• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

真核系無細胞翻訳システムを利用したshunting基盤人工リボスイッチの開発

公募研究

研究領域動的・多要素な生体分子ネットワークを理解するための合成生物学の基盤構築
研究課題/領域番号 24119510
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 複合領域
研究機関愛媛大学

研究代表者

小川 敦司  愛媛大学, プロテオサイエンスセンター, 准教授 (30442940)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
11,050千円 (直接経費: 8,500千円、間接経費: 2,550千円)
2013年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2012年度: 6,760千円 (直接経費: 5,200千円、間接経費: 1,560千円)
キーワードリボスイッチ / アプタマー / 合成生物学 / shunting
研究概要

リボスイッチは、分子結合部位(アプタマー)および遺伝子発現制御部位から成っており、前者と対応分子の結合が後者の構造変化を誘起する仕組みで、分子に応答した遺伝子発現制御を実現する。天然リボスイッチのアプタマーは代謝産物に結合するものに限定されるが、任意分子に結合する人工アプタマーは別途獲得できるため、その人工アプタマーを適切に用いれば、任意分子に応答する人工リボスイッチが構築できると考えられる。実際に、これまでに多くの原核系人工リボスイッチ(特に翻訳制御型)が報告されてきた。一方、真核系においては、その翻訳システムの特徴のため、翻訳制御型ONリボスイッチの構築は困難であった。そこで本研究では、特殊な真核系リボソーム進入機構である『shunting』を利用した、真核系人工ONリボスイッチの構築を試みた。
まず初めに、真核系無細胞翻訳システム(コムギ胚芽抽出液)中でshunting機構を詳細に調査し、その情報をもとに、mRNAへの人工アプタマーの挿入位置および方法を決定した。次に、モデルとしてテオフィリンアプタマーを使用し、テオフィリン依存的にshuntingおよび下流遺伝子の発現が促進される「shuntingリボスイッチ」を開発した。このshuntingリボスイッチは、スイッチング時にRNA2本鎖の組換えを伴わず、エネルギーロスが軽減できるため、高い翻訳スイッチング効率を示した。また、2本鎖組換えが必要ないので、設計が簡便であるという利点もある。実際、アプタマーの配列情報だけでshuntingリボスイッチが構築できるように「合理的設計法」も確立した。今後は、合成生物学における種々の応用が期待される。
また、上記研究以外にも、他班の研究者と連携して、原核系人工リボスイッチを活用し、ラン藻の概日リズムを人工的に操作することに成功した。

現在までの達成度 (区分)
理由

25年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

25年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (8件) (うち招待講演 3件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Theophylline-dependent Riboswitch as a Novel Genetic Tool for Strict Regulation of Protein Expression in Cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 79422013

    • 著者名/発表者名
      Yoichi Nakahira, Atsushi Ogawa, Hiroyuki Asano, Tokitaka Oyama, Yuzuru Tozawa
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol.

      巻: 54 号: 10 ページ: 1724-1735

    • DOI

      10.1093/pcp/pct115

    • NAID

      40019838886

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ligand-Dependent Upregulation of Ribosomal Shunting2013

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Ogawa
    • 雑誌名

      ChemBioChem

      巻: 14 号: 13 ページ: 1539-1543

    • DOI

      10.1002/cbic.201300362

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Multiple-input and visible-output logic gates using signal-converting DNA machines and gold nanoparticle aggregation2013

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Ogawa, Yukiko Susaki
    • 雑誌名

      Org. Biomol. Chem.

      巻: 11 号: 20 ページ: 3272-3276

    • DOI

      10.1039/c3ob40313k

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 小麦胚芽無細胞翻訳システムを利用した真核系人工リボスイッチの開発2014

    • 著者名/発表者名
      小川敦司
    • 学会等名
      第1回合成生物学研究部会セミナー
    • 発表場所
      松山
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 人工リボスイッチを基盤としたラン藻の新規遺伝子発現制御技術2014

    • 著者名/発表者名
      中平洋一、小川敦司、浅野宏幸、小山時隆、戸澤 譲
    • 学会等名
      第55回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 無細胞翻訳システムを利用した真核系人工リボスイッチの開発2013

    • 著者名/発表者名
      小川敦司
    • 学会等名
      第190回応用化学セミナー
    • 発表場所
      松山
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] コムギ無細胞システムを利用した真核リボスイッチの合理設計2013

    • 著者名/発表者名
      小川敦司
    • 学会等名
      第15回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      松山
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Theophylline-dependent synthetic riboswitch is a useful genetic tool for strict regulation of protein expression in cyanobacteria2013

    • 著者名/発表者名
      Nakahira Y, Ogawa A, Asano H, Oyama T, Tozawa Y.
    • 学会等名
      Protein Island Matsuyama International Symposium 2013
    • 発表場所
      Matsuyama
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Theophylline-dependent Riboswitch as a Useful Genetic Tool for Synthetic Biology in Cyanobacteria2013

    • 著者名/発表者名
      Nakahira Y, Ogawa A, Asano H, Oyama T, Tozawa Y.
    • 学会等名
      CBI Annual Meeting 2013
    • 発表場所
      Tokyo
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 人工リボスイッチを用いたラン藻のための新規遺伝子発現制御技術2013

    • 著者名/発表者名
      中平洋一、小川敦司、浅野宏幸、小山時隆、戸澤 譲
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 合成生物学基盤技術を指向した人工リボスイッチの開発2012

    • 著者名/発表者名
      小川敦司
    • 学会等名
      新世代の生物有機化学研究会2012
    • 発表場所
      理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター
    • 年月日
      2012-06-23
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [図書] Methods in Molecular Biology: Artificial Riboswitches2014

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Ogawa
    • 総ページ数
      289
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考] 小川研究室:Ogawa Lab > Innovative Area (H24~25)

    • URL

      http://www.pros.ehime-u.ac.jp/ogawa/innovative%20area.html

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考] 小川研究室:Ogawa Lab Publication

    • URL

      http://www.ccr.ehime-u.ac.jp/~ogawa/publication.html

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

URL: 

公開日: 2013-05-15   更新日: 2019-07-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi