• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

シャジクモ藻類のゲノムから探る植物多細胞体制の起源と進化過程

研究課題

研究課題/領域番号 24570100
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 生物多様性・分類
研究機関神戸大学

研究代表者

坂山 英俊  神戸大学, 理学(系)研究科(研究院), 講師 (60391108)

研究分担者 西山 智明  金沢大学, 学際科学実験センター, 助教 (50390688)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2014年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2013年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2012年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード生物学 / 進化 / 比較ゲノム / 多細胞体制 / 植物 / シャジクモ藻類 / 生物進化 / ゲノム / 国際情報交換、アメリカ合衆国
研究成果の概要

本研究では植物多細胞体制の起源と進化過程を解明するために、陸上植物とシャジクモ藻類が持つ1倍体多細胞体制と2倍体多細胞体制を遺伝子情報から比較した。その結果、シャジクモ藻類と陸上植物の共通祖先の段階で共有していたと考えられる遺伝子を推定した。また、植物特異的だと考えられていた多くの発生遺伝子のホモログをシャジクモ藻類から見いだした。いくつかの遺伝子について、シャジクモにおける発現様式を解析し、発生段階や器官/細胞毎に特異的に発現する遺伝子を特定し、遺伝子の構造や機能、およびシャジクモ藻類と陸上植物が持つ多細胞体制の進化過程を考察した。

報告書

(4件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (41件)

すべて 2015 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 5件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (31件) (うち招待講演 5件) 図書 (4件)

  • [雑誌論文] Taxonomy, morphology and genetic variation of Nitella flexilis var. bifurcata (Charales, Characeae) from Japan2015

    • 著者名/発表者名
      Sakayama, H., Kai, A, Nishiyama, M., Watanabe, M. M., Kato, S., Ito, M., Nozaki, H. and Kawai, H.
    • 雑誌名

      Phycological Research

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Occurence of the endangered species Nitellopsis obtusa (Charales, Charophyceae) in western Japan and the genetic differences within and among Japanese populations2014

    • 著者名/発表者名
      Kato, S., Kawai, H., Takimoto, M., Suga, H., Yohda, K., Horiya, K., Higuchi, S., & Sakayama, H.
    • 雑誌名

      Phycological Research

      巻: 62 号: 3 ページ: 222-227

    • DOI

      10.1111/pre.12057

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書 2013 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Characterization of sexual reproductive processes in Chara braunii (Charales, Charophyceae)2014

    • 著者名/発表者名
      Sato, M., Sakayama, H., Sato, M., Ito, M. & Sekimoto, H.
    • 雑誌名

      Phycological Research

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular and biochemical analysis of the first ARA6 homolog, a Rab5 GTPase, from green algae2013

    • 著者名/発表者名
      Hoepflinger, M., Geretschlaeger, A., Hoeftberger, M., Sommer, A., Nishiyama, T., Sakayama, Hammerl, P., H., Tenhaken, R., Ueda, T., Foissner I.
    • 雑誌名

      J. Exp. Bot.

      巻: 64 号: 18 ページ: 5553-68

    • DOI

      10.1093/jxb/ert322

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of the heterotrimeric G-protein complex and its regulator from the green alga Chara braunii expands the evolutionary breadth of plant G-protein signaling2013

    • 著者名/発表者名
      Hackenberg, D., Sakayama, H., Nishiyama, T., & Pandey, S.
    • 雑誌名

      Plant Physiology

      巻: 163 号: 4 ページ: 1510-1517

    • DOI

      10.1104/pp.113.230425

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 植物の陸上化ー陸上植物の姉妹群シャジクモから見えてくるもの2013

    • 著者名/発表者名
      坂山英俊
    • 雑誌名

      遺伝

      巻: 67(1) ページ: 31-38

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] シャジクモの遺伝地図構築に向けたジェノタイピングを用いた交配実験系の確立2015

    • 著者名/発表者名
      宮田大輔・西山智明・川井浩史・坂山英俊
    • 学会等名
      日本藻類学会第39回大会
    • 発表場所
      九州大学箱崎キャンパス(福岡県福岡市)
    • 年月日
      2015-03-21
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] The Chara braunii genome2015

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama, T., Toyoda, A., Suzuki, Y., Fujiyama, A., Rensing, S. A. & Sakayama, H.
    • 学会等名
      International Symposium on Genome Science 2015
    • 発表場所
      一橋講堂(東京都千代田区)
    • 年月日
      2015-01-20 – 2015-01-21
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] The Chara braunii genome sheds light on the origin of land plants2015

    • 著者名/発表者名
      Sakayama, H., Toyoda, A., Suzuki, Y., Fujiyama, A., Rensing, S. A. & Nishiyama, T.
    • 学会等名
      International Plant & Animal Genome XXIII Conference
    • 発表場所
      San Diego, USA
    • 年月日
      2015-01-10 – 2015-01-14
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] The Chara braunii genome2015

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama, T., Toyoda, A., Suzuki, Y., Fujiyama, A., Rensing, S. A. & Sakayama, H.
    • 学会等名
      International Plant & Animal Genome XXIII Conference
    • 発表場所
      San Diego, USA
    • 年月日
      2015-01-10
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] De novo assembly and analysis of RNA-seq data from charalean alga, Chara braunii2014

    • 著者名/発表者名
      Sakayama, H. & Nishiyama, T.
    • 学会等名
      Marchantia Workshop
    • 発表場所
      神戸大学六甲台キャンパス(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2014-12-08 – 2014-12-10
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 再発見された絶滅種チュウゼンジフラスコモの形態、遺伝的多様性および分類2014

    • 著者名/発表者名
      坂山英俊・甲斐 厚・西山未理・渡邉 信・加藤 将・伊藤元己・野崎久義・川井浩史
    • 学会等名
      日本植物学会第76会大会
    • 発表場所
      明治大学生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • 年月日
      2014-09-14
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] シャジクモゲノムにみる陸上植物の制御因子ホモログ2014

    • 著者名/発表者名
      西山智明・豊田 敦・鈴木穣・藤山秋佐夫・坂山英俊
    • 学会等名
      日本植物学会第76会大会
    • 発表場所
      明治大学生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • 年月日
      2014-09-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 植物細胞リン酸輸送機構とその進化について2014

    • 著者名/発表者名
      藤原ひとみ・大西美輪・坂山英俊・石崎公庸・豊倉浩一・関本弘之・西山智明・七條千津子・小菅桂子・深城英弘・三村徹郎
    • 学会等名
      日本植物学会第76会大会
    • 発表場所
      明治大学生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • 年月日
      2014-09-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 陸上植物に近縁な緑色藻類シャジクモのゲノム解読とアノテーション2014

    • 著者名/発表者名
      西山智明・豊田 敦・鈴木 穣・藤山秋佐夫・坂山英俊
    • 学会等名
      日本進化学会第16回大会
    • 発表場所
      高槻現代劇場(大阪府高槻市)
    • 年月日
      2014-08-22
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Genome sequencing of the charophycean green alga, Chara braunii2014

    • 著者名/発表者名
      Tomoaki Nishiyama, Atsushi Toyoda, Yutaka Suzuki, Asao Fujiyama and Hidetoshi Sakayama
    • 学会等名
      Plant & Animal Genomes XXII
    • 発表場所
      サンディエゴ
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 絶滅危惧車軸藻類ホシツリモの新産地発見2012

    • 著者名/発表者名
      加藤将・須賀瑛文・養田勝則・堀家健司・滝本雅之・川井浩史・坂山英俊
    • 学会等名
      日本植物学会第76会大会
    • 発表場所
      兵庫県立大学、姫路
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Characterization of the first ARA6 homolog, a Rab5 GTPase, from green algae possibly involved in wound healing2012

    • 著者名/発表者名
      Höpflinger Marion, Geretschläger Anja, Höftberger Margit, Sommer Aniela, Nishiyama Tomoaki, Sakayama Hidetoshi, Tenhaken Raimund, Ueda Takashi, Foissner Ilse
    • 学会等名
      SEB Meeting 2012
    • 発表場所
      Salzburg, Austria
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 陸上植物に近縁な藻類シャジクモのゲノム解読

    • 著者名/発表者名
      西山智明・豊田 敦・鈴木 穣・藤山秋佐夫・坂山英俊
    • 学会等名
      日本植物学会第77会大会
    • 発表場所
      札幌、北海道大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 広島県宮島で見つかったフラスコモダマシ(車軸藻綱,シャジクモ目)の形態と系統

    • 著者名/発表者名
      溝渕 綾・坪田博美・加藤 将・坂山英俊・関 太郎・向井誠二・半田信司
    • 学会等名
      第38回日本藻類学会
    • 発表場所
      船橋、東邦大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 愛媛県レッドデータブックに掲載予定の車軸藻類

    • 著者名/発表者名
      藤原陽一郎・加藤 将・坂山英俊・福岡 豪・小林真吾
    • 学会等名
      第38回日本藻類学会
    • 発表場所
      船橋、東邦大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 陸上植物に近縁な緑色藻類シャジクモのゲノム解読

    • 著者名/発表者名
      西山智明・豊田 敦・鈴木 穣・藤山秋佐夫・坂山英俊
    • 学会等名
      第55回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山、富山大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 植物細胞リン酸輸送機構とその進化について

    • 著者名/発表者名
      藤原ひとみ・大西美輪・坂山英俊・石崎公庸・関本弘之・西山智明・七條千津子・深城英弘・三村徹郎
    • 学会等名
      第55回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山、富山大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] シャジクモのゲノム解読

    • 著者名/発表者名
      西山 智明・豊田 敦・鈴木 穣・藤山秋佐夫・坂山英俊
    • 学会等名
      日本植物分類学会第13回大会
    • 発表場所
      熊本、熊本大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] De novo assembly and analysis of RNA-seq data from charalean algae Chara braunii

    • 著者名/発表者名
      Hidetoshi Sakayama and Tomoaki Nishiyama
    • 学会等名
      Ectocarpus 2014
    • 発表場所
      神戸、神戸大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Genome sequencing of the charophycean green alga, Chara braunii

    • 著者名/発表者名
      Tomoaki Nishiyama, Atsushi Toyoda, Yutaka Suzuki, Asao Fujiyama and Hidetoshi Sakayama
    • 学会等名
      Ectocarpus 2014
    • 発表場所
      神戸、神戸大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Evolutionary analyses on the two ecologically differentiated types of freshwater alga Chara braunii (Charales)

    • 著者名/発表者名
      Syou Kato, Hiroshi Kawai, Hidetoshi Sakayama
    • 学会等名
      Ectocarpus 2014
    • 発表場所
      神戸、神戸大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] シャジクモ藻類シャジクモ(Chara braunii)におけるLEAFY遺伝子ホモログの発現解析

    • 著者名/発表者名
      坂山英俊・山田敏弘・西山智明・川井浩史・伊藤元己
    • 学会等名
      日本藻類学会第37回大会
    • 発表場所
      山梨大学、甲府
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 国立環境研究所におけるシャジクモ類保存の取り組み

    • 著者名/発表者名
      石本美和・森史・湯本康盛・坂山英俊・笠井文絵・河地正伸
    • 学会等名
      日本藻類学会第37回大会
    • 発表場所
      山梨大学、甲府
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 愛媛県で確認されたシャジクモ属(Chara)について

    • 著者名/発表者名
      藤原陽一郎・加藤将・坂山英俊・小林真吾
    • 学会等名
      日本藻類学会第37回大会
    • 発表場所
      山梨大学、甲府
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] シャジクモ (Chara braunii) におけるEST-SSRマーカーの開発

    • 著者名/発表者名
      加藤将・永野萌・嶌田智・川井浩史・坂山 英俊
    • 学会等名
      日本藻類学会第37回大会
    • 発表場所
      山梨大学、甲府
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] ゲノム解析から見たシャジクモ類の多細胞化進化

    • 著者名/発表者名
      坂山英俊・西山智明
    • 学会等名
      日本植物学会第76会大会
    • 発表場所
      兵庫県立大学、姫路
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 日本産車軸藻類の分類と生育分布の現状

    • 著者名/発表者名
      坂山英俊
    • 学会等名
      水草研究会第34回大会
    • 発表場所
      愛媛県立博物館、西条
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] シャジクモ藻類シャジクモ(Chara braunii)のRNA-seq解析

    • 著者名/発表者名
      坂山英俊・西山智明
    • 学会等名
      日本藻類学会第36回大会
    • 発表場所
      北海道大学、札幌
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 車軸藻類Chara fibrosa群の分子系統学的解析

    • 著者名/発表者名
      柴田葵、加藤将、川井浩史、坂山英俊
    • 学会等名
      日本藻類学会第36回大会
    • 発表場所
      北海道大学、札幌
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] シャジクモの保全遺伝学に向けたSSRマーカーの新規開発

    • 著者名/発表者名
      加藤将、川井浩史、坂山英俊
    • 学会等名
      日本藻類学会第36回大会
    • 発表場所
      北海道大学、札幌
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 沖縄本島における車軸藻類と淡水産大型紅藻類の産地報告

    • 著者名/発表者名
      比嘉敦・坂山英俊・加藤将・香村眞徳・熊野茂
    • 学会等名
      日本藻類学会第36回大会
    • 発表場所
      北海道大学、札幌
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [図書] シャジクモ科. レッドデータブック2014 –日本の絶滅のおそれのある野生生物–, 植物II (蘚苔類,藻類,地衣類,菌類) (環境省編)2015

    • 著者名/発表者名
      坂山英俊(分担執筆)
    • 総ページ数
      580
    • 出版者
      ぎょうせい
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] 車軸藻類.京都府レッドデータブック 2015 第2巻 (野生植物・菌類編)2015

    • 著者名/発表者名
      加藤 将・坂山英俊
    • 出版者
      京都府自然環境保全課
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] レッドリストに載ったシャジクモ目藻類.藻類ハンドブック.2012

    • 著者名/発表者名
      坂山英俊
    • 出版者
      エヌ・ティー・エス
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [図書] シャジクモ藻類(シャジクモ目).藻類ハンドブック.2012

    • 著者名/発表者名
      坂山英俊
    • 出版者
      エヌ・ティー・エス
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi