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ヌクレオシド修飾とwobble則の進化

研究課題

研究課題/領域番号 16510162
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物分子科学
研究機関愛媛大学

研究代表者

高井 和幸  愛媛大学, 無細胞生命科学工学研究センター, 助教授 (40260848)

研究期間 (年度) 2004 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
2005年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
2004年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
キーワード修飾ヌクレオシド / RNAリガーゼ / 遺伝暗号 / wobble則 / 分子生物学 / 修飾ウリジン / 無細胞タンパク質合成系 / tRNA / 遺伝暗号進化 / イノシン / mRNA
研究概要

コドン三字目のグアノシンとアンチコドン一字目の修飾ウリジンの水素結合様式を調べるため,mRNAに修飾グアノシンを導入することを検討した.まず,6-チオグアノシン5'-リン酸を酵素的に合成することができた,また,イノシンおよび6-チオグアノシンを転写反応でRNAの特異的な位置に導入することができることを示した。
さらに,RNAを連結して,翻訳可能なmRNA分子を調製することを試みた.従来法のT4 DNAリガーゼやT4 RNAリガーゼを用いたRNA連結法では,収量や特異性の問題で,翻訳活性測定に用いるほど十分な量のmRNA分子を得るのが困難だった.最近報告されたT4 RNAリガーゼ2を用い,これで連結したRNAを無細胞タンパク質合成系に導入したが,これについては全く翻訳されないことがわかった.この酵素は,報告されていない活性をもっているものと考えられる.一方,コムギ胚芽RNAリガーゼを用いると,高収率でRNAを連結することができることがわかった.しかし,この方法では連結部位の2'位が水酸基でなくリン酸になる.水酸基に変換する反応が十分進行しているか確認する方法の確立が今後の課題となった.
一方,研究期間中に,リボソーム上での修飾ウリジンとグアノシンとの塩基対の形を直接解析した結果が報告されたが,これは,本研究の作業仮説と一見矛盾するものの,十分両立するものであった.そこで,本研究の作業仮説の背景を論文にまとめ,発表した.

報告書

(3件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2005 その他

すべて 雑誌論文 (7件)

  • [雑誌論文] Possible conformation of 5-aminomethyluridine. derivatives recognizing a G at the third position of the codon.2005

    • 著者名/発表者名
      Kazuyuki Takai
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symposium Ser. 49

      ページ: 317-318

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Purification and sequence determination of an RNA ligase from heat embryos.2005

    • 著者名/発表者名
      Shin-ichi Makino
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symposium Ser. 49

      ページ: 319-320

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Possible conformation of 5-aminomethyluridine derivatives recognizing a G at the third position of the codon.2005

    • 著者名/発表者名
      Takai, K.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symposium Ser.49

      ページ: 317-318

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Purification and sequence determination of an RNA ligase from wheat embryos.2005

    • 著者名/発表者名
      Makino, S., Sawasaki, T., Endo, Y., Takai, K.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symposium Ser.49

      ページ: 319-320

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Possible conformations of 5-aminomethyluridine derivatives recognizing a G at the third position of the codon2005

    • 著者名/発表者名
      Kazuyuki Takai
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symposium Series 42

      ページ: 317-318

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Classification of the possible pairs between the first anticodon and the third codon positions based on a simple model assuming two geometries with which the pairing effectively potentiates the decoding complex

    • 著者名/発表者名
      Kazuyuki Takai
    • 雑誌名

      Journal of Theoretical Biology (印刷中)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Classification of the possible pairs between the first anticodon and the third codon positions based on a simple model assuming two geometries with which the pairing effectively potentiates the decoding complex

    • 著者名/発表者名
      Kazuyuki Takai
    • 雑誌名

      J.Theor.Biol. (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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