Deciphering the epicode that controls cell plasticity during early mammalian development

• Project Area: Deciphering the epicode of chromatin, which controls cell fate decisions in organisms
• Project/Area Number: 24H02326
• Research Category: Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Transformative Research Areas, Section (III)
• Research Institution: Kyushu University
• Principal Investigator: 落合 博 九州大学, 生体防御医学研究所, 教授 (60640753)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2029-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥113,490,000 (Direct Cost: ¥87,300,000、Indirect Cost: ¥26,190,000); Fiscal Year 2025: ¥22,620,000 (Direct Cost: ¥17,400,000、Indirect Cost: ¥5,220,000); Fiscal Year 2024: ¥23,400,000 (Direct Cost: ¥18,000,000、Indirect Cost: ¥5,400,000)
• Keywords: 転写 / 細胞運命 / 空間オミクス / 生細胞イメージング / 初期発生

Outline of Research at the Start

本研究は、哺乳類初期発生過程における細胞可塑性を制御するエピコードを解読することを目指す。この目的のため、1細胞・空間オミクス解析プラットフォームと連携し、複数種類のRNA、DNA、タンパク質分子を可視化するマルチモーダル超解像イメージング手法を開発する。さらに、マウス胚をモデルに、１細胞マルチターゲットChILseqによる１細胞・ゲノムワイド・エピゲノム修飾解析、単一遺伝子イメージングによる特定遺伝子の空間配置、転写活性状態解析、ChIP-CryoEMによる原子解像度でのエピコード構造解析を組み合わせ、これら多階層のマルチオミクスデータを統合して細胞可塑性を制御するエピコードを解明する。