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Mechanochemical feedback and emergence of tissue function in luminal tissues

Planned Research

Project AreaMechanical self-transformation of living systems
Project/Area Number 22H05168
Research Category

Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Transformative Research Areas, Section (III)
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

Phng LiKun  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームディレクター (70794098)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 進藤 麻子  大阪大学, 大学院理学研究科, 教授 (60512118)
藤森 俊彦  基礎生物学研究所, 初期発生研究部門, 教授 (80301274)
Project Period (FY) 2022-06-16 – 2027-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2025)
Budget Amount *help
¥258,180,000 (Direct Cost: ¥198,600,000、Indirect Cost: ¥59,580,000)
Fiscal Year 2025: ¥41,860,000 (Direct Cost: ¥32,200,000、Indirect Cost: ¥9,660,000)
Fiscal Year 2024: ¥43,160,000 (Direct Cost: ¥33,200,000、Indirect Cost: ¥9,960,000)
Fiscal Year 2023: ¥47,060,000 (Direct Cost: ¥36,200,000、Indirect Cost: ¥10,860,000)
Fiscal Year 2022: ¥87,360,000 (Direct Cost: ¥67,200,000、Indirect Cost: ¥20,160,000)
Keywordsメカノケミカルフィードバック / 管腔組織 / 組織構築 / 管腔メカニクス
Outline of Research at the Start

血管や甲状腺、子宮、消化管など生体内の臓器の多くは管腔構造を持つが、その多様な形態やサイズがどのようにして形成されるのか不明な点が多い。管腔内には細胞や液性因子など、その器官の機能に関わる内容物が存在し、管腔を形成する細胞は内容物とのやりとりによって管腔形態を構築する可能性が考えられる。本研究では、複数のモデル動物と管腔組織を対象として、管腔内容物とその周囲の細胞との相互作用 (メカノケミカルフィードバック) の実体を分子的に明らかにし、管腔形成の多様な形態を形成するための基本原理の解明を目指す。

Outline of Annual Research Achievements

血管 (ゼブラフィッシュ)、甲状腺 (アフリカツメガエル)、子宮 (マウス) を対象とし、以下の内容を実施した。ゼブラフィッシュの血管網形成における血管内壁のせん断応力および圧力分布を計算するために、3次元の流体力学モデルを確立した。血液の流れ、血管壁のせん断応力および圧力が、ヘマトクリット値や血管の形態の変化にどのように適応するかを検証するために、上記モデルをゼブラフィッシュの実験と組み合わせた。さらに、血流の力の変化に対する内皮細胞の応答をアクチン線維の可視化により検証した。その結果、血流の増加がアクチン細胞骨格を再構築し、細胞皮質でより多くのアクチンメッシュが形成されることが分かった。ツメガエル甲状腺においては、内腔内容物の抽出を試みたが、腔が小さいためガラスキャピラリーでも太すぎること、甲状腺周囲には硬い膜が存在することがわかり、新たなツールの開拓が必要となることがわかった。また、内腔の動態を明らかにするために全身の細胞膜に蛍光タンパク質を発現する変異体幼生を用いてライブイメージングを試みた。甲状腺を単離し、組織培養法を併用することで細胞レベルの解像度でライブイメージングを行うことができた。マウス子宮においては、内膜上皮の自律的変形、上皮を取り囲む子宮間質細胞の増殖あるいは、子宮筋の動きによる機械的力による影響のいずれによって子宮上皮層が変形するか判定を行った。子宮内膜上皮細胞の変形の解析により、胚のごく周辺とその他の領域では上皮細胞の伸長方向が異なること、間質細胞の増殖や子宮筋の動きを抑制した際にも上皮形態は正常におきることから、上皮細胞の自律的変化により着床室が形成されることが示唆された。そこで、質量分析による子宮上皮細胞で発現するタンパク質の変化の解析を開始した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

研究員の雇用が2023年10月から開始したため

Strategy for Future Research Activity

ゼブラフィッシュ血管形成研究では、内皮細胞の機械的応答に対するせん断応力と圧力の影響を区別するため、ヒト動脈内皮細胞を用いたex vivoシステムの確立を目指す。これにはIbidiポンプシステムとFlexCellテンションシステムをそれぞれ使用する。また、内皮細胞が異なる種類の力にさらされたときの細胞の形態、配向、極性などの挙動、アクチン細胞骨格の再構築、および細胞間接合の形態を解析する。さらに、ゼブラフィッシュにおける血流の力の変化が内皮細胞接合の形態と動態に与える影響について検証する。ツメガエル甲状腺においては、組織培養法を用いたライブイメージングを継続し、内腔の動態の解析を進める。また、これまでのライブイメージングから細胞が活発に動くことが示唆されているため、細胞骨格や細胞外マトリックスがどのような細胞駆動力を生み出しているか検証する。マウス子宮においては、子宮上皮細胞の形態変化をもたらす機構の解明を進める。また、着床室形成に伴って、着床後の胚と子宮の位置関係がどのような機構により成立するか解析を進める。さらに、胚から子宮上皮細胞への着床室形成を誘導する刺激が入力される際に、胚からの化学的刺激及び物理刺激のいずれかが重要か解析する 。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (37 results)

All 2023 2022

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 7 results) Presentation (29 results) (of which Int'l Joint Research: 9 results,  Invited: 21 results) Funded Workshop (1 results)

  • [Journal Article] Effective mechanical potential of cell-cell interaction explains three-dimensional morphologies during early embryogenesis2023

    • Author(s)
      H Koyama, H Okumura, AM Ito, K Nakamura, T Otani, K Kato, T Fujimori
    • Journal Title

      PLoS Computational Biology

      Volume: 19 Issue: 8 Pages: 1-27

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1011306

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A cell-and-plasma numerical model reveals hemodynamic stress and flow adaptation in zebrafish microvessels after morphological alteration2023

    • Author(s)
      Maung Ye Swe Soe、Phng Li-Kun
    • Journal Title

      PLOS Computational Biology

      Volume: 19 Issue: 12 Pages: 1-35

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1011665

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] β-adrenergic receptor regulates embryonic epithelial extensibility through actomyosin inhibition2023

    • Author(s)
      Mizoguchi Yohei、Nakashima Kaoru、Sato Ayato、Shindo Asako
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 26 Issue: 12 Pages: 108469-108469

    • DOI

      10.1016/j.isci.2023.108469

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Tissues flow and grow2023

    • Author(s)
      Shindo Asako
    • Journal Title

      Nature Physics

      Volume: 19 Issue: 7 Pages: 938-938

    • DOI

      10.1038/s41567-023-01996-7

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Generation of pulsatile ERK activity in mouse embryonic stem cells is regulated by Raf activity2023

    • Author(s)
      Toyooka Yayoi、Aoki Kazuhiro、Usami Fumiko Matsukawa、Oka Sanae、Kato Azusa、Fujimori Toshihiko
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 1-12

    • DOI

      10.1038/s41598-023-36424-6

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Nutritional control of thyroid morphogenesis through gastrointestinal hormones2022

    • Author(s)
      Takagishi Maki、Aleogho Binta Maria、Okumura Masako、Ushida Kaori、Yamada Yuichiro、Seino Yusuke、Fujimura Sayoko、Nakashima Kaoru、Shindo Asako
    • Journal Title

      Current Biology

      Volume: 32 Issue: 7 Pages: 1485-1496

    • DOI

      10.1016/j.cub.2022.01.075

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] High-Throughput Imaging of Blood Flow Reveals Developmental Changes in Distribution Patterns of Hemodynamic Quantities in Developing Zebrafish2022

    • Author(s)
      Maung Ye Swe Soe、Kim Jung Kyung、Carretero Nuria Taberner、Phng Li-Kun
    • Journal Title

      Frontiers in Physiology

      Volume: 13 Pages: 1-23

    • DOI

      10.3389/fphys.2022.881929

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] ライブイメージングデータから細胞間相互作の力の4次元マップを推定して形態形成を理解する2023

    • Author(s)
      Hiroshi Koyama, Toshihiko Fujimori
    • Organizer
      第46回 日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] ライブイメージング画像を用いた多細胞組織内の細胞間相互作用の力の推定2023

    • Author(s)
      Hiroshi Koyama, Toshihiko Fujimori
    • Organizer
      第61回 日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] ライブイメージングデータを用いた力の推定と形態形成における細胞間相互作用のポテンシャルエネルギーの役割2023

    • Author(s)
      Hiroshi Koyama, Toshihiko Fujimori
    • Organizer
      The 56th annual meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] マウス胚の着床時に起こる子宮内膜上皮のリモデリング2023

    • Author(s)
      Jun Sakurai, Youko Higuchi, Azusa Kato, Toshihiko Fujimori
    • Organizer
      The 56th annual meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] マウスにおける胚の形態と前後軸形成の子宮内解析2023

    • Author(s)
      Seiya Mikoshiba, Toshihiko Fujimori
    • Organizer
      The 56th annual meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Regulation of endothelial cell behaviours by actin cytoskeleton and hydrostatic pressure during blood vessel morphogenesis2023

    • Author(s)
      Li-Kun Phng
    • Organizer
      A*Star Singapore
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Mechanics of vascular tube formation and diameter regulation2023

    • Author(s)
      Li-Kun Phng
    • Organizer
      2023 Gordon Research Conference Angiogenesis
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Mechanics of blood vessel lumenization and remodelling2023

    • Author(s)
      Li-Kun Phng
    • Organizer
      75th Annual Meeting of Japan Society of Cell Biology
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Mechanics of blood vessel lumenization and remodelling2023

    • Author(s)
      Li-Kun Phng
    • Organizer
      90th IRCMS Seminar-Symposium on New Horizons in Developmental Biology, Kumamoto University, Japan
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] A role of hydrostatic pressure in regulating endothelial cel migration during sprouting angiogenesis2023

    • Author(s)
      Li-Kun Phng
    • Organizer
      MBI Conference 2023, Mechanobiology in Health and Disease, Singapore
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 栄養環境に依存する器官形態形成と細胞集団運動2023

    • Author(s)
      Asako Shindo
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 環境に応答する器官形態形成と細胞集団運動2023

    • Author(s)
      Asako Shindo
    • Organizer
      第47回比較内分泌学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] アフリカツメガエルで見る細胞集団運動と形態形成2023

    • Author(s)
      Asako Shindo
    • Organizer
      第94回日本動物学会, 学会企画シンポジウム,
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Nutrients control thyroid morphogenesis - Regulation of cell polarity by collective ell movement2023

    • Author(s)
      Asako Shindo
    • Organizer
      19th International Xenopus Conference
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Multi-lumina organization during thyroid morphogenesis2023

    • Author(s)
      Asako Shindo
    • Organizer
      第75回日本細胞生物学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Nutritional control of thyroid morphogenesis2023

    • Author(s)
      Asako Shindo
    • Organizer
      Cell and Developmental Biology of Xenopus Course
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Trans-Scale Polarity Formation in the Mouse Oviduct2022

    • Author(s)
      Toshihiko Fujimori
    • Organizer
      The 68th NIBB Conference "Principles of Cell Communication in the Tissue"
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Trans-Scale Polarity Formation in the Mouse Oviduct2022

    • Author(s)
      Toshihiko Fujimori
    • Organizer
      COS symposium 2022 Building Functionality - The Relevance of Form Across Biological Scales
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Nutritional control of thyroid morphogenesis,2022

    • Author(s)
      Asako Shindo
    • Organizer
      3rd NINS-Princeton Joint Symposium, Emerging Life Sciences
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      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 甲状腺の形態形成を制御する全身性機構と細胞運動2022

    • Author(s)
      Asako Shindo
    • Organizer
      第128回日本解剖学会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 栄養に依存する器官形態形成をオタマジャクシで紐解く2022

    • Author(s)
      Asako Shindo
    • Organizer
      広島大学両生類研究センターバイオリソース棟落成記念シンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 4.Regulation of morphological homeostasis of the epithelial tissue during development2022

    • Author(s)
      Asako Shindo
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
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      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 栄養が制御する甲状腺形態形成と細胞接着分子の役割2022

    • Author(s)
      Asako Shindo
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
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      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Mechanics of blood vessel lumenization and remodelling2022

    • Author(s)
      Li-Kun Phng
    • Organizer
      Biozentrum, University of Basel, Switzerland
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      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Mechanics of blood vessel lumenization and remodelling2022

    • Author(s)
      Li-Kun Phng
    • Organizer
      Australian Vascular Biology Meeting 2022
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      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Mechanics of blood vessel lumenization and remodelling2022

    • Author(s)
      Li-Kun Phng
    • Organizer
      Engineering Mechanics of Cell and Tissue Morphogenesis Symposium, Japan
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Imaging blood flow and endothelial cell mechanics during zebrafish vascular morphogenesis2022

    • Author(s)
      Li-Kun Phng
    • Organizer
      Kick-off Symposium of Kento Imaging Support, Osaka, Japan
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Mechanics of vascular tube formation and diameter regulation2022

    • Author(s)
      Li-Kun Phng
    • Organizer
      Molecular Biology Society of Japan Annual Meeting 2022
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Mechanics of vascular tube formation, maintenance and diameter regulation2022

    • Author(s)
      Li-Kun Phng
    • Organizer
      12th International Kloster Seeon Meeting “Angiogenesis”, Germany
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Funded Workshop] 第75回日本細胞生物学会, Session on "Mechano-chemical crosstalk at the luminal interface"2023

    • Related Report
      2023 Annual Research Report

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Published: 2022-06-20   Modified: 2025-06-20  

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