Toward theoretical descriptions of suparmolecular assemblies based on characteristics of molecular interactions

Planned Research

Project Area	Biological cluster: dynamic assembly and functional properties of supramolecular complexes in cells
Project/Area Number	24H02288
Research Category	Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
Allocation Type	Single-year Grants
Review Section	Transformative Research Areas, Section (III)
Research Institution	Yokohama City University
Principal Investigator	立川正志横浜市立大学, 理学部, 准教授 (30556882)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2029-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥88,270,000 (Direct Cost: ¥67,900,000、Indirect Cost: ¥20,370,000) Fiscal Year 2025: ¥16,120,000 (Direct Cost: ¥12,400,000、Indirect Cost: ¥3,720,000) Fiscal Year 2024: ¥24,830,000 (Direct Cost: ¥19,100,000、Indirect Cost: ¥5,730,000)
Keywords	生物物理 / 分子動力学 / ソフトマター
Outline of Research at the Start	本領域で定義するバイオロジカルクラスターは多分子種から構成された超分子複合体で、それ自身が有機的なシステムを形成する。本研究では、構成分子の構造変化を表現する粗視化分子動力学シミュレーションを行い、複合体のシステム特性である自律性・剛性・頑健性・適応性を明らかにして、超分子クラスターの全体像を特徴づける状態理論の構築を目指す。領域内共同研究の分子システムを対象に、構造解析や人工細胞環境での物理測定を参照した粗視化分子モデルをもとに、それぞれの特性を理解する。そこで得られた特性は観測可能な予測へ変換し、実験検証へつなげることで、超分子クラスターの細胞機能における意義を明らかする。