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高品位な知識抽出を実現する三階層オントロジーフレームワークの開発

研究課題

研究課題/領域番号 15K08845
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 病院・医療管理学
研究機関国立保健医療科学院 (2018)
愛媛大学 (2015-2017)

研究代表者

木村 映善  国立保健医療科学院, その他部局等, 統括研究官 (20363244)

研究分担者 岡本 和也  京都大学, 医学研究科, 准教授 (60565018)
今井 健  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 准教授 (90401075)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2017年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2016年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード自然文章解析 / 機械学習 / オントロジー / ターミノロジー / 意味分散表現 / 自然言語処理 / UMLS / Semantic Web
研究成果の概要

医療記録から潜在的な有害事象を発見するには、有害事象につながる原因・症状から推察できる能力を獲得する必要がある。有害事象を定義する文章から計算される概念ベクトルに似た概念ベクトルを持つ文章が有害事象を示唆しているという仮説を検証するための手法の開発を試みた。医学用語の品質のよい意味分散表現を獲得するために電子カルテの記載内容を構文解析し、意味分散表現を抽出した。周辺概念をまとめて捕捉できるように概念間関係を定義しているUMLSと医学用語間のマッピングをするために、意味分散表現ベクトルのクラスタリングによるマッピング候補の抽出手法を開発した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

医療記録から潜在的な事象を読み取る能力を獲得することは人工知能が医師の判断能力に近づくために必要なプロセスである。良質な意味分散表現は医療記録の分析から得られること、周辺概念からの推察を実現するためにオントロジーとの連携が重要であること、質の良い意味分散表現の獲得にむけて、表記揺れの収束や異常値の検出等の追加的な処理を加えることの必要性の知見を本研究は示した。

報告書

(5件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実施状況報告書
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2018 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (22件) (うち国際共著 3件、 オープンアクセス 2件、 査読あり 12件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Real World Data を活用する観察研究データベースの考察2018

    • 著者名/発表者名
      木村 映善
    • 雑誌名

      保健医療科学

      巻: 67 号: 2 ページ: 179-190

    • DOI

      10.20683/jniph.67.2_179

    • NAID

      130007386522

    • ISSN
      1347-6459, 2432-0722
    • 年月日
      2018-05-31
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] EDC への電子カルテからのデータ取り込みの標準化に関わる取り組み2018

    • 著者名/発表者名
      木村 映善, 山本 景一
    • 雑誌名

      医療情報学

      巻: 38(Suppl.) ページ: 40-44

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] SS-MIX への FHIR Web サービス実装の試み2018

    • 著者名/発表者名
      木村 映善,
    • 雑誌名

      医療情報学

      巻: 38(Suppl.) ページ: 1074-1076

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] Mapping data items between EDC and EMR using FHIR terminology service2018

    • 著者名/発表者名
      Eizen Kimura, Keiichi Yamamoto
    • 雑誌名

      2018 Joint Summits on Translational Science

      ページ: 523-523

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Eizen Kimura, Keiichi Yamamoto. Mapping data items between EDC and EMR using FHIR terminology service2018

    • 著者名/発表者名
      Eizen Kimura, Keiichi Yamamoto
    • 雑誌名

      2018 Joint Summits on Translational Science

      ページ: 523-523

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 分散意味表現を利用した UMLS の概念と日本語の医学用語間のマッピングの試み2017

    • 著者名/発表者名
      木村 映善, 蒲生 祥子, 石原 謙
    • 雑誌名

      医療情報学37(Suppl)

      ページ: 1181-5

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] CDISC/ODMの概念マッピングによるEDCとEMR連携の試み2017

    • 著者名/発表者名
      木村 映善, 山本 景一
    • 雑誌名

      医療情報学37(Suppl)

      ページ: 159-63

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 秘密分散技術を利用した医療情報の遠隔保存と参照環境の評価2016

    • 著者名/発表者名
      木村 映善, 松村 泰志, 三原 直樹, 黒田 知宏, 山下 芳範, 平松 治彦, 真鍋 史朗, 田中 大介, 佐藤 敦, 山倉 直
    • 雑誌名

      電子情報通信学会論文誌D 情報・システム

      巻: J99-D 号: 5 ページ: 526-538

    • DOI

      10.14923/transinfj.2015AIP0010

    • ISSN
      1880-4535, 1881-0225
    • 年月日
      2016-05-01
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evaluation of Secure Computation in a Distributed Healthcare Setting.2016

    • 著者名/発表者名
      Eizen KIMURA, Koki HAMADA, Ryo KIKUCHI, Koji CHIDA, Kazuya OKAMOTO, Shirou MANABE, Tomohiko KURODA, Yasushi MATSUMURA, Toshihiro TAKEDA, MIHARA N.
    • 雑誌名

      Stud Health Technol Inform.

      巻: 228 ページ: 152-156

    • NAID

      120006784432

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The inequality of patient profile information in Japanese hospitals2016

    • 著者名/発表者名
      Yukio Kurihara, Haku Ishida, Eizen KIMURA, Akira Gochi, Hiroshi Kondoh, Ken-ichiro SHIMAI, Noriaki Nakajima, Takeshi Tanaka, kiyomu Ishikawa, Michihiro Oohara, Takeharu Sonoda, Kohei Takai.
    • 雑誌名

      Stud Health Technol Inform.

      巻: 228 ページ: 412-415

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [雑誌論文] 秘密計算による分散医療統計システムの実装評価 (情報通信マネジメント)2016

    • 著者名/発表者名
      濱田 浩気, 木村 映善, 菊池 亮, 千田 浩司, 岡本 和也, 真鍋 史朗, 黒田 知宏, 松村 泰志, 武田 理宏, 三原 直樹.
    • 雑誌名

      電子情報通信学会技術研究報告

      巻: 116 ページ: 111-117

    • NAID

      40020849801

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 匿名化ヘルス情報の再特定化リスク除去の統計量への 影響評価方法の検討2016

    • 著者名/発表者名
      栗原 幸男, 石田 博, 木村 映善, 入野 了士
    • 雑誌名

      医療情報学

      巻: 36 ページ: 710-712

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [雑誌論文] 患者基本プロファイルのアレルギー項目の用語集編成に関する検討2016

    • 著者名/発表者名
      蒲生 祥子, 木村 映善, 石原 謙
    • 雑誌名

      医療情報学

      巻: 36 ページ: 846-848

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [雑誌論文] 病院情報システムにおける患者プロファイル情報項目の保有状況調査2016

    • 著者名/発表者名
      栗原 幸男, 石田 博, 木村 映善, 近藤 博史, 島井 健一郎, 田中 武志, 中島 典明
    • 雑誌名

      医療情報学

      巻: 36 ページ: 1086-1088

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [雑誌論文] 標準化されたデータソースを用いたSDM構築2016

    • 著者名/発表者名
      木村 映善, 高月 常光, 崔 ムン相, 張 彰祐, 蒲生 祥子, 石原 謙, 鈴木 英夫
    • 雑誌名

      医療情報学

      巻: 36 ページ: 160-161

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 健康診査実施機関における健診データの利活用と匿名化データの外部提供に関する調査研究2016

    • 著者名/発表者名
      入野 了士, 木村 映善, 石田 博, 栗原 幸男.
    • 雑誌名

      医療情報学

      巻: 36 ページ: 1014-1017

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [雑誌論文] SS-MIX2ベースの地域医療連携システムにおける 患者プロファイル情報統合の課題2016

    • 著者名/発表者名
      栗原 幸男, 近藤 博史, 入江 真行, 木村 映善, 合地 明, 高井 康平, 原田 正治, 大原 通宏
    • 雑誌名

      医療情報学

      巻: 36 ページ: 238-239

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Arden SyntaxとFHIRを利用した臨床判断支援ロジック記述環境の開発の試み2015

    • 著者名/発表者名
      木村 映善,石原 謙
    • 雑誌名

      医療情報学

      巻: 35 ページ: 283-296

    • NAID

      130005244542

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Virtual File System on NoSQL for Processing High Volumes of HL7 Messages2015

    • 著者名/発表者名
      Eizen Kimura,Ken Ishihara
    • 雑誌名

      Studies in Health Technology and Informatics

      巻: 210 ページ: 687-691

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Internal Domain-Specific Language Based on Arden Syntax and FHIR2015

    • 著者名/発表者名
      Eizen Kimura,Ken Ishihara
    • 雑誌名

      Studies in Health Technology and Informatics

      巻: 216 ページ: 955-955

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 医療分野への人工知能適用に関する研究のトピックス2015

    • 著者名/発表者名
      木村 映善
    • 雑誌名

      愛媛医学

      巻: 34 ページ: 197-202

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [雑誌論文] FHIR Terminology Serviceの実装と評価2015

    • 著者名/発表者名
      木村 映善,石原 謙
    • 雑誌名

      医療情報学

      巻: 35(Suppl.) ページ: 910-911

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Stream Computingを医療情報システムに導入する試み.2016

    • 著者名/発表者名
      木村 映善, 蒲生 祥子, 石原 謙.
    • 学会等名
      第43回日本Mテクノロジー学会大会
    • 発表場所
      キャンパスイノベーションセンター東京(東京都港区)
    • 年月日
      2016-08-26
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2020-03-30  

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