| Project Area | Photosynthesis ubiquity: Supramolecular complexes and their regulations to enable photosynthesis all around the globe |
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| Project/Area Number |
23H04964
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Review Section |
Transformative Research Areas, Section (III)
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| Research Institution | Nagahama Institute of Bio-Science and Technology |
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Principal Investigator |
白井 剛 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 教授 (00262890)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
嶺井 隆平 長浜バイオ大学, バイオサイエンス研究科, 助手 (20872451)
土屋 裕子 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 情報・人間工学領域, 主任研究員 (30557773)
土方 敦司 東京薬科大学, 生命科学部, 准教授 (80415273)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2028-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2024)
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| Budget Amount *help |
¥164,450,000 (Direct Cost: ¥126,500,000、Indirect Cost: ¥37,950,000)
Fiscal Year 2024: ¥30,940,000 (Direct Cost: ¥23,800,000、Indirect Cost: ¥7,140,000)
Fiscal Year 2023: ¥46,800,000 (Direct Cost: ¥36,000,000、Indirect Cost: ¥10,800,000)
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| Keywords | 生命分子計算 / 光合成 / 分子進化 / 機械学習 / 祖先型遺伝子 |
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| Outline of Research at the Start |
本研究は現存する生物の光合成超分子複合体遺伝子の祖先遺伝子配列を推定し、祖先遺伝子配列に基づき祖先型光合成超分子複合体のデータベースを構築し、地質学的気候変動データ (気温・濃度など)とデータベースとリンクして機械学習することで、光合成遺伝子の変異と気候変動の相関を解析する。そのために、光合成超分子複合体を構成する遺伝子配列のデータベース化、種・分子系統樹の推定、地質学的気候変動データベースの構築、および遺伝子変異と気候変動を相関するための機械学習器構築を行う。
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