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タンパク質分子と集合体の機能化デザイン

研究課題

研究課題/領域番号 18031026
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関神戸大学

研究代表者

田村 厚夫  神戸大学, 理学研究科, 准教授 (90273797)

研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
12,200千円 (直接経費: 12,200千円)
2007年度: 6,600千円 (直接経費: 6,600千円)
2006年度: 5,600千円 (直接経費: 5,600千円)
キーワードタンパク質 / デザイン / ナノファイバー / 抗菌ペプチド / ナノチューブ / 生体材料 / 生物・生体工学 / 生物物理 / ナノ材料 / ナノバイオ
研究概要

タンパク質の人工設計を行う際、2つの視点を持っている。一つ目は、なぜ自然界のタンパク質は自動的に折りたたまって立体構造を形成し機能を果たすかという基本的な問題の解決を目指す視点である。このため、人工的に1つの因子に着目した人工タンパク質を設計し、自然界では隠された本質を探るものである。二つ目は、理由の如何にかかわらずとにかく人工的に機能化を果たし、その結果を振り返ることで構造機能についての理解を深めるという視点である。一つ目の視点としては、以下の2点について研究を行っている。
1)溶解度と構造形成との相関:タンパク質の立体構造がなぜ形成されてきたのか、特に進化的にいきなり機能を持った構造ができたのかどうかについて、「溶解度」の点から考察した。
2)機能と構造パラメーター(熱力学量を含む)との相関:機能の一例として、抗菌活性を取り上げ、ペプチドを設計し、その構造、疎水性などのパラメーターと機能との相関を探った。
また、二つ目の視点としては、以下の2点に着目した。
3)機能性ナノ構造体:ペプチドを環状化したものを、アミロイド線維のようにβシート様水素結合で積層化することで、中空のナノチューブを形成させた。
4)タンパク質機能の制御を設計に適用:構造転移能を持った機能性タンパク質として、ガン化に関与する小型Gタンパク質Rasおよびその類縁タンパク質を取り上げ、その構造多型を主としてNMR測定によって明らかにした。

報告書

(2件)
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2008 2007 2006

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 3件)

  • [雑誌論文] Two conformational states of Ras GTPase exhibit differential GTP-binding kinetics2008

    • 著者名/発表者名
      Jingling Liao, 他9名
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Comm. 369

      ページ: 327-332

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] NMR based structure-activity relationship analysis of an antimic robial peptide, thanatin, engineered by site-specific chemical modification: activity improvement and spectrum alteration2008

    • 著者名/発表者名
      T. Imamura, 他6名
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Comm. 369

      ページ: 609-615

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transformation of an α-helix peptide into a β-hairpin induced by addition of a fragment results in creation of a coexisting state.2007

    • 著者名/発表者名
      Mitsugu Araki, & Atsuo Tamura
    • 雑誌名

      Proteins: Struct., Funct., Bioinformatics 68

      ページ: 860-868

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transformation of an α-helix peptide into a β-hairpin induced by addition of a fragment results in creation of a coexisting state.2007

    • 著者名/発表者名
      Mitsugu Araki
    • 雑誌名

      Proteins : Struct., Funct., Bioinformatics 66

      ページ: 860-868

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Characterization of heme-coordinating histidyl residues of cytochrome b5 based on the reactivity with diethylpyrocarbonate : A mechanism for the opening of axial imidazole rings.2006

    • 著者名/発表者名
      Nobuyuki Nakanishi
    • 雑誌名

      J. Biochem 140

      ページ: 561-571

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2018-03-28  

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