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遺伝子発現マイクロアレーを用いた中皮腫の遺伝子発現の解析・メチル化遺伝子の探索

研究課題

研究課題/領域番号 19590350
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 人体病理学
研究機関広島大学

研究代表者

アマティア ヴィシュワジー (AMATYA VISHWA J)  広島大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 助教 (90403625)

研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2008年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2007年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワード中皮腫 / 遺伝子発現 / GeneChip / マイクロアレイ / Genechip / メチル化
研究概要

凍結材料を用いた研究では、中皮腫と肺腺癌の間で統計学的有意差を持って発現異常のみられる遺伝子のクラスター化を行い、中皮腫では肺腺癌と比較して、231遺伝子の過剰発現、64遺伝子の発現低下が見られた。
FFPE材料を用いた研究では、中皮腫と非腫瘍肺組織の間で統計学的に有意差をもって発現異常の見られる遺伝子のクラスター化を行い、中皮腫では266遺伝子の過剰発現と948遺伝子の発現低下があることが判明した。過剰発現のある遺伝子には、Calbindin2(Calretinin)、Keratin5、PDGF、Ki-67などが含まれ、ホルマリン固定パラフィン包埋材料からでも十分に遺伝子異常の有無を検討できることがわかった。これらの遺伝子の中でReal Time定量RT-PCR法にて、NDRG-1、RARRES-1及びHAS-1遺伝子のmRNAの発現が非腫瘍肺組織と比べ中皮腫には過剰であることが判明した。また、Wnt-signal経路に関する遺伝子では、WIF1、MMP7、β-cateninなどの発現低下とCaM kinase、Nemo-like Kinaseなどの過剰発現を認めた。メチル化及び非メチル化特異的プライマーを用いたMethylation Specific PCRでは、中皮腫の76%と非腫瘍性肺組織の32%にはWIF-1プロモーター領域のメチル化を認め、WIF-1の発現減少はメチル化によるものと考えた。

報告書

(3件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (7件)

  • [雑誌論文] Caveolin-1 is a novel immunohistochemical marker to differentiate epithelioid mesothelioma from lung adenocarcinoma2009

    • 著者名/発表者名
      Amatya VJ, Takeshima Y, Kohno H, Kushitani K, Yamada T, Chikao Morimoto C, Inai K.
    • 雑誌名

      Histopathology (In Press)

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Value of immunohistochemistry in the Differential Diagnosis of Pleural Sarcomatoid Mesothelioma from Lung Sarcomatoid Carcinoma2009

    • 著者名/発表者名
      Takeshima Y, Amatya VJ, Kushitani K, Kaneko M, Inai K.
    • 雑誌名

      Histopathology 54

      ページ: 667-676

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 中皮腫発生に関わるエピジェネティクス2009

    • 著者名/発表者名
      河野秀和、Amatya VJ、武島幸男、井内康輝
    • 雑誌名

      MOOK「肺癌の臨床2008~2009」

      ページ: 353-360

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] 中皮腫発生に関わるエピジェネティクス2008

    • 著者名/発表者名
      河野秀和
    • 雑誌名

      MOOK肺癌の臨床2008〜2009 5

      ページ: 342-352

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] 中皮腫の遺伝子異常-マイクロアレイを用いた網羅的解析2007

    • 著者名/発表者名
      Amatya VJ、武島幸男、井内康輝
    • 雑誌名

      MOOK「肺癌の臨床2007~2008」

      ページ: 281-291

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Caveolin-1 is a novel immunohistochemical marker to differentiate epithelioid mesothelioma from lung adenocarcinoma

    • 著者名/発表者名
      AMATYA VISHWA J
    • 雑誌名

      Histopathology (In press)

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Caveolin-1, a novel marker, differentiated epithelioid mesothelioma from lung adenocarcinoma2008

    • 著者名/発表者名
      Vishwa Jeet Amatya、武島幸男、櫛谷桂、河野秀和、井内康輝
    • 学会等名
      第49回日本肺癌学会総会演説
    • 発表場所
      北九州市
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Caveolin-1 is a novel immunohistochemical marker of malignant mesothelioma and differentiated epithelioid mesothelioma from lung adenocarcinoma2008

    • 著者名/発表者名
      Amatya VJ, Takeshima Y, Kohno H, Kushitani K, Yamada T, Morimoto C and Inai K
    • 学会等名
      The 9th International Conference of the International Mesothelioma Interest Group Congress
    • 発表場所
      Amsterdam, Netherlands
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書 2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Caveolin-1 (CAV1) is novel marker of epithelioid mesothelioma (EM) for differentiating it from lung adenocarcinoma (LAC)2008

    • 著者名/発表者名
      Vishwa Jeet Amatya、河野秀和、櫛谷桂、武島幸男、井内康輝
    • 学会等名
      第47回日本肺癌学会中国・四国支部会演説
    • 発表場所
      高知市
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] CD26 and Caveolin-1 expression in malignant mesothelioma and lung adenocarcinoma2008

    • 著者名/発表者名
      Vishwa Jeet Amatya、武島幸男、櫛谷桂、河野秀和、金龍男、井内康輝
    • 学会等名
      第97回日本病理学会総会示説
    • 発表場所
      金沢市
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Gene expression analysis of malignant mesothelioma using FFPE samples2007

    • 著者名/発表者名
      Vishwa Jeet Amatya、武島幸男、櫛谷桂、河野秀和、井内康輝
    • 学会等名
      第48回日本肺癌学会総会示説
    • 発表場所
      名古屋市
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Gene expression analysis of malignant mesothelioma (FFPE samples) using gene chip X3P array2007

    • 著者名/発表者名
      Vishwa Jeet Amatya、武島幸男、櫛谷桂、河野秀和、井内康輝
    • 学会等名
      第96回日本病理学会総会示説
    • 発表場所
      大阪市
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Gene Expression Analysis of malignant mesothelioma using FFPE samples2007

    • 著者名/発表者名
      AMATYA Vishwa J
    • 学会等名
      第48回日本肺癌学会総会
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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