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東アジアを中心としたシャジクモの分布様式と多様性の成立過程解明と適応遺伝子の探索

研究課題

研究課題/領域番号 16H05764
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分海外学術
研究分野 生物多様性・分類
研究機関神戸大学

研究代表者

坂山 英俊  神戸大学, 理学研究科, 准教授 (60391108)

研究分担者 西山 智明  金沢大学, 学際科学実験センター, 助教 (50390688)
土松 隆志  千葉大学, 大学院理学研究院, 准教授 (60740107)
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
16,900千円 (直接経費: 13,000千円、間接経費: 3,900千円)
2019年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
2018年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2017年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2016年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
キーワードシャジクモ / 淡水藻類 / 進化 / 種分化 / 遺伝的多様性 / 生態的多型 / 集団構造 / 生物多様性 / ゲノム / 生態型 / 藻類
研究成果の概要

シャジクモは南極大陸を除く世界各地に分布し、地域変異が多く、様々な淡水環境に生育している。このようなシャジクモの現在の分布様式は、おもに水鳥の渡りによる散布と、東アジアを中心に始まった水稲農業による二次的環境(水田、ため池など)の形成による新たなニッチ獲得の影響を受けていると考えられる。しかし、東アジアを中心としたシャジクモの現在の分布様式の成立過程と地域変異の進化過程は明らかにされていない。本研究では、東アジアを中心とした海外からシャジクモを採集し、種内の遺伝的多様性、系統関係、表現型を解析することで、現在のシャジクモの分布様式の成立過程と多様性を明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究の研究対象であるシャジクモは、湖、ため池、水田など、わたしたちにとって身近な淡水生態系に生育する大型藻類である。しかし、日本では近年の淡水生態系破壊の結果、急速にシャジクモの衰退が進行している。その結果、シヤジクモは環境省版レッドリストにおいて絶滅危惧種として掲載されている。本研究で明らかとなった東アジアを中心に分布するシャジクモの現在の分布様式の成立過程と多様性に関する知見は、生態学的に重要な広域分布種や絶滅の危機に瀕している種の実体解明に向けた研究や施策を考える上で非常に有益な情報となり得ると期待される。

報告書

(5件)
  • 2021 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 研究成果

    (58件)

すべて 2022 2021 2020 2019 2018 2017 2016 その他

すべて 国際共同研究 (15件) 雑誌論文 (11件) (うち国際共著 4件、 査読あり 11件、 オープンアクセス 8件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (32件) (うち国際学会 10件、 招待講演 4件)

  • [国際共同研究] University of Wollongong(オーストラリア)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] Chinese Academy of Sciences/Shanxi University(中国)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] Gregor Mendel Institute(オーストリア)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Wollongong(オーストラリア)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] Chinese Academy of Sciences/Shanxi University(中国)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] Gregor Mendel Institute(オーストリア)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Wollongong/Royal Botanic Gardens, Melbourne(オーストラリア)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] Chinese Academy of Sciences/Shanxi University(中国)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] Khon Kaen University(タイ)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] Gregor Mendel Institute(オーストリア)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Wollongong(オーストラリア)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] Gregor Mendel Institute(オーストリア)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] Khon Kaen University(タイ)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] Chinese Academy of Sciences(中国)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] L.N.Gumilyov ENU(カザフスタン)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [雑誌論文] Discovery of ultrafast myosin, its amino acid sequence, and structural features2022

    • 著者名/発表者名
      Haraguchi Takeshi、Tamanaha Masanori、Suzuki Kano、Yoshimura Kohei、Imi Takuma、Tominaga Motoki、Sakayama Hidetoshi、Nishiyama Tomoaki、Murata Takeshi、Ito Kohji
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 119 号: 8

    • DOI

      10.1073/pnas.2120962119

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 絶滅のおそれのある野生生物の選定・評価検討 -レッドリスト2020藻類-2022

    • 著者名/発表者名
      田中次郎,北山太樹,坂山英俊,寺田竜太,神谷充伸,嶌田 智
    • 雑誌名

      藻類

      巻: 70 ページ: 29-37

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Morphology, taxonomy and phylogenetic positions of two Spirogyra species (Zygnematophyceae, Streptophyta) with replicate and semi-replicate transverse walls from Japan2022

    • 著者名/発表者名
      Takano, T., Ikegaya, H., Ikeda, K., Nozaki, H. and Sakayama, H.
    • 雑誌名

      Phycologia

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] New distributional records, taxonomy, morphology, and genetic variations of the endangered brackish-water species Lamprothamnium succinctum (Charales, Charophyceae) in Japan2021

    • 著者名/発表者名
      Kato, S., Tanaka, J., Tanaka, N., Yokoyama, J., Ito, Y., Fujiwara, Y., Higa, A., Kobayashi, S., Watanabe, M. M. and Sakayama, H.
    • 雑誌名

      Journal of Asia-Pacific Biodiversity

      巻: 14 号: 1 ページ: 15-22

    • DOI

      10.1016/j.japb.2020.09.005

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Induction of sexual reproduction reveals the presence of heterothallic Spirogyra strains (Zygnematophyceae, Streptophyta)2020

    • 著者名/発表者名
      Takano Tomoyuki、Ikegaya Hisato、Nozaki Hisayoshi、Sakayama Hidetoshi
    • 雑誌名

      Phycological Research

      巻: 68 号: 4 ページ: 263-268

    • DOI

      10.1111/pre.12436

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The Chara Genome: Secondary Complexity and Implications for Plant Terrestrialization2018

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama, T., Sakayama, H., de Vries, J., Buschmann, H., Saint-Marcoux, D., et al. (他55名)
    • 雑誌名

      Cell

      巻: 174 号: 2 ページ: 448-464

    • DOI

      10.1016/j.cell.2018.06.033

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Transcription factor DUO1 generated by neo-functionalization is associated with evolution of sperm differentiation in plants2018

    • 著者名/発表者名
      Higo, A., Kawashima, T., Borg, M., Zhao, M., Lopez-Vidriero, I., Sakayama, H., et al. (他18名)
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 9 号: 1 ページ: 5283-5283

    • DOI

      10.1038/s41467-018-07728-3

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Loss of heterophylly in aquatic plants: not ABA-mediated stress but exogenous ABA treatment induces stomatal leaves in Potamogeton perfoliatus2016

    • 著者名/発表者名
      Iida, S., Ikeda, M., Amano, M., Sakayama, H., Kadono, Y. and Kosuge, K.
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: 129 号: 5 ページ: 853-862

    • DOI

      10.1007/s10265-016-0844-x

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Diversification of a transcription factor family led to the evolution of antagonistically acting genetic regulators of root hair growth2016

    • 著者名/発表者名
      Breuninger, H., Thamm, A., Streubel, S., Sakayama, H., Nishiyama, T. and Dolan, L.
    • 雑誌名

      Current Biology

      巻: 26 号: 12 ページ: 1622-1628

    • DOI

      10.1016/j.cub.2016.04.060

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Next-generation sequencing of an 88-year-old specimen of the poorly known species Liagora japonica (Nemaliales, Rhodophyta) supports the recognition of Otohimella gen. nov.2016

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, M., Segawa, T. Mori, H., Akiyoshi, A., Ootsuki, R., Kurihara, A., Sakayama, H., Kitayama, T., Abe, T., Kogame, K., Kawai, H., Nozaki, H.
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 11 号: 7 ページ: e0158944-e0158944

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0158944

    • NAID

      120005844143

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] An adenylyl cyclase with a phosphodiesterase domain in basal plants with a motile sperm system.2016

    • 著者名/発表者名
      Kasahara, M., Suetsugu, N., Urano, Y., Yamamoto, C., Ohmori, M., Takada, Y., Okuda, S., Nishiyama, T., Sakayama, H., Kohchi, T., Takahashi, F.
    • 雑誌名

      Sci. Rep.

      巻: 6 号: 1 ページ: 39232-39232

    • DOI

      10.1038/srep39232

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 日本産アオミドロ類(ストレプト植物門・ホシミドロ藻綱)の形態比較及び分子系統解析2022

    • 著者名/発表者名
      高野智之・野崎久義・坂山英俊
    • 学会等名
      日本植物分類学会第21回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] アオミドロ類(ストレプト植物門・ホシミドロ藻綱)の葉緑体ゲノム解読に基づく分子系統解析及び一未記載種2022

    • 著者名/発表者名
      高野智之・野崎久義・坂山英俊
    • 学会等名
      日本藻類学会第46回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 新規培養株を用いた接合藻類アオミドロ属及びシロゴニウム属の分子系統と形態比較2021

    • 著者名/発表者名
      高野 智之・野崎 久義・坂山 英俊
    • 学会等名
      日本植物分類学会第20回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 兵庫県及び京都府から発見された接合藻類アオミドロ属における一未記載種2021

    • 著者名/発表者名
      高野 智之・野崎 久義・坂山 英俊
    • 学会等名
      日本藻類学会第45回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] アオミドロ類(接合藻類ストレプト植物門)の接合形態比較及び分子系統解析2021

    • 著者名/発表者名
      高野 智之・野崎 久義・坂山 英俊
    • 学会等名
      日本植物学会第85回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] ストレプト植物RAF様キナーゼの機能解析2021

    • 著者名/発表者名
      山崎 優斗・Akida Jahan・Mousona Islam・坂山 英俊・西山 智明・堀 孝一・太田 啓之・ 皆川 純・篠澤 章久・坂田 洋一・竹澤 大輔
    • 学会等名
      日本植物学会第85回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 接合藻類アオミドロ属の日本新産種Spirogyra unduliseptumの分類学的再検討2020

    • 著者名/発表者名
      高野 智之・野崎 久義・坂山 英俊
    • 学会等名
      日本植物学会第84回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 車軸藻類Nitella sonderiとその近縁種の分類学的再検討2020

    • 著者名/発表者名
      谷口ゆりの・Adriana Garcia・坂山 英俊
    • 学会等名
      日本植物学会第84回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] The genome and ecological evolution of Chara braunii (Charophyceae, Streptophyta)2019

    • 著者名/発表者名
      Sakayama, H. and Nishiyama, T.
    • 学会等名
      The 5th International Volvox Conference, Tokyo
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] First discovery of heterothallic sexuality in the genus Spirogyra using culture strains2019

    • 著者名/発表者名
      Takano, T. and Sakayama, H.
    • 学会等名
      The 5th International Volvox Conference, Tokyo
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 車軸藻類シャジクモ(Chara braunii)とその近縁種の分類学的再検討2019

    • 著者名/発表者名
      坂山 英俊・玉置 千紘・Adriana Garcia・Zhongmin Sun・川井 浩史・西山 智明
    • 学会等名
      日本植物学会第83回大会、東北大学(仙台)
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 接合藻類アオミドロ属の西日本産を中心とした新規株の系統解析2019

    • 著者名/発表者名
      高野 智之・野崎 久義・坂山 英俊
    • 学会等名
      日本植物学会第83回大会、東北大学(仙台)
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Progress in Streptophyte Algae Genomics and Genetics2019

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama, T., Kamada, H., Kasahara, M., Sakayama, H., Tsuchikane, Y. and Sekimoto, H.
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome XXVII Conference
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] シャジクモ(Chara)属 Charopsis 節の分類学的再検討2019

    • 著者名/発表者名
      玉置千紘・Adriana Garcia・Zhongmin Sun・Wuttipong Mahakham・川井浩史・坂山英俊
    • 学会等名
      日本藻類学会第43回大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] The genome and ecological evolution of a cosmopolitan freshwater alga Chara braunii (Charales, Streptophyta)2018

    • 著者名/発表者名
      Sakayama, H., Kato, S. and Nishiyama, T.
    • 学会等名
      East Asian Plant Diversity and Conservation 2018
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] シャジクモ細胞膜リン酸輸送体の分子機能解析2018

    • 著者名/発表者名
      三村徹郎・大西美輪・村西直樹・藤原ひとみ・石崎公庸・深城英弘・西山智明・坂山英俊・Reid Rob J.・且原真木
    • 学会等名
      日本植物学会第82回大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] NIMA関連キナーゼファミリーによる細胞伸長制御の進化的な保存性2018

    • 著者名/発表者名
      橋爪駿・高谷彰吾・日渡祐二・坂山英俊・西山智明・髙橋卓・本瀬宏康
    • 学会等名
      日本植物学会第82回大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] シャジクモの生態型の進化に関する研究2017

    • 著者名/発表者名
      坂山英俊・宮田大輔・加藤 将・西山智明
    • 学会等名
      日本藻類学会第41回大会
    • 発表場所
      高知大学(高知)
    • 年月日
      2017-03-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 富士五湖における最近の車軸藻類の分布状況2017

    • 著者名/発表者名
      上嶋崇嗣・中村誠司・加藤 将・坂山英俊・芹澤(松山)和世・芹澤如比古
    • 学会等名
      日本藻類学会第41回大会
    • 発表場所
      高知大学(高知)
    • 年月日
      2017-03-24
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 分離集団の薄いショットガンシーケンシングによるシャジクモ遺伝学的地図の構築2017

    • 著者名/発表者名
      西山智明・鎌田寛彬・宮田大輔・山口勝司・重信秀治・坂山英俊・笠原雅弘
    • 学会等名
      第58回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      鹿児島大学(鹿児島)
    • 年月日
      2017-03-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 精子を持つ植物で見つかったアデニル酸シクラーゼ2017

    • 著者名/発表者名
      笠原賢洋・末次憲之・浦野裕貴・山本千愛・大森未樹矢・高田侑季・奥田修二郎・西山智明・坂山英俊・河内 孝之・高橋文雄
    • 学会等名
      第58回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      鹿児島大学(鹿児島)
    • 年月日
      2017-03-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] De novo sequencing of Chara braunii genome and construction of genetic map2017

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama, T., Kamada, H., Miyata, D., Kasahara, M. and Sakayama, H.
    • 学会等名
      Advanced Genome Science International Symposium, The Start of New Genomics
    • 発表場所
      伊藤国際学術研究センター(東京)
    • 年月日
      2017-01-10
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] シャジクモの生殖器官のトランスクリプ トーム解析2016

    • 著者名/発表者名
      西山智明・坂山英俊
    • 学会等名
      日本植物学会第80回大会
    • 発表場所
      沖縄コンベンションセンター(沖縄)
    • 年月日
      2016-09-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] シャジクモの発生遺伝子の発現プロファイリングに関する研究2016

    • 著者名/発表者名
      渡邊みゆき・西山智明・鈴木 穣・坂山英俊
    • 学会等名
      日本植物学会第80回大会
    • 発表場所
      沖縄コンベンションセンター(沖縄)
    • 年月日
      2016-09-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 速度改変型ミオシン XI 導入による単子葉植物ブラキポ ディウムの成長促進2016

    • 著者名/発表者名
      原口武士・木下佳菜・玉那覇正典・坂山英俊・西山智明・富永基樹・伊藤光二
    • 学会等名
      日本植物学会第80回大会
    • 発表場所
      沖縄コンベンションセンター(沖縄)
    • 年月日
      2016-09-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 生物界最速ミオシンである Chara braunii (シャジクモ)のミオシンXIの機能解析2016

    • 著者名/発表者名
      玉那覇正典・原口武士・木下佳菜1・坂山英俊・西山智明・富永基樹・伊藤光二
    • 学会等名
      日本植物学会第80回大会
    • 発表場所
      沖縄コンベンションセンター(沖縄)
    • 年月日
      2016-09-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 藻類・陸上植物の細胞壁空間に ROS を産生する酵素 Rboh の分子進化2016

    • 著者名/発表者名
      板橋武・橋本研志・坂山英俊・西山智明・北畑信隆・Bonnot Clemence・Hetherington Sandy・Dolan Liam・朽津和幸
    • 学会等名
      日本植物学会第80回大会
    • 発表場所
      沖縄コンベンションセンター(沖縄)
    • 年月日
      2016-09-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Genome and transcriptome of charophytes2016

    • 著者名/発表者名
      Sakayama, H. & Nishiyama, T.
    • 学会等名
      7th International Research Group on Charophytes Symposium
    • 発表場所
      Astana, Kazakhstan
    • 年月日
      2016-08-31
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Charophytes, origin of land plants and terminology2016

    • 著者名/発表者名
      Garcia, A. & Sakayama, H.
    • 学会等名
      7th International Research Group on Charophytes Symposium
    • 発表場所
      Astana, Kazakhstan
    • 年月日
      2016-08-31
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Genomes of bryophytes and charophyceans2016

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama, T., Sakayama, H, & Sakakibara, K.
    • 学会等名
      ICAR 2016 International Conference on Arabidopsis Research
    • 発表場所
      Gyeongju, Korea
    • 年月日
      2016-06-29
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Evolutionary analyses on ecological differentiation of a cosmopolitan freshwater alga Chara braunii (Charales, Streptophyta)2016

    • 著者名/発表者名
      Sakayama, H., Miyata, D., Kato, S. & Nishiyama, T.
    • 学会等名
      EMBO Workshop, New model systems for early land plant evolution
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 年月日
      2016-06-22
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Genome sequencing charophyceans, liverworts, and hornworts: making model systems2016

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama, T., Sakayama, H, Sakakibara, K, et al.
    • 学会等名
      EMBO Workshop, New model systems for early land plant evolution
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 年月日
      2016-06-22
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2023-01-30  

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