| Project Area | Integrative bioarchaeological studies on human prehistory in the Japanese archipelago |
|---|
| Project/Area Number |
23H04846
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
|
| Allocation Type | Single-year Grants |
|---|
| Review Section |
Transformative Research Areas, Section (I)
|
|---|
| Research Institution | Hokkaido University |
|---|
Principal Investigator |
長田 直樹 北海道大学, 情報科学研究院, 准教授 (70416270)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
佐藤 孝雄 慶應義塾大学, 文学部(三田), 教授 (20269640)
本郷 一美 総合研究大学院大学, 統合進化科学研究センター, 准教授 (20303919)
寺井 洋平 総合研究大学院大学, 統合進化科学研究センター, 准教授 (30432016)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2028-03-31
|
| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2025)
|
| Budget Amount *help |
¥74,360,000 (Direct Cost: ¥57,200,000、Indirect Cost: ¥17,160,000)
Fiscal Year 2025: ¥15,600,000 (Direct Cost: ¥12,000,000、Indirect Cost: ¥3,600,000)
Fiscal Year 2024: ¥15,470,000 (Direct Cost: ¥11,900,000、Indirect Cost: ¥3,570,000)
Fiscal Year 2023: ¥12,480,000 (Direct Cost: ¥9,600,000、Indirect Cost: ¥2,880,000)
|
|---|
| Keywords | ゲノム / 進化 / 日本列島 / 動物考古学 / 古代ゲノム / 家畜化 / 環境適応 / 哺乳類 / 考古学 |
|---|
| Outline of Research at the Start |
本研究計画では，日本列島における人類と環境とのかかわりを明らかにするために，動物相に注目した研究を行う．以下の3つの動物群を中心的対象とする．①人類が作り出した環境に片利共生するコメンサルアニマルとして重要なネズミ類の遺伝的多様性をゲノム解析により調べ，渡来とその後のヒトの往来に伴う遺伝的交流についての推定を行う．②イヌの古代ゲノム情報から，時代ごとのイヌの形態と形質を復元し，その当時の人類との共生関係を明らかにする．③野生イノシシと家畜化されたブタとの関連を，動物考古学的手法や現代・古代ゲノム解析によって明らかにする．
|
| Outline of Annual Research Achievements |
本年度は，げっ歯類のゲノム配列解析を進めるとともに，イヌ/オオカミ，オオヤマネコ，ブタ/イノシシなどの古代ゲノム解析を進めた．古代ゲノム解析については，主としてDNA抽出とそのクオリティチェック，および古代ゲノム解読を中心に進めた．
ハツカネズミの世界的なゲノム多様性を解析するための国際コンソーシアム（Wild Mouse Genome Project）に参画し，サンプルデータの共有などについて準備を進めている．また，これまで考えてこなかった，南中国→山東省/河北省→韓半島/沿海州への，弱いながらも遺伝子流動の痕跡が見られ，それに符合してマウス白血病ウイルスへの抵抗性に関わるFv4遺伝子の急速な遺伝子浸透が起こったことが示された．
イヌ/オオカミについては，更新世の更新世オオカミ2個体，弥生時代のイヌ5個体，縄文時代のイヌ3個体，江戸時代のイヌ5個体，江戸時代のニホンオオカミ5個体，韓国の青銅器時代のイヌ5個体について，新たにDNA抽出/NGS解析を行った．その結果，韓国の弥生時代相当のイヌは洋犬からの遺伝子流動が少なくdingo/NGSD（New Guinea singing dog）に近縁であることが分かった．
オオヤマネコについては，合計3個体の古代ゲノム解読を行い，世界中の現代/古代オオヤマネコのゲノムデータと併せて解析を行った．その結果，日本列島のオオヤマネコには北日本と南日本の2つの系統が存在すること，南日本系統は世界中のすべてのオオヤマネコの基底に位置することが分かった．
ブタ/イノシシについては，縄文時代の個体からDNA抽出を行った．また，B02班（公募班）との共同で，サハリンや礼文島から出土したオホーツク文化期のカラフトブタのDNA抽出と古代ゲノム解析を行った．
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
現代ゲノムおよび古代ゲノムの解析，考古学的な検討と，おおむね予定通りに進捗している．当初の計画になかったカラフトブタの共同研究なども進んでいるが，全体を平均しておおむね順調に進展していると自己評価する．
|
| Strategy for Future Research Activity |
今後は．現代サンプルのゲノム解析を拡充するとともに，げっ歯類の古代ゲノム解析についても検討を始める．ハツカネズミについては，国際ゲノムプロジェクトに協力し，世界規模でのハツカネズミの移動についての考察も進めて行く．イヌ/オオカミについては，計画通り国内サンプルの古代ゲノム解析を進めて行くと同時に，海外の研究期間とも協力し．より広い視点で解析を進めて行く．ブタ/イノシシ，共同研究によりカラフトブタの研究を進めて行くと同時に，現代ゲノムの解析については公募班で得られた知見も考慮し，解析を進めて行く．
|
