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門レベルの系統群に分類される未培養環境微生物の分離培養ストラテジー

研究課題

研究課題/領域番号 26650145
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 生物多様性・分類
研究機関広島大学

研究代表者

金田一 智規  広島大学, 工学(系)研究科(研究院), 助教 (10379901)

研究分担者 青井 議輝  広島大学, サステナブル・ディベロップメント実践研究センター, 特任講師 (40386636)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2015年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2014年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード群集・生態系多様性 / 微生物ダークマター / 分離培養
研究成果の概要

本研究は新規分離培養ストラテジーに基づいて、門レベルの分類系統群を構成する微生物群(Candidate division微生物群)を対象に分離培養を目的とするものである。活性汚泥を対象とした次世代シーケンス解析の結果、Candidate division TM7、OD1、SR1、BD1-5細菌群が比較的高頻度で検出されたため、対象細菌群とした。これらの細菌群の門レベルでの詳細な系統樹を作成でき、それに基づいて特異的なFISHプローブを設計することができた。TM7門に関してはMAR-FISH法によって増殖可能な有機物を特定することができた。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (2件)

  • [国際共同研究] Aalborg University(Denmark)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Phylogenetic diversity and ecophysiology of candidate phylum Saccharibacteria in activated sludge2016

    • 著者名/発表者名
      Tomonori Kindaichi, Shiro Yamaoka, Ryohei Uehara, Noriatsu Ozaki, Akiyoshi Ohashi, Mads Albertsen, Per H. Nielsen, Jeppe L. Nielsen
    • 雑誌名

      FEMS Microbiology Ecology

      巻: 92 号: 6 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1093/femsec/fiw078

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 活性汚泥中に存在する糸状性細菌Candidatus Saccharibacteriaの集積培養2015

    • 著者名/発表者名
      上原 亮平, 金田一 智規, 尾崎 則篤, 大橋 晶良
    • 学会等名
      第49回日本水環境学会年会
    • 発表場所
      金沢大学
    • 年月日
      2015-03-16 – 2015-03-18
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Candidatus Saccharibacteria の生理学的特性の解析と分離培養の試み2014

    • 著者名/発表者名
      上原 亮平, 金田一 智規, 尾崎 則篤, 大橋 晶良
    • 学会等名
      環境微生物系学会合同大会
    • 発表場所
      浜松市
    • 年月日
      2014-10-21 – 2014-10-24
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2017-05-10  

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