部研究および地層処分研究への応用の一例"月刊海岸. 号外19. 133-138 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 長沼毅,岡本拓土,藤岡換太郎: "熱水噴出孔下生物圏(サブベント生物圏)を探る"月刊海岸. 号外19. 217-222 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 木村浩之,東出幸真,長沼毅: "深海生物ハオリムシの体内と体外の微生物相"JAMSTEC深海研究. 15(1). 25-33 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 高杉秀美,長沼毅: "堆積物脂肪酸を用いた深海帯海底微生物相の解析"JAMSTEC深海研究. 15(2)印刷中. (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書

URL: 

公開日: 1999-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi