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Dicer蛋白質の機能ドメイン分析とその機能分化の進化的解析

研究課題

研究課題/領域番号 17026025
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関神戸大学

研究代表者

中屋敷 均  神戸大学, 農学部, 助教授 (50252804)

研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
4,900千円 (直接経費: 4,900千円)
2006年度: 2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
2005年度: 2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
キーワードRNAサイレンシング / RNAi / Dicer / 糸状菌
研究概要

RNAサイレンシングは、ほとんどの真核生物に広く保存されている配列特異的な遺伝子発現抑制機構である。Dicer蛋白質はそのRNAサイレンシング経路の鍵酵素であり、塩基配列特異的な情報を伝達するための20-26bp程度のsiRNAと呼ばれる小さなRNAの生成を担う機能を持っている。
本研究では、糸状菌であるイネいもち病菌ゲノムに存在する二つのDicer様蛋白質MDL1とMDL2の機能分化の解析とその進化的な保存性について調査することを目的としている。これまでにいもち病菌ではMDL2がRNAサイレンシング経路に関与することが示されたが、MDL1およびMDL2の菌糸におけるmRNA蓄積量をリアルタイムPCRを用いて調査した所、MDL2 mRNAは、MDL1 mRNAの約15倍蓄積していることが示された。また、RNAサイレンシング能を失っているMDL2破壊株でMDL1 cDNAを強発現させると効率は低いものの部分的にRNAサイレンシングを相補することが明らかとなり、いもち病菌におけるMDL1とMDL2の機能分化には、蛋白質自体の分化と共に転写コントロールが重要な働きを持っていることが示された。
また、多くの種でゲノムが解読されつっある糸状菌において、Dicer遺伝子の分子系統解析を行った所、MDL1とMDL2は、子のう菌や担子菌といった糸状菌門が分かれる以前に分化していることが示唆された。このことから、これらパラログは、進化的に古くから存在し、基本的には異なった機能を持つものの、なお互いに相補できる余地は残しているものと考えられた。

報告書

(2件)
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2007 2006 2005 その他

すべて 雑誌論文 (7件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Evolution and diversification of RNA silencing proteins in fungi2006

    • 著者名/発表者名
      Nakayashiki H. et al.
    • 雑誌名

      J. Mol. Evol 63

      ページ: 127-135

    • NAID

      120000949568

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Specific cleavage of ribosomal RNA and mRNA during victorin-induced apoptotic cell death in oat2006

    • 著者名/発表者名
      Hoat, T. et al.
    • 雑誌名

      Plant J. 46

      ページ: 922-933

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] The C-terminal chromodomain-like module in the integrase domain is crucial for high transposition efficiency of the retrotransposon MAGGY2005

    • 著者名/発表者名
      Nakayashiki, H.et al.
    • 雑誌名

      FEBS letters 579

      ページ: 488-492

    • NAID

      120000942509

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] RNA silencing as a tool for exploring gene function in Ascomycete fungi2005

    • 著者名/発表者名
      Nakayashiki, H.et al.
    • 雑誌名

      Fungal Genet.& Biol. 42

      ページ: 275-283

    • NAID

      120000942198

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] RNA silencing in fungi : Mechanisms and applications2005

    • 著者名/発表者名
      Nakayashiki H
    • 雑誌名

      FEBS letters 579

      ページ: 5950-5957

    • NAID

      120000943890

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Evolution and diversification of RNA silencing proteins in fungi

    • 著者名/発表者名
      Nakayashiki, H.et al.
    • 雑誌名

      J.Mol.Evol In press

    • NAID

      120000949568

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Specific cleavage of ribosomal RNA and mRNA during victorin-induced apoptotic cell death in oat

    • 著者名/発表者名
      Hoat, T.et al.
    • 雑誌名

      Plant J. In press

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [図書] RNA interference (RNAi) (eds. M. Latterich)2007

    • 著者名/発表者名
      Nakayashiki, H.
    • 出版者
      Taylor and Francis. UK(in press)
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2018-03-28  

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