計算科学と情報科学の融合による膜界面分子動態の解析

• Project Area: Autophagy expanded: decoding membrane interface biology
• Project/Area Number: 25H01329
• Research Category: Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Transformative Research Areas, Section (III)
• Research Institution: Tokyo University of Science
• Principal Investigator: 森 貴治 東京理科大学, 理学部第一部化学科, 准教授 (90402445)
• Project Period (FY): 2025-04-01 – 2030-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2025)
• Budget Amount: ¥59,800,000 (Direct Cost: ¥46,000,000、Indirect Cost: ¥13,800,000); Fiscal Year 2025: ¥13,000,000 (Direct Cost: ¥10,000,000、Indirect Cost: ¥3,000,000)
• Keywords: 分子動力学 / 機械学習 / 膜タンパク質

Outline of Research at the Start

細胞膜界面における分子動態を正確に理解するためには、生命機能の中心を担っているタンパク質の構造変化が、細胞膜の構造動態にどのような影響を与えるのかを精密に解析する必要がある。本研究では、膜タンパク質系に対する分子動力学シミュレーションから得られる膨大なデータの中から、特徴的な構造変化を抽出するための機械学習アルゴリズムを開発する。開発した手法を用いて、オートファジーに関わるタンパク質の構造変化と機能発現機構を脂質ダイナミクスの観点から解明する。