腫瘍に関連する完全長攪乱RNAの特徴付け

• Project Area: Integrated understanding of RNA-induced perturbations in living systems and their adaptive mechanisms
• Project/Area Number: 25H01312
• Research Category: Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Transformative Research Areas, Section (III)
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: 村川 泰裕 京都大学, 高等研究院, 教授 (50765469)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2030-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥101,270,000 (Direct Cost: ¥77,900,000、Indirect Cost: ¥23,370,000); Fiscal Year 2025: ¥29,250,000 (Direct Cost: ¥22,500,000、Indirect Cost: ¥6,750,000)
• Keywords: perRNA / トランスクリプトーム解析 / バイオインフォマティクス

Outline of Research at the Start

内在性ウイルス様配列は、過去に感染したウイルスが宿主ゲノムに組み込まれ、代々受け継がれてきたものである。興味深いことに、がん細胞においては内在性ウイルス様配列が再賦活化し、がん特有の攪乱RNA (perRNA) 分子が転写されている。しかし、内在性ウイルス様配列はゲノム上に類似配列が多数存在するため多くの未知が残されたままであった。そこで、申請者らが独自に開発した攪乱RNAシーケンシング技術をヒトの多様な腫瘍サンプルに適用し、perRNAを包括的に発見する。そして、perRNAの完全長構造を基に、本研究領域の専門家と連携して、腫瘍perRNA分子を多角的な観点から特徴付ける。