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Construction mechanism of basic design for adaptive neuronal circuits

Planned Research

Project AreaCensus-based biomechanism of circuit construction and transition for adaptive brain functions
Project/Area Number 21H05239
Research Category

Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Transformative Research Areas, Section (III)
Research InstitutionOsaka University (2022-2024)
University of Tsukuba (2021)

Principal Investigator

堀江 健生  大阪大学, 大学院生命機能研究科, 教授 (10455925)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 尾崎 遼  筑波大学, 医学医療系, 准教授 (10743346)
佐藤 ゆたか  京都大学, 理学研究科, 准教授 (40314174)
Project Period (FY) 2021-09-10 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥88,270,000 (Direct Cost: ¥67,900,000、Indirect Cost: ¥20,370,000)
Fiscal Year 2024: ¥16,120,000 (Direct Cost: ¥12,400,000、Indirect Cost: ¥3,720,000)
Fiscal Year 2023: ¥16,250,000 (Direct Cost: ¥12,500,000、Indirect Cost: ¥3,750,000)
Fiscal Year 2022: ¥16,250,000 (Direct Cost: ¥12,500,000、Indirect Cost: ¥3,750,000)
Fiscal Year 2021: ¥23,270,000 (Direct Cost: ¥17,900,000、Indirect Cost: ¥5,370,000)
Keywordsホヤ / 神経回路 / シングルセルトランスクリプトーム / 光遺伝学 / バイオインフォマティクス / 適応回路 / 単一細胞トランスクリプトーム解析 / 細胞分化
Outline of Research at the Start

本研究課題ではホヤ幼生の中枢神経系をモデルとして、適応回路を担う神経細胞種をセンサスすることにより、適応回路の基本設計(回路発生・回路構築・回路機能)を1細胞レベルで解明する。そして、ホヤから得られた知見をもとに脊索動物の適応回路の基本設計の構築メカニズムを明らかにする。

Outline of Annual Research Achievements

本研究課題は、脊索動物の中で最も単純な神経系を持つホヤの幼生をモデルとして、シングルセルトランスクリプトーム(scRNA-seq)解析を駆使し、適応回路を担う神経細胞種をセンサスすることにより、適応回路の基本設計(回路発生・回路構築・回路機能)を解明することを目指した研究である。本年度は回路発生と回路構築に関する研究を行った。
ホヤ幼生の表皮には外界からの刺激を感知する表皮感覚神経細胞が多数存在している。ホヤ幼生には頭部に5種類、尾部に2種類の合計7種類54個の表皮感覚神経細胞が存在することが知られている。このうち尾部に存在するBTNs( Bipolar Tail Neurons)は双極に軸索を伸ばすという特徴的な形態をしている。単一細胞トランスクリプトーム解析の結果からHNF6が最終分化後のBTNsに強く発現することを明らかにした。HNF6の機能阻害を行ったところBTNsは分化したが、軸索の形成は阻害された。その結果からBTNsの双極に伸びた軸索形成にはHNF6が重要な働きをすることが明らかになった。現在、HNF6の下流で働く遺伝子の同定を進めており、これらに遺伝子の解析からBTNの双極に伸びた軸索形成の分子機構の解明を行うことが出来ると考えている。
ホヤとゼブラフィッシュにおける単一細胞細胞トランスクリプトームデータの種間比較を行うことで、ホヤにおいて脊椎動物の神経堤細胞と神経中胚葉前駆細胞の両方の性質をそなえた細胞をもつことを見出した。脊椎度物らしさを作り出す神経堤細胞と神経中胚葉前駆細胞が脊椎動物の誕生以前に一つの細胞群として存在している可能性が高いことが示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

シングルセルトランスクリプトーム(scRNA-seq)解析を駆使し、適応回路を担う神経細胞種をセンサスすることにより、適応回路の基本設計(回路発生・回路構築・回路機能)を解明することを目指した研究を行っているが、scRNA-seq解析の発生、機能解析だけでなく、回路構築への応用が着実に進んでいるため。

Strategy for Future Research Activity

現在までにシングルセルトランスクリプトーム(scRNA-seq)解析を適応回路の基本設計(回路発生・回路構築・回路機能)の研究に応用する取り組みは成功しているのでそれを進めて行く。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (38 results)

All 2023 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (6 results) Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 7 results) Presentation (21 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 8 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] プリンストン大学/カリフォルニア大学サンタバーバラ校(米国)

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  • [Int'l Joint Research] フランス国立科学研究所(フランス)

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    • Author(s)
      堀江良子、堀江健生
    • Journal Title

      月刊「細胞」

      Volume: 55 Pages: 52-55

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  • [Journal Article] Improved Genome Editing in the Ascidian Ciona with CRISPR/Cas9 and TALEN2023

    • Author(s)
      Sasakura Yasunori、Horie Takeo
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 2637 Pages: 375-388

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-3016-7_28

    • ISBN
      9781071630150, 9781071630167
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    • Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The TRP channel PKD2 is involved in sensing the mechanical stimulus of adhesion for initiating metamorphosis in the chordate Ciona2022

    • Author(s)
      Sakamoto Aya、Hozumi Akiko、Shiraishi Akira、Satake Honoo、Horie Takeo、Sasakura Yasunori
    • Journal Title

      Development, Growth & Differentiation

      Volume: 64 Issue: 7 Pages: 395-408

    • DOI

      10.1111/dgd.12801

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    • Author(s)
      堀江良子、一寸木明日香、堀江健生
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 113 Pages: 1931-1936

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    • Author(s)
      Krasovec Gabriel、Hozumi Akiko、Yoshida Tomoyuki、Obita Takayuki、Hamada Mayuko、Shiraishi Akira、Satake Honoo、Horie Takeo、Mori Hisashi、Sasakura Yasunori
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 8 Issue: 10 Pages: 1-22

    • DOI

      10.1126/sciadv.abn3264

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  • [Journal Article] Neuronal identities derived by misexpression of the POU IV sensory determinant in a protovertebrate2022

    • Author(s)
      Prakriti Paul Chacha, Ryoko Horie, Takehiro G. Kusakabe, Yasunori Sasakura, Mona Singh, Takeo Horie, and Michael Levine
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 119 Issue: 4

    • DOI

      10.1073/pnas.2118817119

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A single motor neuron determines the rhythm of early motor behavior in Ciona2021

    • Author(s)
      Taichi Akahoshi, Madoka K. Utsumi, Kouhei Oonuma, Makoto Murakami, Takeo Horie, Takehiro G. Kusakabe, Kotaro Oka, Kohji Hotta
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 7 Issue: 50 Pages: 1-12

    • DOI

      10.1126/sciadv.abl6053

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  • [Journal Article] Evolution of Developmental Programs for the Midline Structures in Chordates: Insights From Gene Regulation in the Floor Plate and Hypochord Homologues of Ciona Embryos2021

    • Author(s)
      Kouhei Oonuma, Maho Yamamoto, Naho Moritsugu, Nanako Okawa, Megumi Mukai, Miku Sotani, Shuto Tsunemi, Haruka Sugimoto, Eri Nakagome, Yuichi Hasegawa, Kotaro Shimai, Takeo Horie, Takehiro G. Kusakabe
    • Journal Title

      Frontiers in Cell and Developmental Biology

      Volume: 9 Pages: 1-12

    • DOI

      10.3389/fcell.2021.704367

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Vasopressin Promoter Transgenic and Vasopressin Gene-Edited Ascidian, Ciona intestinalis Type A (Ciona robusta): Innervation, Gene Expression Profiles, and Phenotypes2021

    • Author(s)
      Kawada Tsuyoshi、Shiraishi Akira、Matsubara Shin、Hozumi Akiko、Horie Takeo、Sasakura Yasunori、Satake Honoo
    • Journal Title

      Frontiers in Endocrinology

      Volume: 12 Pages: 668564-668564

    • DOI

      10.3389/fendo.2021.668564

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      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] ホヤ幼生の重力を感知する神経回路の解析2023

    • Author(s)
      一寸木明日香,、堀江良子,、笹倉靖徳、堀江健生
    • Organizer
      第46回日本神経科学大会
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      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 1 細胞解析に基づいた双極型神経細胞の移動、軸索形成機構の解析2023

    • Author(s)
      堀江健生
    • Organizer
      大阪大学蛋白研セミナー「脳神経回路の形成・動作と制御の現在と未来」
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      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 単一細胞トランスクリプトーム解析を応用した視床下部相同器官の分化機構の解明2023

    • Author(s)
      堀江健生
    • Organizer
      第49回日本神経内分泌学会学術集会
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  • [Presentation] MS2 システムによるホヤ胚における転写のライブイメージング手法の構築2023

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      冨山新、堀江良子、橋本秀彦、堀江健生
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      第6回ホヤ研究会
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  • [Presentation] カタユウレイボヤ ddN ニューロンの軸索の正中交差を制御する分子機構2023

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      冨山新、堀江良子、橋本秀彦、堀江健生
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      第46回日本分子生物学会
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  • [Presentation] シングルセル解析を活用した双極型感覚神経細胞の軸索形成を制御する転写因子の同定2023

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      堀江良子,、堀江健生
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      第46回日本分子生物学会
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  • [Presentation] ホヤの全神経細胞の解析から、人間の脳の理解へ ~脳・神経回路の1細胞レベルでの理解を目指して~2023

    • Author(s)
      堀江健生
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      学術変革領域研究(A)「神経回路センサスに基づく適応機能の構築と遷移バイオメカニズム」の令和5年度公開シンポジウム「最先端技術で迫る脳の働きと多様性」
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    • Invited
  • [Presentation] ホヤ幼生の重力を感知する神経回路の解析2022

    • Author(s)
      一寸木明日香、堀江良子、笹倉靖徳、堀江健生
    • Organizer
      日本動物学会 近畿支部 研究発表会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 単一細胞トランスクリプトーム解析によるホヤ幼生の尾部に存在する双極型感覚神経細胞の分化機構の解析2022

    • Author(s)
      堀江良子、笹倉靖徳、堀江健生
    • Organizer
      日本動物学会 近畿支部 研究発表会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Gravitaxis neural circuit in the ascidian larva2022

    • Author(s)
      Asuka Chokki, Ryoko Horie, Yasunori Sasakura, and Takeo Horie
    • Organizer
      11th International Tunicate Meeting
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      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Regulatory cocktail for dopaminergic neurons in ascidian identified by single cell transcriptomics2022

    • Author(s)
      Takeo Horie
    • Organizer
      11th International Tunicate Meeting
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] シングルセルトランスクリプトーム解析を応用した 神経細胞の分化を制御する転写因子カクテルの同定2022

    • Author(s)
      堀江健生
    • Organizer
      シングルセルゲノミクス研究会2022
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  • [Presentation] シングルセル解析を応用したホヤ胚における神経細胞の分化を制御する転写因子カクテルの同定2022

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      堀江健生
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      日本遺伝学会第94回大会
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  • [Presentation] Regulatory cocktail for dopaminergic neurons in ascidians identified by single cell transcriptomics2022

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      Takeo Horie
    • Organizer
      Adaptive Circuit Census International Symposium 2023(
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] シングルセルトランスクリプトーム解析から切り込む視床下部相同器官の分化機構2021

    • Author(s)
      堀江健生
    • Organizer
      第41回日本比較内分泌学会大会及びシンポジウム
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    • Invited
  • [Presentation] ホヤ幼生の重力を感知する神経回路の構造と機能2021

    • Author(s)
      一寸木明日香、堀江良子、笹倉靖徳、堀江健生
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会
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  • [Presentation] 単一細胞トランスクリプトーム解析によるホヤ幼生の尾部に存在する双極型感覚神経細胞の分化機構の解析2021

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      堀江良子、日下部岳広、笹倉靖徳、堀江健生
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会
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  • [Presentation] カタユウレイボヤにおけるNK6遺伝子の転写調節領域の解析2021

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  • [Presentation] 単一細胞トランスクリプトーム解析によるホヤ幼生尾部の双極型感覚神経細胞の分化機構の解析2021

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      堀江良子、日下部岳広、笹倉靖徳、堀江健生
    • Organizer
      日本動物学会第92回大会
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  • [Remarks] 大阪大学大学院生命機能研究科1細胞神経ホームページ

    • URL

      https://cionaneuron.wixsite.com/labhomepage

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  • [Remarks] 堀江研究室ホームページ

    • URL

      https://cionaneuron.wixsite.com/labhomepage

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URL: 

Published: 2021-10-22   Modified: 2024-12-25  

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