• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

放線菌二次代謝産物の分子構築機構および生産制御システムの包括的解析

研究課題

研究課題/領域番号 22580121
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物生産化学・生物有機化学
研究機関広島大学

研究代表者

荒川 賢治  広島大学, 大学院・先端物質科学研究科, 准教授 (80346527)

研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2012年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2010年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード放線菌 / ポリケチド / 生合成 / ピロロキノリンキノン / 制御遺伝子 / オートレギュレーター / 転写活性化因子 / ゲノムマイニング / アゾキシアルケン / ケト還元酵素 / ポリエンマクロライド / ブテノライド
研究概要

放線菌Streptomyces rochei7434AN4株が生産する2つのポリケチド抗生物質ランカサイジン(LC), ランカマイシン(LM) の生合成および制御システムの包括的解析を行った。LM生合成クラスターにコードされたII型チオエステラーゼ遺伝子lkmEの遺伝子破壊株は、15-nor-LM誘導体を蓄積した。これにより、LkmEは誤って導入されたLMスターター基質を加水分解する役割をもつことが示唆された。また、LC,LM生産を誘導するシグナル分子SRBを培養液160リットルから単離し、化学合成を組み合わせて構造決定を行った。またSARP型転写活性化因子srrY がもうひとつのSARP遺伝子srrZのプロモーター上流に結合することを明らかにし、これによりLM生合成の活性化機構が解明できた。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (55件)

すべて 2013 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (14件) (うち査読あり 12件) 学会発表 (37件) (うち招待講演 3件) 備考 (4件)

  • [雑誌論文] The butenolide signaling molecules SRB1 and SRB2 induce lankacidin and lankamycin production in Streptomyces rochei2012

    • 著者名/発表者名
      K. Arakawa, N. Tsuda, A. Taniguchi, H. Kinashi
    • 雑誌名

      ChemBioChem

      巻: 13 ページ: 1447-1457

    • NAID

      120006799348

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation of borrelidin as a phytotoxic compound from a potato pathogenic Streptomycesstrain2012

    • 著者名/発表者名
      Z. Cao, G. Khodakaramian, K. Arakawa, H. Kinashi
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem

      巻: 76 ページ: 353-357

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation of Borrelidin as a Phytotoxic Compound from a Potato Pathogenic Streptomyces Strain2012

    • 著者名/発表者名
      曹 志生
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 76 号: 2 ページ: 353-357

    • DOI

      10.1271/bbb.110799

    • NAID

      10030400084

    • ISSN
      0916-8451, 1347-6947
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Indomethacin Induction of Metamorphosis from the Asexual Stage to Sexual Stage in the Moon Jellyfish, <i>Aurelia aurita</i>2012

    • 著者名/発表者名
      国吉 久人
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 76 号: 7 ページ: 1397-1400

    • DOI

      10.1271/bbb.120076

    • NAID

      130001862721

    • ISSN
      0916-8451, 1347-6947
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Diversity between PKS and FAS2012

    • 著者名/発表者名
      荒川 賢治
    • 雑誌名

      Nature Chem. Biol.

      巻: 8 号: 7 ページ: 604-605

    • DOI

      10.1038/nchembio.1007

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] Crystal structure of the synergistic antibiotic pair, lankamycin and lankacidin, in complex with the large ribosomal subunit2011

    • 著者名/発表者名
      M. J. Belousoff, T. Shapira, A. Bashan, E. Zimmerman, H. Rozenberg, K. Arakawa, H. Kinashi, A. Yonath
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      巻: 108 ページ: 2717-2722

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation, structural elucidation, and biosynthesis of 15-norlankamycin derivatives produced by a type-II thioesterase disruptant of Streptomyces rochei2011

    • 著者名/発表者名
      K. Arakawa, Z. Cao, N. Suzuki, H. Kinashi
    • 雑誌名

      Tetrahedron

      巻: 67 ページ: 5199-5205

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] pSLA2-M of Streptomyces rocheiis a composite linear plasmid characterized by self-defense genes and homology with pSLA2-L2011

    • 著者名/発表者名
      Y. Yang, T. Kurokawa, Y. Takahama, Y. Nindita, S. Mochizuki, K. Arakawa, S. Endo, H. Kinashi
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem

      巻: 75 ページ: 1147-1153

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] pSLA2-M of Streptomyces rochei Is a Composite Linear Plasmid Characterized by Self-Defense Genes and Homology with pSLA2-L2011

    • 著者名/発表者名
      楊英杰
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 75 号: 6 ページ: 1147-1153

    • DOI

      10.1271/bbb.110054

    • NAID

      10029328316

    • ISSN
      0916-8451, 1347-6947
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The biosynthesis of 3-amino-5-hydroxybenzoic acid (AHBA), the precursor of mC_7N-units in ansamycin and mitomycin antibiotics-A review2011

    • 著者名/発表者名
      Heinz G.Floss
    • 雑誌名

      Journal of Antibiotics

      巻: 64 ページ: 35-44

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the synergistic antibiotic pair, lankamycin and lankacidin, in complex with the large ribosomal subunit2011

    • 著者名/発表者名
      Matthew J.Belousoff
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

      巻: 108 ページ: 2717-2722

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Regulation of lankamycin biosynthesis in Streptomyces rocheiby two SARP genes, srrYand srrZ2010

    • 著者名/発表者名
      T. Suzuki, S. Mochizuki, S. Yamamoto, K. Arakawa, H. Kinashi
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem

      巻: 74 ページ: 819-827

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Regulation of lankamycin biosynthesis in Streptomyces rochei by two SARP genes, srrY and srrZ2010

    • 著者名/発表者名
      鈴木敏弘
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 74 ページ: 819-827

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of the biosynthetic gene clusters located on the Streptomyces linear plasmid2010

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 雑誌名

      Actinomycetologica

      巻: 24 ページ: 24-30

    • NAID

      10026449394

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 放線菌線状プラスミドにコードされた抗生物質生合成クラスターの遺伝学的・生物有機化学的解析2013

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      日本農芸化学会・農芸化学奨励賞
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2013-03-24
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 放線菌線状プラスミドにコードされた抗生物質生合成クラスターの遺伝学的・生物有機化学的解析2013

    • 著者名/発表者名
      荒川 賢治
    • 学会等名
      2013年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 放線菌Streptomyces rocheiの抗生物質生産を誘導するシグナル分子SRBの生合成機構2013

    • 著者名/発表者名
      津田 直人
    • 学会等名
      2013年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Streptomyces rocheiの多重遺伝子破壊株が生産する代謝産物の化学構造および生合成機構の解析2013

    • 著者名/発表者名
      國武 博文
    • 学会等名
      2013年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 抗生物質ランカサイジン生合成におけるピロロキノリンキノン要求性デヒドロゲナーゼの機能解析2013

    • 著者名/発表者名
      山内 佑介
    • 学会等名
      2013年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 放線菌Streptomyces rocheiのPQQ破壊株が生産する抗カビ化合物ペンタマイシンの解析2013

    • 著者名/発表者名
      片岡 憂祐
    • 学会等名
      2013年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of the essential gene for a linear topology of the Streptomyces rochei replicons2013

    • 著者名/発表者名
      Yosi NINDITA
    • 学会等名
      2013年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Isolation, structural elucidation, and biosynthesis of butenolide signaling molecules that induce lankacidin and lankamycin production in Streptomycesrochei2012

    • 著者名/発表者名
      K. Arakawa, N. Tsuda, A. Taniguchi, H. Kinashi
    • 学会等名
      International Conference of Natural Products Biosynthesis
    • 発表場所
      淡路島
    • 年月日
      2012-06-18
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Streptomyces rochei 7434AN4株の線状染色体の塩基配列解析2012

    • 著者名/発表者名
      曹志生
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都女子大(京都市)
    • 年月日
      2012-03-24
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Streptomyces rocheiのPQQ生合成遺伝子破壊株の代謝産物解析2012

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都女子大(京都市)
    • 年月日
      2012-03-23
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Isolation, structural elucidation, and biosynthesis of butenolide signaling molecules that induce lankacidin and lankamycin production in Streptomyces rochei2012

    • 著者名/発表者名
      荒川 賢治
    • 学会等名
      International Conference of Natural Products Biosynthesis (ICNPB)
    • 発表場所
      淡路島
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Biosynthesis of the butenolide signaling molecules that induce lankacidin and lankamycin production in Streptomyces rochei2012

    • 著者名/発表者名
      荒川 賢治
    • 学会等名
      8th Meeting on Natural Product Biosynthesis
    • 発表場所
      静岡県立大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Analysis of the circularization of the linear chromosome of Streptomyces rochei2012

    • 著者名/発表者名
      Yosi NINDITA
    • 学会等名
      2012年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      東京・府中
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Streptomyces rochei変異株が生産する抗カビ化合物ペンタマイシンの単離および生合成クラスターの解析2012

    • 著者名/発表者名
      片岡 憂祐
    • 学会等名
      2012年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      東京・府中
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 放線菌Streptomyces rocheiの抗生物質生産を誘導するシグナル分子SRBの生合成機構に関する研究2012

    • 著者名/発表者名
      津田 直人
    • 学会等名
      2012年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      東京・府中
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 放線菌Streptomyces rochei 7434AN4株の抗生物質生産を誘導するブテノライド型シグナル分子の単離・構造決定および生物活性2012

    • 著者名/発表者名
      荒川 賢治
    • 学会等名
      第64回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 放線菌Streptomyces rocheiのPQQ遺伝子破壊株における代謝産物解析2011

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      第7回生合成勉強会
    • 発表場所
      東京工業大学(東京都目黒区)(招待講演)
    • 年月日
      2011-12-26
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Isolation, structural elucidation, and biological activity of the novel γ-butenolide signaling molecules SRBs that elicit antibiotic production in Streptomyces rochei 7434AN42011

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      The 16^<th> International Symposium on the Biology of Actinomycetes
    • 発表場所
      メキシコ合衆国プエルトバジャルタ
    • 年月日
      2011-12-12
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 14員環マクロライド抗生物質ランカマイシンの生合成経路2011

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      第48回天然有機化合物討論会
    • 発表場所
      大阪国際交流センター(大阪市)
    • 年月日
      2011-09-27
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Isolation and structural elucidation of the novel ・-butenolide signaling molecules SRBs that switch on antibiotic production in Streptomyces rochei7434AN42011

    • 著者名/発表者名
      K. Arakawa, A. Taniguchi, N. Tsuda, H. Kinashi
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2011-09-08
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Isolation and structural elucidation of the novel γ-butenolide signaling molecules SRBs that switch on antibiotic production in Streptomyces rochei 7434AN42011

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • 年月日
      2011-09-08
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of the terminal sequence, deletion, and circularization of the linear chromosome of Streptomyces rochei2011

    • 著者名/発表者名
      曹志生
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • 年月日
      2011-09-08
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] The role of two repressor genes, srrB and srrC, for the production of secondatv metabolites in Streptomyces rochei2011

    • 著者名/発表者名
      津田直人
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • 年月日
      2011-09-08
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 抗生物質生産を誘導するシグナル分子の単離・構造決定およびその生合成2011

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      第6回生合成勉強会
    • 発表場所
      理化学研究所(埼玉県和光市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-07-02
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Streptomyces rochei 7434AN4株の抗生物質生産を誘導する新規γ-butenolideシグナル分子SRBの単離・構造決定および生物活性2011

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都女子大(京都市)
    • 年月日
      2011-03-27
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Streptomyces rochei7434AN4株の線状染色体の塩基配列解析2011

    • 著者名/発表者名
      曹志生
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都女子大(京都市)
    • 年月日
      2011-03-26
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 放線菌Streptomyces rochei7434AN4株の二次代謝シグナル伝達経路におけるTetR型リプレッサーの役割2011

    • 著者名/発表者名
      日野出嵩裕
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都女子大(京都市)
    • 年月日
      2011-03-26
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Biosynthesis of the 17-membered polyketide antibiotic lankacidin produced by Streptomyces rochei7434AN42010

    • 著者名/発表者名
      K. Arakawa, S. Tatsuno, H. Kinashi
    • 学会等名
      Pacifichem 2010 Congress
    • 発表場所
      米国ハワイ州ホノルル
    • 年月日
      2010-12-15
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Biosynthesis of the 17-membered polyketide antibiotic lankacidin produced by Streptomyces rochei 7434AN42010

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      Pacifichem 2010 Congress
    • 発表場所
      米国ハワイ州ホノルル
    • 年月日
      2010-12-15
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 二次代謝および形態分化に関与する放線菌線状プラスミドの解析2010

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      微化研セミナー
    • 発表場所
      微生物化学研究所(東京都品川区)(招待講演)
    • 年月日
      2010-10-01
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Streptomyces rochei7434AN4株の線状染色体の構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      曹志生
    • 学会等名
      2010年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      東京都江戸川区
    • 年月日
      2010-09-03
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Streptomyces rocheiの抗生物質生合成におけるTetR型リプレッサーSrrBの機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      鈴木敏弘
    • 学会等名
      2010年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      東京都江戸川区
    • 年月日
      2010-09-02
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] ランカマイシン生合成に関与する水酸化酵素LkmFの基質特異性の解析2010

    • 著者名/発表者名
      近藤寿志
    • 学会等名
      2010年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      東京都江戸川区
    • 年月日
      2010-09-02
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 放線菌Streptomyces rochei 7434AN4株の生産する抗生物質の生合成機構解析2010

    • 著者名/発表者名
      荒川賢治
    • 学会等名
      2010年度生合成勉強会
    • 発表場所
      東京大学薬学部(東京都文京区)(招待講演)
    • 年月日
      2010-07-10
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Streptomyces rocheiの抗生物質生合成における転写活性化機構の解析2010

    • 著者名/発表者名
      鈴木敏弘
    • 学会等名
      日本農芸化学会第27回中四国支部会
    • 発表場所
      広島大学(東広島市)
    • 年月日
      2010-06-05
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Streptomyces rochei 7434AN4株の線状ゲノムの末端構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      曹志生
    • 学会等名
      日本農芸化学会第27回中四国支部会
    • 発表場所
      広島大学(東広島市)
    • 年月日
      2010-06-05
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of the genes essential for a linear topology of Streptomyces replicons2010

    • 著者名/発表者名
      Yosi NINDITA
    • 学会等名
      日本農芸化学会第27回中四国支部会
    • 発表場所
      広島大学(東広島市)
    • 年月日
      2010-06-05
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://home.hiroshima-u.ac.jp/mbiotech/5lab/index.html

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [備考] 研究室のホームページ

    • URL

      http://home.hiroshima-u.ac.jp/mbiotech/5lab/index.html

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [備考] 研究室のホームページ

    • URL

      http://home.hiroshima-u.ac.jp/mbiotech/5lab/index.html

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考] 研究室のホームページ

    • URL

      http://home.hiroshima-u.ac.jp/mbiotech/hosenkin_lab/hosen_lab.html

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

URL: 

公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi