| Project Area | Philostasis: A universal principle of "pausing" in multicellular tissues. |
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| Project/Area Number |
23H03862
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Review Section |
Transformative Research Areas, Section (III)
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| Research Institution | Tokyo Medical and Dental University |
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Principal Investigator |
廣瀬 遥香 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 助教 (90764754)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
林 弓美子 福井大学, 学術研究院医学系部門, 助教 (00844127)
本田 瑞季 広島大学, 統合生命科学研究科(理), 助教 (50828978)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2024)
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| Budget Amount *help |
¥62,400,000 (Direct Cost: ¥48,000,000、Indirect Cost: ¥14,400,000)
Fiscal Year 2024: ¥20,410,000 (Direct Cost: ¥15,700,000、Indirect Cost: ¥4,710,000)
Fiscal Year 2023: ¥21,580,000 (Direct Cost: ¥16,600,000、Indirect Cost: ¥4,980,000)
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| Keywords | 多細胞休止 |
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| Outline of Research at the Start |
生体を構成する多細胞組織は、環境ストレスに対して、細胞間コミュニケーションを介して休止することで、長期間の自己防衛や自己保存を可能にしている。
本研究ではプログラムされた多細胞組織の活動休止の共通性を炙り出す解析技術を開発する。最先端の統計科学と機械学習、光単離技術（PIC）、ライブイメージング技術を融合し、プログラムされた多細胞組織の活動休止の共通性を炙り出す。さらに、得られたオミクス情報・イメージングデータをもとに、多細胞組織内の個々の細胞の運命予測を可能とする機械学習手法を構築し、休止状態を人為的に操る技術を開発する。
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| Outline of Annual Research Achievements |
生体を構成する多細胞組織は、環境ストレスに対して、細胞間コミュニケーションを介して休止することで、長期間の自己防衛や自己保持を可能にしている。従来の活動休止研究は、固定観念と技術的な障壁により、発生休止、幹細胞、潜伏がん、種子休眠など独立な事象として個別に進められてきた。
そこで本研究では、プログラムされた多細胞組織の活動休止の共通性を炙り出す解析技術を開発する。具体的には、最先端の統計科学と機械学習、光単離化学（PIC）、ライブイメージング技術を融合し、プログラムされた多細胞組織の活動休止の共通性を炙り出す。さらに、得られたオミクス情報・イメージングデータをもとに、多細胞組織内の個々の細胞の運命予測を可能とする機械学習手法を構築し、休止状態を人為的に操る技術を開発する。
本年度は、空間的トランスクリプトームデータ解析技術さらに深化させ、従来よりも高精度な細胞局在推定を推定する新規解析手法の開発を行った。これにより、微小環境における静止期細胞の位置およびその周囲の細胞との相互作用を、より正確に把握することが可能となった。新たに開発した解析手法を活用し、隣接する細胞間の相互作用のみならず、中程度の距離を介した細胞間相互作用も検出することができるようになった。この技術的進展により、腫瘍微小環境における広範な細胞間ネットワークの理解が一層深まり、従来見過ごされていた多くの相互作用を捕捉することが可能となる。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
研究計画遂行のための新規解析手法の開発を行った。
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| Strategy for Future Research Activity |
現在までの成果を基に、他班から収集される多様な活動休止サンプルについて、オミクス解析、光単離化学（PIC）、ライブイメージング技術を用いて解析をすすめる。
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