KAKEN — 研究課題をさがす | 研究者番号: 10597339

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1. 消化器癌のmicrobiota解析と次世代免疫治療における診断・治療への応用

研究課題

研究種目	基盤研究(C)
審査区分	小区分50010:腫瘍生物学関連
研究機関	札幌医科大学
研究代表者	能正勝彦札幌医科大学, 医学部, 訪問研究員
研究期間 (年度)	2019-04-01 – 2022-03-31完了
キーワード	大腸癌 / F. nucleatum / microbiota / 免疫療法 / Fusobacterium / 免疫チェックポイント
研究開始時の研究の概要	多種、多症例の消化器癌を用いてそれぞれの癌種で特定される微生物種とその分子病理学的異常や腫瘍免疫応答、さらに環境因子との関連を検討することは、日本人の消化器癌に特有のmicrobiotaが同定されることや、これまでに発癌への関与が報告されていなかった癌で新たな微生物が発見される可能性がある。またmi ...
研究成果の概要	近年、大腸癌の発生・増大に腸管内常在微生物であるF. nucleatumの関与が注目されているが、ヒトの体内での実際の存在や分布、正常粘膜や前癌病変における役割は不明な点が多い。よって大腸腫瘍の発育早期におけるF.nucleatumの役割を解明するため、ESDで採取された早期大腸病変を用いてF. n ...

この課題の研究成果物	雑誌論文 (1件うち国際共著 1件、査読あり 1件) 学会発表 (1件)

2. 日米の消化器癌を用いたmicrobiome解析とエピゲノム異常・免疫応答との関連

研究課題

研究種目	若手研究(B)
研究分野	腫瘍生物学
研究機関	札幌医科大学
研究代表者	三橋慧札幌医科大学, 医学部, 助教
研究期間 (年度)	2016-04-01 – 2018-03-31完了
キーワード	microbiome / Fusobacterium / 膵癌 / 消化器癌 / エピゲノム
研究成果の概要	今回の検討でFusobacterium属は膵癌組織周囲の脂肪組織内に存在することが明らかとなった。またその陽性群は不良な生命予後との相関が認められたことからFusobacterium属が膵癌の生物学的悪性度に関与する可能性も示唆された。 ...

この課題の研究成果物	雑誌論文 (1件) 学会発表 (2件)

3. 大腸癌の分子異常サブタイプ別のmicroRNA解析と次世代診断・標的治療への応用

研究課題

研究種目	基盤研究(C)
研究分野	腫瘍診断学
研究機関	札幌医科大学
研究代表者	能正勝彦札幌医科大学, 医学部, 講師
研究期間 (年度)	2016-04-01 – 2019-03-31完了
キーワード	EZH2 / microRNA / 大腸癌 / microRNA-31 / IL-6 / バイオマーカー / ヒストン / エピゲノム / 分子標的治療
研究成果の概要	我々は大腸癌患者の血液を用いて、その超早期診断を目的としたmolecular classificationに基づいたmicroRNA発現解析を施行。さらに分子標的薬剤の効果予測因子の同定を目指した血中microRNAによる新たな非侵襲的分子診断方法の開発を行った。その結果、大腸癌組織でのmicroR ...

この課題の研究成果物	国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (6件うち査読あり 5件、オープンアクセス 3件、謝辞記載あり 1件) 学会発表 (7件うち国際学会 1件、招待講演 3件)

4. 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

研究課題

研究種目	新学術領域研究（研究領域提案型）『学術研究支援基盤形成』
研究機関	国立遺伝学研究所
研究代表者	小原雄治情報・システム研究機構国立遺伝学研究所先端ゲノミクス推進センター, 特任教授
研究期間 (年度)	2016 – 2021完了
キーワード	次世代DNAシーケンサー / 新規ゲノム配列決定 / リシーケンシング / エピゲノム / RNA-Seq / 1細胞解析 / メタゲノム解析 / スーパーコンピューター / ゲノムアッセンブル / ゲノム多型 / メタゲノム / ゲノムアノテーション
研究成果の概要	科研費採択課題を対象に毎年支援公募を行い、新規ゲノム解読、変異解析、エピゲノム解析、RNA解析、メタゲノム解析、1細胞解析など最先端のゲノム解析技術を支援した。総数1,988の応募があり912が支援課題となった。生命科学のほぼすべての分野をカバーし、理工系や環境系などにも広がった。成果論文も順調に増 ...

この課題の研究成果物	国際共同研究 (36件) 雑誌論文 (761件うち国際共著 195件、査読あり 738件、オープンアクセス 595件) 学会発表 (1760件うち国際学会 491件、招待講演 614件) 図書 (78件) 備考 (107件) 産業財産権 (6件うち外国 3件) 学会・シンポジウム開催 (2件)

5. 早期食道癌のゲノム・エピゲノムの網羅的解析と内視鏡洗浄廃液による分子診断の開発

研究課題

研究種目	基盤研究(C)
研究分野	消化器内科学
研究機関	札幌医科大学
研究代表者	篠村恭久札幌医科大学, その他部局等, 名誉教授
研究期間 (年度)	2015-04-01 – 2018-03-31完了
キーワード	食道癌 / エピゲノム / Fusobacterium / ゲノム / ESD
研究成果の概要	今回の検討でFusobacterium属は早期食道癌（扁平上皮癌）の組織に存在することが明らかとなった。またその陽性群は脈管侵襲陽性例が多い傾向が認められたことから生物学的悪性度に関与する可能性も示唆された。 ...

この課題の研究成果物	学会発表 (1件うち招待講演 1件)

6. 消化管間質腫瘍の悪性度を規定する長鎖non-coding RNAの探索

研究課題

研究種目	挑戦的萌芽研究
研究分野	消化器内科学
研究機関	札幌医科大学
研究代表者	篠村恭久札幌医科大学, 医学部, 教授
研究期間 (年度)	2013-04-01 – 2015-03-31完了
キーワード	GIST / ゲノム / HOTAIR / non-coding RNA / 次世代シークエンサー / ncRNA / ChIP-seq
研究成果の概要	ノンコーディングRNAのうち、microRNA以外の長鎖ncRNAの機能はほとんど不明であったが、近年その機能のひとつとして、クロマチン修飾酵素複合体と相互作用することで標的遺伝子発現をエピジェネティックに制御する機能が提唱された。今回の検討で我々はmicroRNA-196aと長鎖non-codin ...

この課題の研究成果物	雑誌論文 (4件うち査読あり 4件) 学会発表 (4件)

7. 消化器癌の遺伝子異常の網羅的探索とそれらをターゲットにした標的治療の臨床への応用

研究課題

研究種目	若手研究(B)
研究分野	消化器内科学
研究機関	札幌医科大学
研究代表者	能正勝彦札幌医科大学, 医学部, 助教
研究期間 (年度)	2011 – 2012完了
キーワード	下部消化管学(小腸、大腸) / 大腸癌 / microRNA / 大腸鋸歯状病変
研究概要	現在、大腸癌は男女ともに日本人の癌死亡原因の上位を占め、特に高齢者の右側結腸癌の増加が報告されている。欧米では高齢者の右側結腸癌の特徴として、女性、BRAF 遺伝子変異や MLH1 のメチル化、マイクロサテライト不安定性大腸癌が多いと報告されている。また大腸鋸歯状病変はそれらの異常の頻度が高いことか ...

この課題の研究成果物	雑誌論文 (26件うち査読あり 26件) 学会発表 (16件うち招待講演 1件)

8. リアルタイム仮想分子生物学による食道癌の内視鏡分子イメージング診断法の開発

研究課題

研究種目	挑戦的萌芽研究
研究分野	腫瘍診断学
研究機関	札幌医科大学
研究代表者	山本博幸札幌医科大学, 医学部, 講師
研究期間 (年度)	2011 – 2012完了
キーワード	食道扁平上皮癌 / DNA / メチル化 / microRNA / 背景粘膜 / 粘膜内癌 / DNAメチル化 / MCA microarray / LINE-1
研究概要	食道扁平上皮癌における新規の異常メチル化遺伝子を同定・解析することおよびゲノムワイドな低メチル化の役割を明らかにすることを目的とした。ゲノムワイドなCpGアイランドメチル化は、正常粘膜、食道癌非癌部粘膜、食道癌の順で増加した。食道扁平上皮癌において腫瘍関連遺伝子、とくにLRFN5遺伝子のCpGアイラ ...

この課題の研究成果物	学会発表 (2件)

9. 消化管癌におけるマイクロRNAおよびエピゲノム異常の解析とその臨床応用

研究課題

研究種目	基盤研究(B)
研究分野	消化器内科学
研究機関	札幌医科大学
研究代表者	篠村恭久札幌医科大学, 医学部, 教授
研究期間 (年度)	2011 – 2013完了
キーワード	上部消化管学 / マイクロRNA / 胃癌 / 大腸癌 / エピゲノム / メチル化 / 消化管癌 / GIST / miR-196a / HOTAIR
研究概要	ノンコーディングRNAの一つであるマイクロRNAの発現異常は多くの癌で報告され、新規バイオマーカーとして有望であると報告されている。我々は内視鏡切除された早期胃癌患者の非癌部の胃粘膜における microRNA-34b/c(miR-34b/c)遺伝子のメチル化レベルが癌の異時性発生リスクを予測する有望 ...

この課題の研究成果物	雑誌論文 (25件うち査読あり 23件) 学会発表 (39件) 備考 (1件) 産業財産権 (2件)

10. 機能性ＲＮＡ統合解析による日米欧の胃・大腸発癌の分子疫学的解明と臨床応用・癌予防

研究課題

研究種目	基盤研究(B)
研究分野	がん疫学・予防
研究機関	聖マリアンナ医科大学 (2013) 札幌医科大学 (2011-2012)
研究代表者	山本博幸聖マリアンナ医科大学, 医学部, 准教授
研究期間 (年度)	2011-04-01 – 2014-03-31完了
キーワード	機能性RNA / 消化器癌 / 日米欧比較 / 分子疫学 / SNP / 胃癌 / 大腸癌 / マイクロRNA / DNAメチル化
研究概要	日米欧の胃癌、大腸癌を対象に、DNAメチル化、miRNA発現、標的癌関連遺伝子変異、宿主SNPの点からmiRNA異常を統合的に解析した。DNAメチル化およびmiRNA発現プロファイルの詳細、個々の重要なDNAメチル化およびmiRNA発現変化を明らかにした。標的癌関連遺伝子の3'-UTR、5'-UTR ...

この課題の研究成果物	雑誌論文 (19件うち査読あり 19件) 学会発表 (64件)

11. がん研究分野の特性等を踏まえた支援活動

研究課題

研究種目	新学術領域研究(研究領域提案型)
研究機関	東京大学
研究代表者	今井浩三 (2012-2015) 東京大学, 医科学研究所, 特任研究員中村祐輔 (2010-2011) 東京大学, 医科学研究所, 教授
研究期間 (年度)	2010-04-01 – 2016-03-31完了
キーワード	若手支援 / 国際研究者交流 / 遺伝子改変マウス / 病理形態学 / ゲノムコーホート研究 / 次世代分子解析技術 / アカデミア創薬 / ゲノム・エピゲノム解析支援 / 個別化がん予防 / 国際交流 / ATL発症予防 / 分子疫学コーホート研究 / がん化学予防 / ATL発がん機序 / ATL発症リスク / がん分子標的薬剤
研究成果の概要	がんの克服を目指す研究への支援から始まり、平成26 年度からは広く生命科学研究に携わる研究者も対象として支援を展開した。その結果、総括支援活動では若手研究者の育成ならびに今後研究支援に携わる可能性のある人材を育成し、国際学術交流を展開した。遺伝子改変マウスの供給支援、がん組織をはじめバイオリソースの ...
研究領域	がん研究分野の特性等を踏まえた支援活動

この課題の研究成果物	国際共同研究 (6件) 雑誌論文 (815件うち国際共著 24件、査読あり 805件、オープンアクセス 62件、謝辞記載あり 64件) 学会発表 (640件うち国際学会 30件、招待講演 111件) 図書 (66件) 備考 (43件) 産業財産権 (14件うち外国 2件)