| Project Area | Resonance Biology for Innovative Bioimaging |
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| Project/Area Number |
15H05954
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Review Section |
Biological Sciences
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| Research Institution | Institute of Physical and Chemical Research |
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Principal Investigator |
yokota hideo 国立研究開発法人理化学研究所, 光量子工学研究センター, チームリーダー (00261206)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
吉澤 信 国立研究開発法人理化学研究所, 光量子工学研究センター, 上級研究員 (10455371)
世良 俊博 九州大学, 工学研究院, 准教授 (40373526)
森田 正彦 国立研究開発法人理化学研究所, 光量子工学研究センター, 研究員 (40449038)
道川 隆士 国立研究開発法人理化学研究所, 光量子工学研究センター, 上級研究員 (60435683)
竹本 智子 国立研究開発法人理化学研究所, 光量子工学研究センター, 研究員 (00450403)
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| Project Period (FY) |
2015-06-29 – 2020-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2019)
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| Budget Amount *help |
¥109,070,000 (Direct Cost: ¥83,900,000、Indirect Cost: ¥25,170,000)
Fiscal Year 2019: ¥18,460,000 (Direct Cost: ¥14,200,000、Indirect Cost: ¥4,260,000)
Fiscal Year 2018: ¥18,590,000 (Direct Cost: ¥14,300,000、Indirect Cost: ¥4,290,000)
Fiscal Year 2017: ¥18,590,000 (Direct Cost: ¥14,300,000、Indirect Cost: ¥4,290,000)
Fiscal Year 2016: ¥18,590,000 (Direct Cost: ¥14,300,000、Indirect Cost: ¥4,290,000)
Fiscal Year 2015: ¥34,840,000 (Direct Cost: ¥26,800,000、Indirect Cost: ¥8,040,000)
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| Keywords | 画像処理 / バイオイメージング / 定量解析 / クラウド画像処理システム / 高速画像フィルタ / 深層機械学習による画像処理 / 近赤外イメージング / VCAT5 / RBICP / sommelier / スケール対応画像フィルタ / CT再構築 / アップコンバージョン蛍光体 / クラウド / バイオイメージプロセッシング / ディジタル画像処理 / 画像認識 / 画像データベース / 画像計測 / 生体画像処理 / 細胞内画像処理 / バイオイメージインフォマティクス / 数値解析 / 機械学習 / 生体生命情報学 / 画像 / 情報システム / 共焦点顕微鏡 / ディジタル画像情報 / データベース / 領域抽出 / アルゴリズム / デジタル画像情報 |
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| Outline of Final Research Achievements |
In this research, we have developed many useful imaging and image processing methods and systems for bio-images, and applied them to biology and medical application. In particular, our new computational methods include several fast image filters, a robust algorithm for principal component analysis, and several deep learning frameworks for medical image analysis. We have also developed a cloud-based image management platform (RBICP), an integrated image processing software (VCAT5) consisting of the proposed methods and other popular image processing techniques as plug-in programs, a performance evaluation system for image recognition (Sommelier), and a near infrared imaging system. Our systems have employed for various bio-image analysis. Furthermore, we held three algorithm contests using bio-images and contributed to integrating informatics and biology.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
本研究で得られた新しい計算法群は、既存の研究・技術と比べて計算速度、近似精度や識別精度などの数学的・定量的な指標で優れており、情報学分野での学術的価値が高い。また、開発したシステム群は領域内(RBICP, 近赤外イメージング)及び外部(VCAT5, Sommelierが選んだ計算法)へ公開しており、新たな技術の学術分野・機関を横断する共鳴効果が期待できる。さらに、生物画像を用いたアルゴリズムコンテストの共催を通じて、情報工学と生物学の異分野融合を促進し、新学術領域創生へ社会的に貢献をした。
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