[Amyloid and protein] Comprehensive search and validation of meta-aggregates by molecular evolutionary method

• Project Area: Supramolecular behavior and dynamic capture of metastable amyloid aggregates
• Project/Area Number: 23H03852
• Research Category: Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Transformative Research Areas, Section (III)
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: 村上 一馬 京都大学, 農学研究科, 准教授 (80571281)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 水口 賢司 大阪大学, 蛋白質研究所, 教授 (50450896) ; 坂下 泰浩 金沢大学, 附属病院, 助教 (10972119)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥62,270,000 (Direct Cost: ¥47,900,000、Indirect Cost: ¥14,370,000); Fiscal Year 2025: ¥21,450,000 (Direct Cost: ¥16,500,000、Indirect Cost: ¥4,950,000); Fiscal Year 2024: ¥20,930,000 (Direct Cost: ¥16,100,000、Indirect Cost: ¥4,830,000); Fiscal Year 2023: ¥19,890,000 (Direct Cost: ¥15,300,000、Indirect Cost: ¥4,590,000)
• Keywords: RNA結合タンパク質 / アミロイド / 神経変性疾患 / 計算科学 / 高速AFM / 分子進化

Outline of Research at the Start

RNA結合タンパク質（RBP）は，RNAに結合することでタンパク質翻訳調節を担う一方，近年凝集性を獲得することで神経変性を引き起こすことが注目されている．そこで，本研究者らは神経変性疾患の病態解明を目指して，RBPと不均一に共凝集したメタアグリゲートによる病態仮説を立てた．本研究では，新たなメタアグリゲートの探索を目的として，ex vivo SELEX法による分子進化実験によって，メタアグリゲートに結合しやすいRNA配列を同定する．さらに，アミロイドー鍵蛋白質ーRNAの3者からなる新規メタアグリゲートを探索し，その形成機構および病態機序の解明を目指す．