| Project Area | Elucidation of the mechanism for dimensional response genome across species regulated by nucleic acid structures |
|---|
| Project/Area Number |
21H05107
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (B)
|
| Allocation Type | Single-year Grants |
|---|
| Review Section |
Transformative Research Areas, Section (II)
|
|---|
| Research Institution | Konan University |
|---|
Principal Investigator |
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
今西 未来 京都大学, 化学研究所, 准教授 (80362391)
遠藤 玉樹 甲南大学, 先端生命工学研究所, 准教授 (90550236)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2021-08-23 – 2024-03-31
|
| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
|
| Budget Amount *help |
¥9,100,000 (Direct Cost: ¥7,000,000、Indirect Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
|
|---|
| Keywords | 核酸構造 / 多元応答ゲノム / データベース / 定量的解析 / 細胞内分子環境評価系 / 遺伝子発現制御 / 細胞内環境評価系 / 核酸非二重らせん構造 / 遺伝子発現 / 多元応答機構 / 多元応答ゲノムバンク（DiR-GB） / 生物種 / 多元応答ゲノムバンク / 多元応答ゲノム機構 / 細胞内環境 |
|---|
| Outline of Research at the Start |
本学術変革領域では、環境に応答して変動する核酸の構造に依存した遺伝子の発現調節（多元応答）機構である「多元応答ゲノム」が様々な生物種で成立することを明らかにする。研究では、物理化学、分子生物学的実験により、環境の変動に応答する核酸構造および遺伝子発現変動を網羅的に解析し、得られた実験的定量データと、情報科学、計算科学による原核生物、真核生物の遺伝子解析結果を集約し、生物種の枠組みを超えて存在する核酸構造変化に依存した遺伝子発現変化を分子レベルで明らかにする。さらに、「多元応答ゲノム」の生理学的意義を提唱し、ゲノムの配列から多元応答を予測できる多元応答ゲノムバンク（DiR-GB）を構築する。
|
| Outline of Final Research Achievements |
The project team promoted the management and collaborative researches in our group. We held regular meetings to report research results. Moreover, advisors were invited to receive advice on the research to facilitate the smooth execution of the researches. We also organized symposiums at academic conferences in collaboration with research groups of Transformative Research Areas (A) and (B) to promote research exchange in academic societies and with other research areas. Organized two international symposiums inviting top-level researchers related to this area, and provided opportunities for discussion on the results of our works from the professors who participated in the symposiums. Messages for us from the professors were published in the newsletter and our homepage. The newsletter explaining the research results and activities of the project was published once a year and distributed to related researchers and the general public to distribute the activities of the project.
|
| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
本領域研究では、生物種の分類枠組みを超えた多元応答を示す核酸構造を予測するデータベース（多元応答ゲノムバンク, Dir-GB）を開設することができた。統括班では、研究成果を発信し、領域内の研究だけではなく、我々の構築したデータベースを基に領域外の研究者（特に国際共同研究）も積極的に推進できるよう支援した。今後、医工学、農学、材料化学など幅広い分野の研究者と連携する研究ネットワークを構築できたため、今後、分野を超えた共同研究を発展的に展開できると期待される。
|
