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亜鉛の特性を利用したフォスフォプロテオーム解析技術の開発

研究課題

研究課題/領域番号 15390013
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 物理系薬学
研究機関広島大学

研究代表者

小池 透  広島大学, 大学院医歯薬学総合研究科, 教授 (90186586)

研究分担者 木下 英司  広島大学, 大学院医歯薬学総合研究科, 助教授 (80304418)
研究期間 (年度) 2003 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
12,000千円 (直接経費: 12,000千円)
2006年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
2005年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2004年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2003年度: 5,600千円 (直接経費: 5,600千円)
キーワードポストゲノム解析 / リン酸化プロテオミクス / 金属錯体 / ウエスタン解析 / アフィニティー電気泳動 / キナーゼプロファイリング / 亜鉛化合物 / ゲル蛍光染色 / アフィニティークロマトグラフィー / SPR分析
研究概要

ヒトゲノム解析がほぼ完了した現在,それらがコードする様々なタンパク質の機能解析が次の研究ターゲットとなっている。特にタンパク質のリン酸化は,細胞内の様々な制御機構に関わる共通のメカニズムであり,リン酸化されたアミノ酸残基を同定することは,代謝経路や細胞内機能におけるリン酸化蛋白質の役割を知る上で不可欠である。本研究では,独自に合成したリン酸アニオン認識分子「フォスタグ」を用いたリン酸化分子の新しい分離分析法を開発した。代表的な方法は,1)リン酸アフィニティクロマトグラフィー法,2)リン酸化分子の選択的質量分析,3)フォスタグを結合した電気泳動ゲルを利用したリン酸化タンパク質のプロファイリング法,4)SNPタイピングによる遺伝子検査法,5)リン酸化タンパク質の網羅的ウエスタン解析法である。中でもリン酸化タンパク質のプロファイリング法は,リン酸化数やリン酸化部位の違いによりほぼ同じ分子量のリン酸化タンパク質をポリアクリルアミド電気泳動ゲル上で分離する画期的な分離分析法である。この方法は,これまでのリン酸化プロテオミクス研究を劇的に進展させるものと確信している。フォスタグを用いた遺伝子検査法は,末端にリン酸基をもつPCRプライマー(SNPタイプ1)とリン酸基を持たないもの(SNPタイプ2)を用意し,リン酸基のついているPCR産物をついていないもの(いずれも同じ塩基対数)から分離して検出する方法である。この方法により,ミニゲルクラスの電気泳動装置があれば,ほほ100%の検出感度でSNPタイピングが通常の実験室で数十のサンプルを一度に検査できる。本課題研究により,新しいリン酸化プロテオミクス研究技術を数多く開発することができた。今後,それらの技術が世界標準のリン酸化プロテオミクス技術となるようさらに研究開発を進めていく予定である。

報告書

(5件)
  • 2006 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2005 実績報告書
  • 2004 実績報告書
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (32件)

すべて 2007 2006 2005 2004 2003 その他

すべて 雑誌論文 (29件) 図書 (1件) 産業財産権 (1件) 文献書誌 (1件)

  • [雑誌論文] Separation of a phosphorylated histidine protein using phosphate affinity polyacrylamide gel electrophoresis2007

    • 著者名/発表者名
      Seiji Yamada
    • 雑誌名

      Analytical Biochemistry 360

      ページ: 160-162

    • NAID

      120000878053

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Label-free kinase profiling using phosphate-affinity polyacrylamidegel electrophresis2007

    • 著者名/発表者名
      Emiko Kinoshita-Kikuta
    • 雑誌名

      Molecular & Cellular Proteomics 6

      ページ: 356-366

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Separation of a phosphorylated histidine protein using phosphate affinity polyacrylamide gel electrophoresis2007

    • 著者名/発表者名
      S.Yamada, H.Nakamura, E.Kinoshita, E.Kinoshita-Kikuta, T.Koike, Y.Shiro
    • 雑誌名

      Analytical Biochemistry 360

      ページ: 160-162

    • NAID

      120000878053

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Label-free kinase profiling using phosphate-affinity polyacrylamide gel electrophresis2007

    • 著者名/発表者名
      E.Kinoshita-Kikuta, Y.Aoki, E.Kinoshita, T.Koike
    • 雑誌名

      Molecular & Cellular Proteomics 6

      ページ: 356-366

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Phosphate-binding tag : A new tool to visualize phosphorylated proteins2006

    • 著者名/発表者名
      Eiji Kinoshita
    • 雑誌名

      Molecular & Cellular Proteomics 5

      ページ: 749-757

    • NAID

      120000878114

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書 2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Enrichment of phosphorylated proteins from cell lysate using phosphate-affinity chromatography at physiological pH2006

    • 著者名/発表者名
      Emiko Kinoshita-Kikuta
    • 雑誌名

      Proteomics 6

      ページ: 5088-5095

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書 2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Phosphate-binding tag : A new tool to visualize phosphorylated proteins2006

    • 著者名/発表者名
      E.Kinoshita, E.Kinoshita-Kikuta, K.Takiyama, T.Koike
    • 雑誌名

      Molecular & Cellular Proteomics 5

      ページ: 749-757

    • NAID

      120000878114

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Enrichment of phosphorylated proteins from cell lysate using phosphate-affinity chromatography at physiological pH2006

    • 著者名/発表者名
      E.Kinoshita-Kikuta, E.Kinoshita, A.Yamada, M.Endo, T.Koike
    • 雑誌名

      Proteomics 6

      ページ: 5088-5095

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Detection and Quantification of On-Chip Phosphorylated Peptides by Surface Plasmon Resonance Imaging Techniques Using a Phosphate Capture Molecule2005

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Inamori
    • 雑誌名

      Analytical Chemistry 77

      ページ: 3979-3985

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要 2005 実績報告書
  • [雑誌論文] A heteroduplex-preferential T_m depressor for the specificity-enhanced DNA polymerase chain reaction2005

    • 著者名/発表者名
      Eiji Kinoshita
    • 雑誌名

      Analytical Biochemistry 337

      ページ: 154-160

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Novel immobilized zinc(II) affinity chromatography for Phosphopeptides and phosphorylated proteins2005

    • 著者名/発表者名
      Eiji Kinoshita
    • 雑誌名

      Journal of Separation Science 28

      ページ: 155-162

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] An Alkoxide-bridged Dinuclear Zinc(II) Hexaazacryptate : a Novel Phosphate Capture Molecule in Aqueous Solution2005

    • 著者名/発表者名
      Eiji Kinoshita
    • 雑誌名

      Bulletin of the Chemical Society of Japan 78

      ページ: 125-131

    • NAID

      10014271953

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Reliable and Cost-effective Screening of Inherited Heterozygosity by Using Zn(II)-Cyclen Polyacrylamide Gel Electrophoresis2005

    • 著者名/発表者名
      Eiji Kinoshita
    • 雑誌名

      Clinical Chemistry 51

      ページ: 2195-2198

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Detection and Quantification of On-Chip Phosphorylated Peptides by Surface Plasmon Resonance Imaging Techniques Using a Phosphate Capture Molecule2005

    • 著者名/発表者名
      K.Inamori, M.Kyo, Y.Nishiya, Y.Inoue, T.Sonoda, E.Kinoshita, T.Koike, Y.Katayama
    • 雑誌名

      Analytical Chemistry 77

      ページ: 3979-3985

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Novel immobilized zinc(II) affinity chromatography for phosphopeptides and phosphorylated proteins2005

    • 著者名/発表者名
      E.Kinoshita, A.Yamada, H.Takeda, E.Kinoshita-Kikuta, T.Koike
    • 雑誌名

      Journal of Separation Science 28

      ページ: 155-162

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] An Alkoxide-bridged Dinuclear Zinc(II) Hexaazacryptate : a Novel Phosphate Capture Molecule in Aqueous Solution2005

    • 著者名/発表者名
      E.Kinoshita, K.Ishikawa, E.Kinoshita-Kikuta, K.Ohtani, M.Shiro, T.Koike
    • 雑誌名

      Bulletin of the Chemical Society of Japan 78

      ページ: 125-131

    • NAID

      10014271953

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] An Alkoxide-bridged Dinuclear Zinc(II) Hexaazacryptate: a Novel Phosphate Capture Molecule in Aqueous Solution2005

    • 著者名/発表者名
      Eiji Kinosita
    • 雑誌名

      Bulletin of the Chemical Society Japan 78

      ページ: 125-131

    • NAID

      10014271953

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Novel immobilized zinc(II) affinity chromatography for phosphopeptides and phosphorylated proteins2005

    • 著者名/発表者名
      Eiji Kinoshita
    • 雑誌名

      Journal of Separation Science 28

      ページ: 155-162

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Recognition of phosphate monoester dianion by an alkoxide-bridged dinuclear zinc(II) complex2004

    • 著者名/発表者名
      Eiji Kinoshita
    • 雑誌名

      Dalton Transactions

      ページ: 1189-1193

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Inhibition of NADPH-dependent enzyme activities using the dinuclear zinc chelate. Phos-tag, and reactivation depending on phosphate ion concentrations2004

    • 著者名/発表者名
      Yoshiaki Nishiya
    • 雑誌名

      Journal of Analytical Bio-Science 27

      ページ: 224-228

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Quantitative analysis of lysophosphatidic acid by time-of-flight mass spectrometry using a phosphate capture molecule2004

    • 著者名/発表者名
      Tamotsu Tanaka
    • 雑誌名

      Journal of Lipid Research 45

      ページ: 2145-2150

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Production of 1,2-Didocosahexaenoyl Phosphatidylcholine by Bonito Muscle Lysophosphatidylcholine/Transacylase2004

    • 著者名/発表者名
      Kaoru Hirano
    • 雑誌名

      Journal of Biochemistry 136

      ページ: 477-483

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Recognition of phosphate monoester dianion by an alkoxide-bridged dinuclear zinc(II) complex2004

    • 著者名/発表者名
      E.Kinoshita, M.Takahashi, H.Takeda, M.Shiro, T.Koike
    • 雑誌名

      Dalton Transactions

      ページ: 1189-1193

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Quantitative analysis of lysophosphatidic acid by time-of-flight mass spectrometry using a phosphate capture molecule2004

    • 著者名/発表者名
      T.Tanaka, H.Tsutsui, K.Hirano, T.Koike, A.Tokumura, K.Satouchi
    • 雑誌名

      Journal of Lipid Research 45

      ページ: 2145-2150

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Recognition of phosphate monoester dianion by an alkoxide-bridged dinuclear zinc(II) complex"2004

    • 著者名/発表者名
      Eiji Kinoshita
    • 雑誌名

      Dalton Transactions

      ページ: 1189-1193

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Quantitative analysis of lysophosphatidic acid by time-of-flight mass spectrometry using a phosphate-capture molecule2004

    • 著者名/発表者名
      Tamotsu Tanaka
    • 雑誌名

      Journal of Lipid Research 45

      ページ: 2145-2150

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Production of 1,2-didocosahexaenoyl phosphatidylcholine by bonito muscle lysophosphatidylcholine/transacylase2004

    • 著者名/発表者名
      Kaoru Hirano
    • 雑誌名

      Journal of Biochemistry 136

      ページ: 447-483

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry of phosphorylated compounds using a novel phosphate capture molecule2003

    • 著者名/発表者名
      Hironori Takeda
    • 雑誌名

      Rapid Communication of Mass Spectrometry 17

      ページ: 2075-2081

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry of phosphorylated compounds using a novel phosphate capture molecule2003

    • 著者名/発表者名
      H.Takeda, A.Kawasaki, M.Takahashi, A.Yamada, T.Koike
    • 雑誌名

      Rapid Communication of Mass Spectrometry 17

      ページ: 2075-2081

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [図書] 実験医学2006

    • 著者名/発表者名
      木下英司, 木下恵美子, 小池 透
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      株式会社 羊土社
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書 2006 研究成果報告書概要
  • [産業財産権] リン酸基を有する物質の染色方法2005

    • 発明者名
      小池 透
    • 権利者名
      広島大学
    • 産業財産権番号
      2005-230583
    • 出願年月日
      2005-08-09
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要 2005 実績報告書
  • [文献書誌] Hironori Takeda: "Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry of phosphorylated compounds by using a novel phosphate capture molecule"Rapid Communications in Mass Spectrometry. 17. 2075-2081 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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