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Molecular bases and evolutionary process of the in vivo flagellar drill motility.

Planned Research

Project AreaThe reason why microbes are moving: The dawn of behavioral microbiology
Project/Area Number 22H05068
Research Category

Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Transformative Research Areas, Section (III)
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

菊池 義智  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究グループ長 (30571864)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 竹下 和貴  秋田県立大学, 生物資源科学部, 助教 (40799194)
下地 博之  琉球大学, 農学部, 准教授 (50726388)
Project Period (FY) 2022-05-20 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥53,560,000 (Direct Cost: ¥41,200,000、Indirect Cost: ¥12,360,000)
Fiscal Year 2024: ¥17,810,000 (Direct Cost: ¥13,700,000、Indirect Cost: ¥4,110,000)
Fiscal Year 2023: ¥17,810,000 (Direct Cost: ¥13,700,000、Indirect Cost: ¥4,110,000)
Fiscal Year 2022: ¥17,940,000 (Direct Cost: ¥13,800,000、Indirect Cost: ¥4,140,000)
Keywords行動学 / 微生物 / べん毛 / 遺伝的基盤 / 進化
Outline of Research at the Start

ホソヘリカメムシは土壌中からBurkholderia共生細菌を獲得するが、土壌には数10万種もの細菌が生息していることを考えると、この共生特異性は驚異的である。この特異性は一体どのように決まっているのだろうか?これまでに我々は、ホソヘリカメムシの消化管には細菌選別器官が存在すること、この選別器官を突破するために共生細菌は新規運動性「ドリル戦車型べん毛運動」を発達させていることを明らかにしてきた。本研究では、選別器官内の物理環境の解明、ドリル戦車運動時の遺伝子発現解析、およびドリル運動不全株のスクリーニングを実施し、共生特異性の肝となる「ドリル戦車型べん毛運動」の遺伝的基盤と進化過程を解明する。

Outline of Annual Research Achievements

本研究領域では、我々独自の発見である共生・病原性細菌の「ドリル戦車型べん毛運動」に的を絞り、宿主体内(即ち”in vivo”)における動きを観察し、そのin vivo における動作原理を解明し、種間比較および遺伝子移植実験を通してその進化原理を解明することを具体的な達成目標とする。具体的には以下のような6つの研究を遂行する:① In vivoの動きを視る(高感度顕微鏡による微細観察);② In vivo運動を再現する(マイクロデバイス開発);③ In vivo運動の動作原理を解明する( シミュレーション);④ In vivoの物理的環境を解明する(粘性分析・化学分析);⑤ In vivo運動の遺伝的基盤を解明する(オミクス解析・逆遺伝学);⑥ In vivo運動の進化を解明する(細菌の種間比較・遺伝子移植)。本計画研究では、これら6つの領域達成目標のうち目標④‐⑥を担当し、ホソヘリカメムシのBurkholderia共生細菌に見られるドリル戦車型べん毛運動の遺伝的基盤およびその進化プロセスの解明を目指す。具体的には、Burkholderia共生細菌のゲノム比較や遺伝子発現比較、トランスポゾンを用いた網羅的変異株スクリーニング(Tn-seq)、べん毛形成に関わる遺伝子変異株のスクリーニングを行い、ドリル戦車型べん毛運動の遺伝的基盤を解明する。
本年度は、物理シミュレーションや顕微計測の結果からドリル運動に関連すると推測されたフックとその周辺のべん毛パーツについて解析を開始した。ドリル運動ができる共生Burkholderias種とドリル運動ができない非ドリル種とでフックの構造比較を行い、またこれら細菌種間でフックの交換実験を行った。その結果、これらべん毛パーツがドリル運動の発現において重要な役割を果たすことが明らかとなってきた。また本年は、共生細菌がドリル戦車で突破する狭窄部(CR:Constricted region)の遺伝子発現解析をすすめ、その発現遺伝子の網羅的解析に着手した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

べん毛ドリル運動を司る遺伝子の特定に大きく近づき、順調な成果を得ることができたと言える。

Strategy for Future Research Activity

領域内の他の計画班とも協力し、べん毛ドリル運動に関わると考えられる他のパーツについても調査を進める。また、CRの発現遺伝子についても解析を進め、宿主昆虫側の細菌選別機構の進化についても調査を進める。

Report

(1 results)
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 6 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 6 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] CNRS(フランス)

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  • [Int'l Joint Research] University of Arizona(米国)

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  • [Journal Article] Symbiont coordinates stem cell proliferation, apoptosis, and morphogenesis of gut symbiotic organ in the stinkbug-Caballeronia symbiosis2023

    • Author(s)
      Jang Seonghan、Matsuura Yu、Ishigami Kota、Mergaert Peter、Kikuchi Yoshitomo
    • Journal Title

      Frontiers in Physiology

      Volume: 13 Pages: 01-13

    • DOI

      10.3389/fphys.2022.1071987

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  • [Journal Article] High Prevalence of <i>Pantoea</i> spp. in Microbiota Associated with the Sorghum Plant Bug <i>Stenotus rubrovittatus</i> (Heteroptera: Miridae)2023

    • Author(s)
      Sato Yuto、Akao Tatsuki、Takeshita Kazutaka
    • Journal Title

      Microbes and Environments

      Volume: 38 Issue: 3 Pages: n/a

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME22110

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
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  • [Journal Article] Intercontinental Diversity of <i>Caballeronia</i> Gut Symbionts in the Conifer Pest Bug <i>Leptoglossus occidentalis</i>2022

    • Author(s)
      Ohbayashi Tsubasa、Cossard Raynald、Lextrait Ga?lle、Hosokawa Takahiro、Lesieur Vincent、Takeshita Kazutaka、Tago Kanako、Mergaert Peter、Kikuchi Yoshitomo
    • Journal Title

      Microbes and Environments

      Volume: 37 Issue: 3 Pages: n/a

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME22042

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Resilience of native ant community against invasion of exotic ants after anthropogenic disturbances of forest habitats2022

    • Author(s)
      Hiroyuki Shimoji, Mayuko Suwabe, Tomonori Kikuchi, Hitoshi Ohnishi, Hirotaka Tanaka, Kengo Kawara, Yusuke Hidaka, Tsutomu Enoki, Kazuki Tsuji
    • Journal Title

      Ecology and Evolution

      Volume: 12 Issue: 7

    • DOI

      10.1002/ece3.9073

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Individual experience influences reconstruction of division of labour under colony disturbance in a queenless ant species2022

    • Author(s)
      Yasunari Tanaka, Masaru K. Hojo, Hiroyuki Shimoji
    • Journal Title

      Frontiers in Zoology

      Volume: 19 Issue: 1

    • DOI

      10.1186/s12983-022-00466-9

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of “ <i>Candidatus</i> Hydrogeosomobacter endosymbioticus,” an Intracellular Bacterial Symbiont of the Anaerobic Ciliate Scuticociliate GW72022

    • Author(s)
      Shiohama Yasuo、Takeshita Kazutaka、Hirakata Yuga、Nobu Masaru K.、Ito Michihiro、Shinzato Naoya
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 11 Issue: 2 Pages: 438-447

    • DOI

      10.1128/mra.01150-21

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 昆虫の腸内共生における特異性の進化2022

    • Author(s)
      菊池義智
    • Organizer
      第6回原生生物学・共生生物学談話会(共催:原生生物・寄生虫・進化セミナー)
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  • [Presentation] 昆虫の生き方を決める腸内微生物2022

    • Author(s)
      菊池義智
    • Organizer
      バイオミメティクス市民セミナー
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  • [Presentation] 共生細菌のちからで害虫が農薬に強くなる助け合いの仕組み2022

    • Author(s)
      菊池義智
    • Organizer
      バイオインダストリー協会 “未来へのバイオ技術”勉強会
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  • [Presentation] Transmissible Pesticide Resistance: Invisible Friends of Insects2022

    • Author(s)
      Yoshitomo Kikuchi
    • Organizer
      GRC Drug Resistance
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 昆虫と腸内細菌の共生特異性を決める多層メカニズム2022

    • Author(s)
      菊池義智
    • Organizer
      日本マイコトキシン学会第 88 回学術講演会
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  • [Presentation] 北海道のワイン用ブドウに発生するカスミカメに関する研究2022

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      菊池義智
    • Organizer
      2022年度道産ワイン懇談会培醸造技術検討委員会オンラインセミナー
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    • Invited
  • [Presentation] Exploring the intricacies of relationships between social insects and microorganisms.2022

    • Author(s)
      Marielle Postava-Davignon, Tatsuya Inagaki, Hiroyuki Shimoji.
    • Organizer
      19TH Congress of the International Union for the Study of Social Insects.
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A novel defensive gut symbiont of Diacamma cf . indicum from Japan.2022

    • Author(s)
      Hiroyuki Shimoji
    • Organizer
      19TH Congress of the International Union for the Study of Social Insects.
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Obligate gut symbiosis with environmentally-acquired Paraburkholderia in a stink bug, Physopelta gutta (Pyrrhocoroidea: Largidae).2022

    • Author(s)
      Kazutaka Takeshita, Yoshitomo Kikuchi.
    • Organizer
      18th International Symposium on Microbial Ecology (ISME18)
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    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 微生物が動く意味

    • URL

      https://ugokuimi.com/

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Published: 2022-05-25   Modified: 2024-12-25  

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