高度に新規な「ゆっくり増える菌」の系統分類および生物地理に関する研究

• 研究課題/領域番号: 23570117
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 広島大学
• 研究代表者: 長沼 毅 広島大学, 生物圏科学研究科, 准教授 (70263738)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円); 2013年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2011年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: 分類群 / 微生物 / ゆっくり増える菌 / 生物地理 / チュニジア / サハラ砂漠 / 系統進化

研究概要

チュニジアから単離した菌株（Shr3株）は、既知のどの菌とも16S rRNA遺伝子の相同性が最大82％しかない好気性の細菌である。これに近縁な環境細菌2種と合わせた3株について、生理生化学的特性を明らかにし、その系統進化と生物地理に関する知見を得るために、様々な実験や分析を行い、データ収集・解析を行った。その結果、Shr3 がProteobacteria門に帰属する既知の菌群とは系統的に異なる非常に高いレベルの新規分類群であることを確認し、Shr3株を英国微生物菌株保存機関 NCIMB に寄託した。環境細菌2種についても、新規分類群であることを確認し、Shr3と併せて学術論文として発表した。

研究成果

• [雑誌論文] Phylogeographic analysis of filterable bacteria with special reference to Rhizobiales strains that occur at cryospheric habitats (2013)
  • 著者名/発表者名: NAKAI Ryosuke, SHIBUYA Eri, JUSTEL Ana, RICO Eugenio, QUESADA Antonio, KOBAYASHI Fumihisa, IWASAKA Yasunobu, SHI Guang-Yu, AMANO Yuki, IWATSUKI Teruki, NAGANUMA Takeshi.
  • 雑誌名: Antarctic Science 巻: 25 ページ: 219-228
  • 査読あり
• [雑誌論文] Biogeographical note on Antarctic microflorae : endemism and cosmopolitanism (2013)
  • 著者名/発表者名: JADOON Waqar Azeem, NAKAI Ryosuke, NAGANUMA Takeshi.
  • 雑誌名: Geoscience Frontiers 巻: 4 (2012, online) ページ: 633-646
  • 査読あり
• [雑誌論文] Biogeographical note on Antarctic microflorae : endemism and cosmopolitanism. (2013)
  • 著者名/発表者名: Jadoon WA, Nakai R, Naganuma T
  • 雑誌名: Geoscience Frontiers 巻: (in press) 号: 6 ページ: 633-646
  • DOI: 10.1016/j.gsf.2012.11.002
  • 査読あり