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ゲノムリシーケンスデータに基づくウシ脂肪交雑を支配する遺伝子変異の網羅的探索

研究課題

研究課題/領域番号 18K05945
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分42010:動物生産科学関連
研究機関神戸大学

研究代表者

笹崎 晋史  神戸大学, 農学研究科, 准教授 (50457115)

研究分担者 万年 英之  神戸大学, 農学研究科, 教授 (20263395)
大山 憲二  神戸大学, 農学研究科, 教授 (70322203)
研究期間 (年度) 2018-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2020年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2019年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2018年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード和牛 / 脂肪交雑 / 遺伝子 / ゲノムリシーケンス / 黒毛和種 / ウシ
研究成果の概要

GWASにより同定された脂肪交雑に対する候補領域について、ゲノムリシーケンスにより領域に存在する変異の網羅的探索を行った。サンプルの8個体とデータベース上のヘレフォードの塩基配列を比較したところ、127,090個の多型を検出した。そのうち遺伝子の機能について調査し、いくつかを原因候補多型として抽出した。その中でも唯一アミノ酸置換であったSLC27A6遺伝子のK81M多型について、兵庫県黒毛和種集団904個体を用いてロース脂肪割合に対する効果を調査した結果、p値はp = 0.0009となり、本多型がロース脂肪割合に対して非常に高い効果を持つことが確認された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

和牛の脂肪交雑を支配する遺伝子および遺伝子変異を同定するべく、これまでに国内外を問わず多くの研究がなされてきたが、脂肪交雑を支配する主要な責任遺伝子および変異は未だ解明されていない。本研究の結果、7番染色体の当該領域に脂肪交雑の有力なQTLが存在し、SLC27A6遺伝子のK81M多型は兵庫県集団においては非常に有力なマーカーとなることが示された。以上、我が国を代表する黒毛和種の象徴である脂肪交雑についてその遺伝的要因の解明、および脂肪交雑をコントロールすることのできるDNAマーカーの開発に向けて、本研究の結果は有益な情報となりえると考えられる。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2020 2019

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Detection of candidate polymorphisms around the QTL for fat area ratio to rib eye area on BTA7 using whole-genome resequencing in Japanese Black cattle2020

    • 著者名/発表者名
      Shinji SASAZAKI, Fuki KAWAGUCHI, Ayaka NAKAJIMA, Takayuki AKIYAMA, Namiko KOHAMA, Emi YOSHIDA, Eiji KOBAYASHI, Takeshi HONDA, Kenji OYAMA, Hideyuki MANNEN
    • 雑誌名

      Animal Science Journal

      巻: - 号: 1

    • DOI

      10.1111/asj.13335

    • NAID

      120006954042

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 集積流体回路を用いた兵庫県黒毛和種集団におけるロース脂肪割合候補多型の効果の検証2020

    • 著者名/発表者名
      近藤陽菜、小浜 菜美子、秋山 敬孝、吉田 恵実、小林 栄治、川口芙岐、万年英之、笹崎晋史
    • 学会等名
      第21回日本動物遺伝育種学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Validation of candidate SNPs for fat percentage in bovine rib-eye area using Integrated Fluidic Circuit2019

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto R; Toyomoto S; Kohama N; Akiyama T; Yoshida E; Kobayashi E; Oyama K; Mannen H; Sasazaki S
    • 学会等名
      37th International Society for Animal Genetics Conference
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 複数の黒毛和種集団を用いたSLC27A6遺伝子多型のBMSに対する効果の検討2019

    • 著者名/発表者名
      山本雷斗
    • 学会等名
      第125回日本畜産学会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2018-04-23   更新日: 2022-01-27  

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