新生鎖フォールディングとシャペロン効果の網羅解析

• Project Area: Nascent-chain Biology
• Project/Area Number: 26116002
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Biological Sciences
• Research Institution: Tokyo Institute of Technology
• Principal Investigator: 田口 英樹 東京工業大学, 科学技術創成研究院, 教授 (40272710)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 今高 寛晃 兵庫県立大学, 工学研究科, 教授 (50201942) ; 富田 野乃 (竹内野乃) 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (80323450)
• Project Period (FY): 2014-07-10 – 2019-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2018)
• Budget Amount: ¥279,630,000 (Direct Cost: ¥215,100,000、Indirect Cost: ¥64,530,000); Fiscal Year 2018: ¥51,220,000 (Direct Cost: ¥39,400,000、Indirect Cost: ¥11,820,000); Fiscal Year 2017: ¥51,220,000 (Direct Cost: ¥39,400,000、Indirect Cost: ¥11,820,000); Fiscal Year 2016: ¥51,350,000 (Direct Cost: ¥39,500,000、Indirect Cost: ¥11,850,000); Fiscal Year 2015: ¥51,090,000 (Direct Cost: ¥39,300,000、Indirect Cost: ¥11,790,000); Fiscal Year 2014: ¥74,750,000 (Direct Cost: ¥57,500,000、Indirect Cost: ¥17,250,000)
• Keywords: 新生鎖 / フォールディング / シャペロン / リボソーム / 無細胞翻訳系 / 翻訳 / 再構築型無細胞翻訳系

Outline of Annual Research Achievements

本計画研究の目的は、生化学、分子生物学、遺伝学、生物物理学などを駆使して、翻訳途上の新生ポリペプチド鎖（新生鎖）がどのような過程を経ながら立体構造を形成（フォールディング）するのか、また、新生鎖のフォールディングを助けるシャペロンの分子機構を明らかにすることである。大腸菌、出芽酵母、ヒト細胞由来の翻訳系の再構成系を中心に研究を推進し、29年度は以下のような研究を推進した。
【田口】大腸菌にて負電荷アミノ酸の連続配列などがリボソームを不安定化して、翻訳の途中終了を引きおこすこと、さらにその仕組みをマグネシウムイオンの感知機構として活用していることを発見した（Mol Cell 2017）。新生鎖フォールディングを助けるシャペロンの一つ、シャペロニンGroELがどのようなタンパク質のフォールディングを細胞内で助けるのかについてフォールディングの速度論解析をなどを行った。ショットガンプロテオミクスを用いて、細胞内での新生鎖フォールディングを大規模に調べる系を構築している。
【今高】ヒト因子由来再構成翻訳システムをベースにした人工細胞を作成し、より細胞に近いin vitro新生鎖研究システムを樹立した（ACS Synthetic Biol. 2018 7: 377）。
【富田】酵母由来再構築型翻訳システムの改良を重ね、翻訳アレストやフレームシフトを高い精度で評価できるシステムを確立した。システムを利用し、eIF5A、eEF2、eEF3、Stm1などの翻訳伸長因子の機能解析を行った。

Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

以下に示すように、当初の計画を大きく超えて新たな研究を展開できている。
【田口】１）本研究では当初細胞内での新生鎖のフォールディングに焦点を絞っていたが、新生鎖研究を進める中で、新生鎖の合成途上で起こる通常ではないリボソームの振る舞いを発見した（新生鎖に依存したリボソーム不安定化：Mol Cell 2017）。これは、終止コドンに依存しない翻訳の終結という見方ができるため、新生鎖そのものが自らの機能発現に積極的に関わる新たな例を見出したと言える。現在、この現象の発見を契機として、より普遍的に終止コドンに依らない翻訳終結を解析している。これは従来想定されている遺伝子読み枠（ORF）の考え方を拡げるという点でも興味深いと考えている。２）シャペロニンGroELが細胞内でフォールディングを助けるタンパク質（GroEL基質）をGroEL非依存に変換するためのスクリーニングを行った結果、点変異でGroEL依存性をスイッチすることができ、さらにはその変異がフォールディングの性質をどのように変化させるかについて特徴を解析することができた。３）ショットガンプロテオミクスを使うことで、細胞内のタンパク質恒常性（プロテオスタシス）をプロテオームレベルで解析できるようになってきた。
【今高】再構成型人工細胞体の中で合成したハンチントン病の原因タンパク質が、生きた細胞内と同様の凝集を呈した。つまり、タンパク質凝集病の一端を試験管内で再現し解析できるシステムを樹立できたと言える。
【富田】今年度は特に、連続プロリン配列による翻訳アレスト機構と翻訳後修飾がなされていないeIF5Aの役割について従来の研究計画以上に明らかにできた。

Strategy for Future Research Activity

【田口】1．新たに見出した負電荷アミノ酸翻訳時のリボソーム不安定化現象の分子機構や生理学的意義をさらに明らかにする。２．新学術領域のサポートを受けて導入した質量分析装置を用いた定量的ショットガンプロテオミクスをさらに推進する。さまざまな研究が推進できる例として、新生鎖、すなわちリボソームにまだ留まっているペプチジルtRNAの大規模解析、タンパク質フォールディングやシャペロンとの相互作用の相関の大規模な調査、翻訳因子やシャペロンの翻訳後修飾の網羅解析とその生理的意義の解明などがある。３．大腸菌で実施した大規模な翻訳一時停止解析を出芽酵母など真核細胞へ拡張する。また、新生鎖に依存したリボソーム不安定化現象についても出芽酵母やヒト細胞にて起こっているのか解析を進める。この真核細胞への拡張では分担者の今高・富田グループと既に共同研究を始めており、新学術領域のプラットフォームのサポートを受けた有意義な共同研究となりつつある。　４．生細胞内での翻訳の可視化技術を用いて、細胞内での翻訳速度調節、翻訳時フォールディングを可視化する。（国際支援班によるサポートを受けた国際共同研究）
【今高】ヒト因子由来完全再構成システムとそれを基盤とした人工細胞を用いて、細胞骨格タンパク質であるアクチンの合成、フォールディング、線維化を行う。それによりアクチン関連遺伝病の解析を行う。また、この再構成システムを領域内メンバーに供与することにより共同研究を続行する。
【富田】シャペロンによる翻訳伸長制御機構の解析や、tRNAの再構成に取り組む予定である。また、また、この再構成システムを領域内メンバーに供与することにより共同研究を推進する。

Research Products

• [Int'l Joint Research] コロラド州立大学/ペンシルバニア大学(米国)
• [Int'l Joint Research] ハイデルベルク大学(ドイツ)
• [Int'l Joint Research] Charite, Universitatsmedizin Berlin/ハイデルベルク大(ドイツ)
• [Int'l Joint Research] コロラド州立大学/ペンシルバニア大(アメリカ合衆国)
• [Int'l Joint Research] NCBS(インド)
• [Int'l Joint Research] ハイデルベルク大学/マックスプランク研究所(ドイツ)
• [Int'l Joint Research] ペンシルベニア大学(アメリカ合衆国)
• [Int'l Joint Research] ヘルシンキ大学(フィンランド)
• [Int'l Joint Research] ハイデルベルク大学/マックスプランク研究所(ドイツ)
• [Int'l Joint Research] ヘルシンキ大学(フィンランド)
• [Int'l Joint Research] ペンシルベニア大学(アメリカ合衆国)
• [Journal Article] Altmetric: 2More detail Article | OPEN Large-scale aggregation analysis of eukaryotic proteins reveals an involvement of intrinsically disordered regions in protein folding (2018)
  • Author(s): Uemura E, Niwa T, Minami S, Takemoto K, Fukuchi S, Machida K, Imataka H, Ueda T, Ota M, Taguchi H.
  • Journal Title: Scientific Reports Volume: 8 Pages: 678-678
  • DOI: 10.1038/s41598-017-18977-5
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Huntingtin polyglutamine-dependent protein aggregation in reconstituted cells. (2018)
  • Author(s): Kodai Machida, Kuru Kanzawa, Tomoaki Shigeta, Yuki Yamamoto, Kanta Tsumoto, and Hiroaki Imataka
  • Journal Title: ACS synthetic Biology Volume: 7 Pages: 377-383
  • DOI: 10.1021/acssynbio.7b00372
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Tight interaction of eEF2 in the presence of Stm1 on ribosome (2018)
  • Author(s): Hayashi, H., Nagai, R., Abe, T., Wada, M., Ito, K. & Takeuchi-Tomita, N.
  • Journal Title: The journal of biochemistry Volume: 163 Pages: 177-185
  • DOI: 10.1093/jb/mvx070
  • NAID: 40021502509
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Intrinsic Ribosome Destabilization Underlies Translation and Provides an Organism with a Strategy of Environmental Sensing. (2017)
  • Author(s): Chadani Yuhei、Niwa Tatsuya、Izumi Takashi、Sugata Nobuyuki、Nagao Asuteka、Suzuki Tsutomu、Chiba Shinobu、Ito Koreaki、Taguchi Hideki
  • Journal Title: Mol Cell. Volume: 68 Pages: 528-539
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2017.10.020
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Heterogeneous interaction network of yeast prions and remodeling factors detected in live cells. (2017)
  • Author(s): Pack CG, Inoue Y, Higurashi T, Kawai-Noma S, Hayashi D, Craig E, Taguchi H.
  • Journal Title: BMB Rep. Volume: 50 Pages: 478-483
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] H ion emissionunder room temperature and non-vacuumatmosphere from a sol-gel-derived nanoporous emitter (2017)
  • Author(s): Daiko Yusuke、Mizutani Satoshi、Machida Kodai、Imataka Hiroaki、Honda Sawao、Iwamoto Yuji
  • Journal Title: J Sol-Gel Sci. Technol. Volume: 83 Pages: 252-258
  • DOI: 10.1007/s10971-017-4430-z
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Integrated in vivo and in vitro nascent chain profiling reveals widespread translational pausing. (2016)
  • Author(s): Chadani Y, Niwa T, Chiba S, Taguchi, H., Ito K.
  • Journal Title: Proc Natl Acad Sci USA Volume: 113
  • DOI: 10.1073/pnas.1520560113
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Cell-free analysis of polyQ-dependent protein aggregation and its inhibition by chaperone proteins (2016)
  • Author(s): Machida K, Shigeta T, Kobayashi A, Masumoto A, Hidaka Y and Imataka H
  • Journal Title: J. Biotechnology Volume: 239 Pages: 1-8
  • DOI: 10.1016/j.jbiotec.2016.09.031
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Expression, purification, and crystallization of Schizosaccharomyces pombe eIF2B (2016)
  • Author(s): Kazuhiro Kashiwagi, Tomoaki Shigeta, Hiroaki Imataka, Takuhiro Ito, Shigeyuki Yokoyama
  • Journal Title: J. Structural and Functional Genomics Volume: 17 Pages: 33-38
  • DOI: 10.1007/s10969-016-9203-3
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Identification of novel in vivo obligate GroEL/ES substrates based on data from a cell-free proteomics approach. (2016)
  • Author(s): Niwa. T, Fujiwara,, K., Taguchi, H.
  • Journal Title: FEBS Lett. Volume: 590 Pages: 251-257
  • DOI: 10.1002/1873-3468.12036
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Supramolecular Nanotube of Chaperonin GroEL : Length Control for Cellular Uptake Using Single-Ring GroEL Mutant as End-Capper (2016)
  • Author(s): Seunghyun Sim, Tatsuya Niwa, Hideki Taguchi, Takuzo Aida
  • Journal Title: J. Am. Chem. Soc. Volume: 138 Pages: 11152-11155
  • DOI: 10.1021/jacs.6b07925
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Identification of novel in vivo obligate GroEL/ES substrates based on data from a cell-free proteomics approach. (2016)
  • Author(s): Niwa T, Fujiwara K, Taguchi H.
  • Journal Title: FEBS Lett. Volume: 590 Pages: 251-7
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Identification of the T-complex protein as a binding partner for newly synthesized Cytoplasmic Dynein Intermediate (2016)
  • Author(s): Ozdemir, A., Machida, K., Imataka, H., Catling, A. D.
  • Journal Title: Biochem. Biophys. Res. Commun. Volume: 469 Pages: 126-131
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2015.11.082
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Reaction Cycle of Chaperonin GroEL via Symmetric "Football" Intermediate. (2015)
  • Author(s): Taguchi H
  • Journal Title: J Mol Biol. Volume: 427 Pages: 2912-8
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2015.04.007
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Tailoring Micrometer-Long High-Integrity 1D Array of Superparamagnetic Nanoparticles in a Nanotubular Protein Jacket and Its Lateral Magnetic Assembling Behavior. (2015)
  • Author(s): Seunghyun Sim, Daigo Miyajima, Tatsuya Niwa, Hideki Taguchi, Takuzo Aida
  • Journal Title: Journal of American Chemical Society Volume: 137 Pages: 4658-4661
  • DOI: 10.1021/jacs.5b02144
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Effects of C-terminal truncation of chaperonin GroEL on the yield of in-cage folding of the green fluorescent protein. (2015)
  • Author(s): S. Ishino, Y. Kawata, H. Taguchi, N. Kajimura, K. Matsuzaki & M. Hoshino
  • Journal Title: J. Biol. Chem. Volume: 290 Pages: 15042-15051
  • DOI: 10.1074/jbc.m114.633636
  • NAID: 120005690196
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Large-scale analysis of macromolecular crowding effects on protein aggregation using a reconstituted cell-free translation system. (2015)
  • Author(s): Niwa T, Sugimoto R, Watanabe L, Nakamura S, Ueda T, Taguchi H
  • Journal Title: Front Microbiol. Volume: 6 Pages: 1113-1113
  • DOI: 10.3389/fmicb.2015.01113
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Comprehensive study of liposome-assisted synthesis of membrane proteins using a reconstituted cell-free translation system. (2015)
  • Author(s): Niwa T, Sasaki Y, Uemura E. Nakamura, S., Akiyama, M., Ando, M., Sawada, S., Mukai, S., Ueda, T., Taguchi, H.* and Akiyoshi, K.
  • Journal Title: Sci. Rep. Volume: 5 Pages: 18025-18025
  • DOI: 10.1038/srep18025
  • NAID: 120005820883
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Production methods of virus particles (2015)
  • Author(s): Kodai Machida, and Hiroaki Imataka
  • Journal Title: Biotechnol. Lett. Volume: 37 Pages: 753-760
  • DOI: 10.1007/s10529-014-1741-9
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Response to the Formal Letter of Z Chrzanowska-Lightowlers and RN Lightowlers regarding our article "Ribosome rescue and translation termination at non-standard stop codons by ICT1 in mammalian mitochondria" (2015)
  • Author(s): Nierhaus, KH. & Takeuchi N.
  • Journal Title: PLOS Genetics Volume: 11(6)
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1005218
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Peptide sequences converting polyglutamine into a prion in yeast. (2015)
  • Author(s): Odani W, Urata K, Okuda M, Okuma S, Koyama H, Pack CG, Fujiwara K, Nojima T, Kinjo M, Kawai-Noma S, Taguchi H
  • Journal Title: FEBS Journal Volume: 282 Pages: 477-490
  • DOI: 10.1111/febs.13152
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Single-molecule Analyses of the Dynamics of Heat Shock Protein 104 (Hsp104) and Protein Aggregates. (2015)
  • Author(s): Okuda M, Niwa T, Taguchi H
  • Journal Title: J Biol Chem Volume: 290 Pages: 7833-7840
  • DOI: 10.1074/jbc.m114.620427
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Oxidation of translation factor EF-G transiently retards the translational elongation cycle in Escherichia coli. (2015)
  • Author(s): Nagano, T., Yutthanasirikul, R., Hihara, Y., Hisabori, T., Kanamori, T., Takeuchi, N., Ueda, T. and Nishiyama, Y.
  • Journal Title: J Biochem. Volume: - Pages: 165-172
  • DOI: 10.1093/jb/mvv026
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Crystal structure of a symmetric football-shaped GroEL:GroES2-ATP14 complex determined at 3.8A reveals rearrangement between two GroEL rings. (2014)
  • Author(s): Koike-Takeshita A, Arakawa T, Taguchi H, Shimamura T.
  • Journal Title: J Mol Biol Volume: 426 Pages: 3634-41
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2014.08.017
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Asp-52 in combination with Asp-398 plays a critical role in ATP hydrolysis of chaperonin GroEL. (2014)
  • Author(s): Koike-Takeshita A, Mitsuoka K, Taguchi H
  • Journal Title: J Biol Chem Volume: 289(43) Pages: 30005-11
  • DOI: 10.1074/jbc.m114.593822
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Conversion of a chaperonin GroEL-independent protein into an obligate substrate. (2014)
  • Author(s): Ishimoto T, Fujiwara K, Niwa T, Taguchi H
  • Journal Title: J Biol Chem Volume: 289 Pages: 32073-80
  • DOI: 10.1074/jbc.m114.610444
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A translation system reconstituted with human factors proves that processing of encephalomyocarditisvirus proteins 2A and 2B occurs in the elongation phase of translation without eukaryotic release factors (2014)
  • Author(s): Kodai Machida, Satoshi Mikami, Mamiko Masutani, Kurumi Mishima, Tominari Kobayashi, and Hiroaki Imataka
  • Journal Title: J. Biol. Chem Volume: 289 Pages: 31960-31971
  • DOI: 10.1074/jbc.m114.593343
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Ribosome rescue and translation termination at non-standard stop codons by ICT1 in mammalian mitochondria. (2014)
  • Author(s): Akabane, S., Ueda, T., Knud H. Nierhaus, KH. & Takeuchi N.
  • Journal Title: PLoS Genet. Volume: 18
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1004616
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Presentation] Intrinsic ribosome destabilization underlies translation and provides an organism with a strategy of environmental sensing (2017)
  • Author(s): Hideki Taguchi
  • Organizer: International Symposium on Protein Quality Control
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 翻訳一時停止の網羅解析より見出された、新生ポリペプチド鎖によるリボソーム開裂現象とその生理学的意義 (2017)
  • Author(s): 茶谷 悠平、丹羽 達也、和泉 貴士、菅田 信幸、長尾 翌手可、鈴木 勉、千葉 志信、伊藤 維昭、田口 英樹
  • Organizer: 第69回日本細胞生物学会大会
• [Presentation] リボソームプロファイリングを用いた新生鎖依存的な翻訳一時停止配列の解析 (2017)
  • Author(s): 藤田 智也、岩崎 信太朗、茶谷 悠平、丹羽 達也、田口 英樹
  • Organizer: 第17回日本蛋白質科学会年会
• [Presentation] 定量プロテオミクスを用いた酵母 Hsp70 シャペロンの役割分担の解明 (2017)
  • Author(s): 山崎 裕太、丹羽 達也、田口 英樹
  • Organizer: 第17回日本蛋白質科学会年会
• [Presentation] 新生ポリペプチド鎖に依存したリボソーム開裂現象の生理的意義の解析 (2017)
  • Author(s): 菅田 信幸、茶谷 悠平、田口 英樹
  • Organizer: 第17回日本蛋白質科学会年会
• [Presentation] 膜タンパク質シャペロン YidC の細胞内基質の探索 (2017)
  • Author(s): 古清水 智夏、茶谷 悠平、丹羽 達也、田口 英樹
  • Organizer: 第17回日本蛋白質科学会年会
• [Presentation] バクテリアにおける uORF 翻訳を介した凝集体蓄積の感知機構の解析 (2017)
  • Author(s): 三輪 つくみ、茶谷 悠平、田口 英樹
  • Organizer: 第19回日本RNA学会年会
• [Presentation] upstream ORFでの翻訳動態を介した多剤排出トランスポーターMdtMの発現制御機構 (2017)
  • Author(s): 古野間 すずな、茶谷 悠平、田口 英樹
  • Organizer: 2017年度生命科学系学会合同年次大会
• [Presentation] 水素-重水素交換質量分析法を用いたシャペロニン基質タンパク質のフォールディング解析 (2017)
  • Author(s): 荒井 睦海、丹羽 達也、田口 英樹
  • Organizer: 2017年度生命科学系学会合同年次大会
• [Presentation] 新生鎖が拡張する蛋白質科学の世界 (2017)
  • Author(s): 田口 英樹
  • Organizer: 2017年度生命科学系学会合同年次大会
• [Presentation] PDIとERp46によるヒト血清アルブミン新生鎖へのジスルフィド結合導入機構の解明 (2017)
  • Author(s): 平山千尋、奥村正樹、町田幸大、今高寛晃、稲葉謙次
  • Organizer: 第17回日本蛋白質科学会年会
• [Presentation] ポリアミンで誘導される+1翻訳フレームシフトの新規分子機構 (2017)
  • Author(s): 小黒明広、重田友明、岩本武夫、今高寛晃、松藤千弥
  • Organizer: 第19回日本RNA学会年会
• [Presentation] 人工細胞を用いた神経変性疾患の解析 (2017)
  • Author(s): 町田幸大、神澤空流、山本悠貴、井寄真仁、岡留壮志、今高寛晃
  • Organizer: 細胞を創る研究会 10.0
• [Presentation] 再構成型ヒト細胞を利用したハンチンチン凝集解析システムの開発 (2017)
  • Author(s): 町田幸大、神澤空流、山本悠貴、井寄真仁、今高寛晃
  • Organizer: 第１2回無細胞生命科学研究会
• [Presentation] ウイルス由来新生鎖を切断する3Cプロテアーゼの機能解析 (2017)
  • Author(s): 山本悠貴、宇野友貴、町田幸大、今高寛晃
  • Organizer: 第１2回無細胞生命科学研究会
• [Presentation] 再構成型細胞様GUVを利用したポリグルタミンタンパク質の凝集と凝集抑制の解析 (2017)
  • Author(s): 町田幸大、神澤空流、井寄真仁、岡留壮志、山本悠貴、今高寛晃
  • Organizer: 第40回日本分子生物学会年会
• [Presentation] ウイルス由来新生鎖を切断する3Cプロテアーゼの機能解析 (2017)
  • Author(s): 山本悠貴、宇野友貴、町田幸大、今高寛晃
  • Organizer: 第40回日本分子生物学会年会
• [Presentation] 再構成型酵母翻訳系の開発とその応用 (2017)
  • Author(s): 富田野乃
  • Organizer: 2017年度生命科学系学会合同年次大会
  • Invited
• [Presentation] 再構成型酵母翻訳系の開発とその応用 (2017)
  • Author(s): 富田野乃
  • Organizer: 第１2回無細胞生命科学研究会
• [Presentation] 人工細胞を利用した神経変性疾患の病態モデル (2017)
  • Author(s): 町田幸大、神澤空流、今高寛晃
  • Organizer: 第２回デザイン生命工学研究会
  • Place of Presentation: 神戸大学統合研究拠点コンベンションホール （神戸市）
  • Year and Date: 2017-03-21
• [Presentation] Bidirectional conversion of chaperonin dependency in the obligate chaperonin substrates (2017)
  • Author(s): Hideki Taguchi
  • Organizer: IPR Seminar/RIKEN Symposium/MEXT Nascent Chain Biology "New Frontiers in Protein Misfolding and Aggregation"
  • Place of Presentation: 大阪大学蛋白質研究所（吹田市）
  • Year and Date: 2017-01-26
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] プロリン連続配列による翻訳伸長の減速が細胞内フォールディングに与える影響 (2016)
  • Author(s): 丹羽 達也
  • Organizer: 第16回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場(福岡市)
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] セルフリータンパク質合成システムを利用したpolyQ凝集の解析と分子シャペロンによる凝集抑制 (2016)
  • Author(s): 町田幸大, 重田友明,小林綾乃,桝本愛,日高優奈,今高寛晃
  • Organizer: 第３９回 日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（横浜市）
  • Year and Date: 2016-11-30
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] ポリA鎖結合タンパク質を介した翻訳制御の試験管内再構成 (2016)
  • Author(s): 重田友明, 町田幸大, 神澤空流, 星野睦人, 今高寛晃
  • Organizer: 第３９回 日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（横浜市）
  • Year and Date: 2016-11-30
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Conversion of a chaperonin GroEL-independent protein into an obligate substrate, and vice versa (2016)
  • Author(s): Hideki Taguchi
  • Organizer: The Third International Symposium on Protein Folding and Dynamics
  • Place of Presentation: National Centre for Biological Sciences(NCBS)（Bangalore, India）
  • Year and Date: 2016-11-08
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] プロリン連続配列による翻訳伸長の減速がタンパク質フォールディングに与える影響 (2016)
  • Author(s): 丹羽 達也
  • Organizer: 第11回無細胞生命科学研究会
  • Place of Presentation: 雫石南網張ありね温泉ゆこたんの森（岩手県）
  • Year and Date: 2016-10-07
• [Presentation] 網羅解析より見出された翻訳アレストの普遍性とその生理学的意義 (2016)
  • Author(s): 茶谷 悠平
  • Organizer: 第11回無細胞生命科学研究会
  • Place of Presentation: 雫石南網張ありね温泉ゆこたんの森（岩手県）
  • Year and Date: 2016-10-07
• [Presentation] セルフリータンパク質合成システムを利用したpolyQ凝集の解析とヒト分子シャペロンによる凝集抑制 (2016)
  • Author(s): 町田幸大, 重田友明,小林綾乃,桝本愛,日高優奈,今高寛晃
  • Organizer: 第１１回無細胞生命科学研究会
  • Place of Presentation: ゆこたんの森 （岩手県雫石町）
  • Year and Date: 2016-10-06
• [Presentation] ヒト翻訳系の試験管内再構成で浮かび上がったPABPの新たな役割 (2016)
  • Author(s): 重田友明, 町田幸大, 神澤空流, 星野睦人, 今高寛晃
  • Organizer: 第１１回無細胞生命科学研究会
  • Place of Presentation: ゆこたんの森 （岩手県雫石町）
  • Year and Date: 2016-10-06
• [Presentation] ヒト因子由来再構成型タンパク質合成系の開発と応用 (2016)
  • Author(s): 町田幸大、重田友明、今高寛晃
  • Organizer: 第６８回 日本生物工学会大会
  • Place of Presentation: ANAクラウンプラザホテル富山（富山県富山市）
  • Year and Date: 2016-09-28
• [Presentation] 翻訳一時停止の大規模解析を基盤とした新生鎖フォールディング解析 (2016)
  • Author(s): 田口 英樹
  • Organizer: 第89回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 仙台国際センター、東北大学川内北キャンパス （仙台市）
  • Year and Date: 2016-09-25
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] 酵母由来再構成型翻訳システムの開発とその応用 (2016)
  • Author(s): 富田（竹内）野乃
  • Organizer: 第89回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 仙台国際センター、東北大学川内北キャンパス （仙台市）
  • Year and Date: 2016-09-25
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] ヒト因子由来再構成型翻訳システムの開発とその応用 (2016)
  • Author(s): 町田幸大、重田友明、今高寛晃
  • Organizer: 第８９回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 東北大学川内北キャンパス（仙台市）
  • Year and Date: 2016-09-25
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 分子シャペロン研究から「新生鎖の生物学」へ (2016)
  • Author(s): 田口 英樹
  • Organizer: 第4回 Ribosome Meeting
  • Place of Presentation: 大阪医科大学（高槻市）
  • Year and Date: 2016-09-17
  • Invited
• [Presentation] Global analysis of yeast protein aggregations using a reconstituted cell-free translation system. (2016)
  • Author(s): 田口 英樹
  • Organizer: 第14回 酵母国際会議（The 14th International Congress on Yeasts; ICY14）
  • Place of Presentation: 淡路夢舞台国際会議場（淡路市）
  • Year and Date: 2016-09-11
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Reconstitution of eIF4E/eIF4G/PABP-dependent translation with purified human factors (2016)
  • Author(s): Shigeta T, Kanzawa K, Machida K and Imataka H
  • Organizer: Translational Control CSH meeting
  • Place of Presentation: Cold Spring Harbor Laboratory (NY, USA)
  • Year and Date: 2016-09-06
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Mechanism of nascent-chain quality control using a reconstituted cell-free translation system of Escherichia coli (2016)
  • Author(s): Hideki Taguchi
  • Organizer: 新生鎖の生物学 国際シンポジウム Nascent Chain Biology
  • Place of Presentation: 富士レークホテル（河口湖）
  • Year and Date: 2016-09-01
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Global analysis of yeast protein aggregation using a reconstituted cell-free translation system (2016)
  • Author(s): Niwa Tatsuya
  • Organizer: 新生鎖の生物学 国際シンポジウム Nascent Chain Biology
  • Place of Presentation: 富士レークホテル（河口湖）
  • Year and Date: 2016-09-01
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Integrated in vivo and in vitro nascent chain profiling reveals widespread translational pausing (2016)
  • Author(s): Yuhei Chadani
  • Organizer: 新生鎖の生物学 国際シンポジウム Nascent Chain Biology
  • Place of Presentation: 富士レークホテル（河口湖）
  • Year and Date: 2016-09-01
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Elongation phase of translation in yeast (2016)
  • Author(s): Nono Takeuchi-Tomita
  • Organizer: 新生鎖の生物学 国際シンポジウム Nascent Chain Biology
  • Place of Presentation: 富士レークホテル（河口湖）
  • Year and Date: 2016-09-01
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Reconstitution of translation from yeast (2016)
  • Author(s): Taisho Abe
  • Organizer: 新生鎖の生物学 国際シンポジウム Nascent Chain Biology
  • Place of Presentation: 富士レークホテル（河口湖）
  • Year and Date: 2016-09-01
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Stm1 stalls 80S ribosomes by trapping eEF2 independent of its diphthamide modification. (2016)
  • Author(s): Riku Nagai
  • Organizer: 新生鎖の生物学 国際シンポジウム Nascent Chain Biology
  • Place of Presentation: 富士レークホテル（河口湖）
  • Year and Date: 2016-09-01
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] A Translation System Reconstituted with Purified Human Factors for the Study of Nascent Chains (2016)
  • Author(s): Imataka H, Machida K and Shigeta T
  • Organizer: 新生鎖の生物学 国際シンポジウム Nascent Chain Biology
  • Place of Presentation: 富士レークホテル (山梨県南都留郡)
  • Year and Date: 2016-09-01
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Stimulation of translation by PABP unraveled by a reconstitution system (2016)
  • Author(s): Shigeta T, Machida K, Kanzawa K, Hoshino M and Imataka H
  • Organizer: 新生鎖の生物学 国際シンポジウム Nascent Chain Biology
  • Place of Presentation: 富士レークホテル (山梨県南都留郡)
  • Year and Date: 2016-09-01
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Cell-free analysis of polyglutamine-dependent protein aggregation and its inhibition by molecular chaperones (2016)
  • Author(s): Machida K, Shigeta T, Kobayashi A, Masumoto A, Hidaka Y and Imataka H
  • Organizer: 新生鎖の生物学 国際シンポジウム Nascent Chain Biology
  • Place of Presentation: 富士レークホテル (山梨県南都留郡)
  • Year and Date: 2016-09-01
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Integrated in vivo and in vitro Nascent Chain Profiling Reveals Widespread Translational Pausing (2016)
  • Author(s): Yuhei Chadani
  • Organizer: EMBO Conference Ribosome Structure and Function 2016
  • Place of Presentation: Strasbourg Convention Centre (Strasbourg, France)
  • Year and Date: 2016-07-06
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] A 5’ and 3’ends-dependent translation system reconstituted with human factors (2016)
  • Author(s): Shigeta T, Machida K and Imataka H
  • Organizer: The 21st annual meeting of the RNA society
  • Place of Presentation: 京都国際会館 （京都市）
  • Year and Date: 2016-06-28
• [Presentation] Integrated in vivo and in vitro nascent chain profiling reveals widespread translational pausing (2016)
  • Author(s): 田口 英樹
  • Organizer: RNA2016 satellite-symposium
  • Place of Presentation: 京都大学 稲盛ホール（京都市）
  • Year and Date: 2016-06-27
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] 新生鎖の運命を司るシャペロンとプロテアーゼの分子機構解析 (2016)
  • Author(s): 田口 英樹
  • Organizer: 第16回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場(福岡市)
  • Year and Date: 2016-06-07
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Integrated in vivo and in vitro nascent chain profiling reveals widespread translational pausing (2016)
  • Author(s): Hideki Taguchi
  • Organizer: Cold Spring Harbor Laboratory Meeting "Protein Homeostasis in Health & Disease"
  • Place of Presentation: Cold Spring Harbor Laboratory（New York, USA）
  • Year and Date: 2016-04-18
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] 試験管内ウイルス合成 (2016)
  • Author(s): 町田 幸大
  • Organizer: 日本農芸化学会２０１６年大会シンポジウム
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター （札幌市）
  • Year and Date: 2016-03-28
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] ヒト因子由来完全再構成型無細胞翻訳系の樹立 (2016)
  • Author(s): 重田 友明
  • Organizer: 日本農芸化学会２０１６年大会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター （札幌市）
  • Year and Date: 2016-03-28
• [Presentation] Global analysis of yeast protein aggregation using a reconstituted cell-free translation system (2015)
  • Author(s): Hideki Taguchi
  • Organizer: BMB2015（第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学会大会 合同大会）
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド（神戸市）
  • Year and Date: 2015-12-01
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] 翻訳開始因子に依存したヒト由来再構成型翻訳系 (2015)
  • Author(s): 重田 友明
  • Organizer: 第３８回 日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド （神戸市）
  • Year and Date: 2015-12-01
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 町田 幸大ヒト因子由来再構成型タンパク質合成/フォールディング共役システムによる人工細胞の創出 (2015)
  • Author(s): 町田 幸大
  • Organizer: 第３８回 日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド （神戸市）
  • Year and Date: 2015-12-01
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 翻訳開始に依存したヒト因子由来再構成型翻訳系の樹立 (2015)
  • Author(s): 重田 友明
  • Organizer: 細胞を創る研究会８．０
  • Place of Presentation: 大阪大学吹田キャンパス銀杏会館 （吹田市）
  • Year and Date: 2015-11-12
• [Presentation] ヒトの人工細胞構築に向けたヒト因子由来再構成型翻訳/フォールディング共役系の樹立 (2015)
  • Author(s): 町田 幸大
  • Organizer: 細胞を創る研究会８．０
  • Place of Presentation: 大阪大学吹田キャンパス銀杏会館 （吹田市）
  • Year and Date: 2015-11-12
• [Presentation] ヒト因子由来再構成型翻訳系の樹立 (2015)
  • Author(s): 重田 友明
  • Organizer: 第６７回日本生物工学会大会
  • Place of Presentation: 城山観光ホテル（鹿児島市）
  • Year and Date: 2015-10-26
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 人工ヒト細胞の創出に向けて (2015)
  • Author(s): 町田 幸大
  • Organizer: 第６７回日本生物工学会大会
  • Place of Presentation: 城山観光ホテル（鹿児島市）
  • Year and Date: 2015-10-26
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 翻訳開始因子を含むヒト因子由来完全再構成型翻訳系の樹立 (2015)
  • Author(s): 重田 友明
  • Organizer: 第１０回無細胞生命科学研究会
  • Place of Presentation: 理化学研究所 （横浜市）
  • Year and Date: 2015-10-13
• [Presentation] ヒトの再構成型タンパク質合成/フォールディング共役系を内在したヒト人工細胞の創出 (2015)
  • Author(s): 町田 幸大
  • Organizer: 第１０回無細胞生命科学研究会
  • Place of Presentation: 理化学研究所 （横浜市）
  • Year and Date: 2015-10-13
• [Presentation] Unique translation termination in Mammalian Mitochondria (2015)
  • Author(s): Nono Takeuchi
  • Organizer: "Molecular Mitochondria ‐ Joint Seminar of Young Finnish‐Japanese Mitoscientists"
  • Place of Presentation: Helsinki Congress Paasitorni (Helsinki, Finland)
  • Year and Date: 2015-10-05
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] 翻訳開始を含むヒト因子由来再構成型翻訳システムの樹立：RNAウイルス合成に向けて (2015)
  • Author(s): 重田 友明
  • Organizer: 第17回日本ＲＮＡ学会年会
  • Place of Presentation: ホテルライフォート札幌（札幌市）
  • Year and Date: 2015-07-15
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 再構成型翻訳・フォールデイングシステムの樹立：人工ヒト細胞構築に向けて (2015)
  • Author(s): 町田 幸大
  • Organizer: 第17回日本ＲＮＡ学会年会
  • Place of Presentation: ホテルライフォート札幌（札幌市）
  • Year and Date: 2015-07-15
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 新生鎖フォールディングの運命とシャペロンの分子機構 (2015)
  • Author(s): 田口 英樹
  • Organizer: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: あわぎんホール（徳島市）
  • Year and Date: 2015-06-24
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Hideki TaguchiA global analysis of proteome stability (2015)
  • Author(s): Hideki Taguchi
  • Organizer: EMBO Conference "Molecular chaperones: From molecules to cells and misfolding diseases"
  • Place of Presentation: Aldemar Resort Knossos Royal, Family Resort (Heraklion, Greece)
  • Year and Date: 2015-05-08
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] A New Experimental Tool: Translation System Reconstituted with Purified Human Factors (2015)
  • Author(s): Hiroaki Imataka
  • Organizer: Protein & Peptide Conference 2015
  • Place of Presentation: Nanjing International Youth Conference Hotel (Nanjing, China)
  • Year and Date: 2015-04-15
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] 蛋白質フォールディングの「理想」と「現実」 (2015)
  • Author(s): 田口 英樹
  • Organizer: 2014年度 遺伝研研究会「単細胞の増殖メカニズムの先端的研究」
  • Place of Presentation: 国立遺伝学研究所（三島市）
  • Year and Date: 2015-03-23
  • Invited
• [Presentation] Ideal and reality in the protein world: aggregation and chaperones (2015)
  • Author(s): Hideki Taguchi
  • Organizer: Progress 100: Kyushu-U and Stanford-U Joint Research and Education Program, First Symposium: From Genes to Human Diseases
  • Place of Presentation: Centennial Hall Kyushu University School of Medicine (Fukuoka)
  • Year and Date: 2015-03-16
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Ideal and reality in the protein world: aggregation and chaperones (2014)
  • Author(s): Hideki Taguchi
  • Organizer: JSPS Japan Hungary Joint Seminar, Mechanism and regulation og aberrant protein aggregation
  • Place of Presentation: Institute fot Protein Research, Osaka University
  • Year and Date: 2014-11-18
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Anfinsenフォールディングから新生鎖フォールディングへ (2014)
  • Author(s): 田口 英樹
  • Organizer: 第87回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 国立京都国際会館（京都）
  • Year and Date: 2014-10-15
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] 真核細胞のコトランスレーショナル、ポストトランスレーショナルなイベンの解析： 再構成型タンパク質合成システムを用いて (2014)
  • Author(s): 今高 寛晃 町田幸大
  • Organizer: 第87回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 京都国際会議場 （京都市）
  • Year and Date: 2014-10-15
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Ideal and reality in the protein world: aggregation and chaperones (2014)
  • Author(s): Hideki Taguchi
  • Organizer: Uppsala University - Tokyo Tech Joint Symposium 'Breakthroughs in Science & Technoligy for the 21st century' in cooperation with JSPS-Stockholm
  • Place of Presentation: Uppsala University Angstrom Laboratory
  • Year and Date: 2014-09-16
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] 試験管内ウイルス合成 (2014)
  • Author(s): 今高 寛晃
  • Organizer: 第66回生物工学会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター（札幌市）
  • Year and Date: 2014-09-09
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] 真核細胞のタンパク質合成 (2014)
  • Author(s): 今高 寛晃
  • Organizer: 第13回ポリアミンと核酸の共進化シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京慈恵会医科大学（東京）
  • Year and Date: 2014-06-28
  • Invited
• [Book] ヒト完全再構成型タンパク質合成システム in 人工細胞の創生とその応用 監修：植田充美 (2017)
  • Author(s): 兵庫県立大学 重田友明、町田幸大、今高寛晃
  • Total Pages: 7
  • Publisher: シーエムシー出版
• [Book] ヒト完全再構成型タンパク質合成システム in 人工細胞の創生とその応用 監修：植田充美 (2017)
  • Author(s): 重田友明、町田幸大、今高寛晃
  • Total Pages: 7
  • Publisher: シーエムシー出版
• [Book] "Human cell extract-derived cell-free systems for virus synthesis. In: Alexandrov,K. and Johnston,W.A. (Eds.), Methods in Molecular Biology 1118, Cell-free protein synthesis: Methods and Protocols. " (2014)
  • Author(s): Kobayashi T, Machida K, and Imataka H
  • Publisher: Humana Press