Computational Science of Membrane Permeation: Elucidation of Membrane Modulator Action and Nucleic Acid Permeation Mechanism

Planned Research

Project Area	Cell Membrane Permeation of Oligonucleotides Controlled by Membrane Modulator Molecules
Project/Area Number	24H00843
Research Category	Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (B)
Allocation Type	Single-year Grants
Review Section	Transformative Research Areas, Section (II)
Research Institution	Okayama University
Principal Investigator	篠田渉岡山大学, 先鋭研究領域, 教授 (70357193)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2027-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2025)
Budget Amount *help	¥28,340,000 (Direct Cost: ¥21,800,000、Indirect Cost: ¥6,540,000) Fiscal Year 2025: ¥9,230,000 (Direct Cost: ¥7,100,000、Indirect Cost: ¥2,130,000) Fiscal Year 2024: ¥9,750,000 (Direct Cost: ¥7,500,000、Indirect Cost: ¥2,250,000)
Keywords	膜モジュレータ / 分子動力学シミュレーション / 膜透過 / 核酸輸送 / 核酸医薬 / ペプチド / 分子シミュレーション
Outline of Research at the Start	膜モジュレータ分子を用いた中分子核酸医薬の細胞内送達を実現するため、膜モジュレータの膜作用と核酸医薬の膜透過機構を分子シミュレーションによって探索し、効率的な膜モジュレータ分子設計に貢献する。膜モジュレータ分子の協同的な膜作用を理解し、膜構造の変形や細孔形成などを観察するため、独自に開発した定量的な粗視化力場を拡張し、大規模細胞膜系に適用することで、分子シミュレーションによって、中分子核酸医薬の膜透過を促進する膜モジュレータ分子への必要要件を明らかにする。