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Indelマーカーの開発による家畜ウシの遺伝子流入の新たな推定法の確立と起源解明

研究課題

研究課題/領域番号 16K15025
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 動物生産科学
研究機関神戸大学

研究代表者

万年 英之  神戸大学, 農学研究科, 教授 (20263395)

研究分担者 下桐 猛  鹿児島大学, 農水産獣医学域農学系, 准教授 (40315403)
笹崎 晋史  神戸大学, 農学研究科, 准教授 (50457115)
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2017年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2016年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワードウシ / Indel / 起源 / 遺伝的流入 / 遺伝的混在 / 遺伝的構造 / Indelマーカー / 北方系牛 / インド系牛 / 系統分化 / 分岐年代推定 / 育種
研究成果の概要

本課題では、家畜ウシにおける不可逆性Indel多型マーカーによる遺伝子流入の新たな推定法を確立し、家畜ウシ2亜種の家畜化初期における遺伝子流入の可能性と交雑程度を推定する。
インド系ウシ3頭を用いた全ゲノムリシーケンスを実施し、50bp以上のIndel長かつ各常染色体から合計58のマーカーを開発した。これらのIndelのうち、43 Indelで変異が認められた。この変異の分布を詳細に調査したところ、北方系ウシでは比較的変異が固定しているが、インド系ウシでは亜種内で変異を持つ割合が高いことが示され、インド系ウシにおいて家畜化の初期段階で北方系ウシとの遺伝的混在があったことを示唆していた。

報告書

(3件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2018 2017 2016

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 3件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Application of DNA markers for discrimination between Japanese and Australian Wagyu beef2018

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi, F., Kitamura Y., Nakajima R., Takahashi M., Goto H., Washida Y., Yamamoto Y., Sasazaki S., and Mannnen H.
    • 雑誌名

      Animal Science Journal

      巻: 89 号: 1 ページ: 257-258

    • DOI

      10.1111/asj.12938

    • NAID

      120006601535

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The mtDNA haplogroup P of modern Asian cattle: A genetic legacy of Asian aurochs?2018

    • 著者名/発表者名
      Noda Aoi、Yonesaka Riku、Sasazaki Shinji、Mannen Hideyuki
    • 雑誌名

      PLOS One

      巻: 13 号: 1 ページ: e0190937-e0190937

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0190937

    • NAID

      120006382348

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Low mitochondrial DNA diversity of Japanese Polled and Kuchinoshima feral cattle2017

    • 著者名/発表者名
      Mannen Hideyuki、Yonesaka Riku、Noda Aoi、Shimogiri Takeshi、Oshima Ichiro、Katahira Kiyomi、Kanemaki Misao、Kunieda Tetsuo、Inayoshi Yousuke、Mukai Fumio、Sasazaki Shinji
    • 雑誌名

      Anim. Sci. J.

      巻: 88 号: 5 ページ: 739-744

    • DOI

      10.1111/asj.12716

    • NAID

      120006601534

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Genetic structure and relationships among 11 cattle populations using indel markers2017

    • 著者名/発表者名
      Yamanaka H, Sasazaki S, Lwin M, Moe H, Shimogiri T, Mannen H
    • 学会等名
      36th International Society for Animal Genetics Conference. Dublin, Ireland
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Phylogenetic analysis of Kazakhstani goats using mtDNA HV1 and SRY gene sequences2017

    • 著者名/発表者名
      Tabata R, Sasazaki S, Bakhtin M, Kazymbet P, Alyan M, Suleimenov M, Nishibori M, Mannen H
    • 学会等名
      International Society for Animal Genetics Conference. Dublin, Ireland
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Indelマーカーを用いた家畜ウシ11集団に対する遺伝的構造および系統解析2017

    • 著者名/発表者名
      山中颯・笹崎晋史・Hla Hla Moe・Moe Lwin・下桐猛・万年英之
    • 学会等名
      第67回関西畜産学会大会, 大阪
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Genetic diversity and origin of mtDNA haplogroup P observed in Japanese Shorthorn2016

    • 著者名/発表者名
      Noda A, Sasazaki S, Mannen H
    • 学会等名
      35th International Society for Animal Genetics Conference
    • 発表場所
      Salt Lake City, UT, USA
    • 年月日
      2016-07-23
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [図書] 動物遺伝育種学2017

    • 著者名/発表者名
      万年英之 他
    • 総ページ数
      204
    • 出版者
      朝倉書店
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2019-03-29  

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