Construction of a natural product nuclear receptor ligand library for latent chemical space

• Project Area: Latent Chemical Space Based on Diverse Natural Products for Bio-active Molecular Design
• Project/Area Number: 23H04883
• Research Category: Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Transformative Research Areas, Section (II)
• Research Institution: Tohoku University
• Principal Investigator: 上田 実 東北大学, 理学研究科, 教授 (60265931)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 藤原 孝彰 東北大学, 多元物質科学研究所, 助教 (70712751)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥127,010,000 (Direct Cost: ¥97,700,000、Indirect Cost: ¥29,310,000); Fiscal Year 2025: ¥25,480,000 (Direct Cost: ¥19,600,000、Indirect Cost: ¥5,880,000); Fiscal Year 2024: ¥24,180,000 (Direct Cost: ¥18,600,000、Indirect Cost: ¥5,580,000); Fiscal Year 2023: ¥27,040,000 (Direct Cost: ¥20,800,000、Indirect Cost: ¥6,240,000)
• Keywords: ジャスモン酸 / コロナチン / COI1-JAZ / アゴニスト / 受容体

Outline of Research at the Start

天然有機化合物（天然物）は構造多様性に富み、強力な生物活性をもつ。研究代表者らは天然物研究に長年従事し、リガンドと受容体との構造的マッチングだけでは生物活性を正しく評価することが難しいという現実に直面してきた。本計画研究では、天然物立体異性体・構造誘導体から成るライブラリーを構築し、これを受容体親和性やシグナル伝達強度のデータに加えて、リガンド-受容体複合体の構造生物学的評価を加味した包括的なデータセットを提供する。また、機械学習からのフィードバックを元に新規生物活性分子を創製し、生物活性新学理に迫る。