| Project Area | In-cell chemical network driven by neo-PTMs |
|---|
| Project/Area Number |
22H05019
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (B)
|
| Allocation Type | Single-year Grants |
|---|
| Review Section |
Transformative Research Areas, Section (II)
|
|---|
| Research Institution | Ritsumeikan University (2024)
Institute of Physical and Chemical Research (2022-2023) |
|---|
Principal Investigator |
五月女 宜裕 立命館大学, 生命科学部, 教授 (50431888)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2022-05-20 – 2025-03-31
|
| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2024)
|
| Budget Amount *help |
¥40,170,000 (Direct Cost: ¥30,900,000、Indirect Cost: ¥9,270,000)
Fiscal Year 2024: ¥13,390,000 (Direct Cost: ¥10,300,000、Indirect Cost: ¥3,090,000)
Fiscal Year 2023: ¥13,390,000 (Direct Cost: ¥10,300,000、Indirect Cost: ¥3,090,000)
Fiscal Year 2022: ¥13,390,000 (Direct Cost: ¥10,300,000、Indirect Cost: ¥3,090,000)
|
|---|
| Keywords | neo-PTMs / 翻訳後修飾 / 生理活性分子 / 生物活性分子 / 有機合成化学 / 酵素 / 質量解析 |
|---|
| Outline of Research at the Start |
生命は、ゲノム (DNA)・トランスクリプトーム (RNA)・プロテオーム (タンパク質)・メタボローム (代謝物質) など複数の階層にまたいだ分子間相互作用ネットワークにより制御される。これらの階層間ネットワークの多くは酵素を介した翻訳後修飾反応により制御されており、これらの破綻は疾患と密接に関連すると考えられる。しかし、承認薬も含めて、外部刺激がもたらすネットワークの変化についての系統的な理解は遅れている。本研究では、承認薬やケミカルプローブにより誘導されるneo-PTMsを解析し、また、これに連動して引き起こされる階層間シナジー変化を理解し、そして制御するための方法論を開拓する。
|
| Outline of Annual Research Achievements |
生命は、DNA・RNA・タンパク質・代謝物質などの分子間相互作用ネットワークにより制御される。これらの階層間ネットワークの制御には酵素を介した化学反応が重要な役割を果たしており、その破綻は疾患と密接に関連する。本研究では生体が元来備えていない人工的修飾、あるいはその存在が不明な内在性修飾をneo-PTMsとして定義し、これにより引き起こされる階層間シナジー変化を理解しそして制御することを目指している。
我々は、天然のメチル源ミミックProSeAM (Propargylic Se-adenosyl-l-selenomethionine) を用い、タンパク質基質に人工的目印を導入する方法を発信してきた。特に、KO細胞の抽出液に対して、ProSeAM/リコンビナント酵素の添加、SILAC (stable isotope labeling by amino acids in cell culture) を組み合わせたPMS (ProSeAM/MTase/SILAC) 法を確立することで、より精度高くneo-PTMsを探索することが可能となった。本年度は、PMS法を駆使してリボソームタンパク質RPL3、ヒスチジン3位 (タウ位) にプロパルギル基が導入されることを見出した。またこのneo-PTMsが生体のメチル化反応を再現していることを示した。さらに共同研究を通じて、メチル化はチロシンコドンでの翻訳の速さの調節・新生ポリペプチド品質管理に重要な役割を果たすことが示唆された。また、酵素は触媒毒にならないことに着眼し、複数の酵素を添加することでneo-PTMs導入効率を向上させる新手法についても重要な知見が得られた。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
neo-PTMs導入技術をさらに発展させるための新展開において重要な知見が得られた。また、A03班を含む複数の共同研究を推進することで、メチル化によるチロシンコドンでの翻訳の速さの調節・新生ポリペプチド品質管理についての成果を発信することができた。
|
| Strategy for Future Research Activity |
今後も、独自の方法論を基盤としてneo-PTMsの導入、探索、制御研究を推進する。メチル化関連酵素阻害剤は、創薬ターゲットとして注目を集めるが、人工修飾という視点において、関連する低分子と酵素との構造と活性の相関は未だほとんどわかっていない。人工修飾反応を導入するために重要な構造情報の抽出について焦点を当てる。また共同研究をさらに発展させ、neo-PTMs導入・探索をさらに加速させるとともに、あらたな生物学的機能の発見・創出を計画的に実践する。
|
