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遺伝子の分析によるヒトおよび動物ロタウイルスの生態と進化に関する研究

Research Project

Project/Area Number 03454190
Research Category

Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Virology
Research InstitutionSapporo Medical University

Principal Investigator

浦沢 正三  札幌医科大学, 医学部, 教授 (00045379)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 後藤 仁  帯広畜産大学, 畜産学部, 教授 (20003072)
千葉 峻三  札幌医科大学, 医学部, 教授 (50045374)
谷口 孝喜  札幌医科大学, 医学部, 助教授 (40094213)
Project Period (FY) 1993
Project Status Completed (Fiscal Year 1993)
Budget Amount *help
¥6,200,000 (Direct Cost: ¥6,200,000)
Fiscal Year 1993: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 1992: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
Fiscal Year 1991: ¥3,800,000 (Direct Cost: ¥3,800,000)
Keywordsヒトロタウイルス / 動物ロタウイルス / VP4遺伝子 / RNA-RNAハイブリダイゼーション / リアソータント / 系統樹 / ロタウイルス / ロタウイスル遺伝子 / ウイルス進化 / RNA塩基配列決定 / RNAーRNAハイブリダイゼ-ション / ロタウイルス遺伝子 / RNA塩基配列
Research Abstract

1.5株のウマロタウイルス(FI-14、FI-23、H2、H1、L338)を用いて、それらの株間での関連、および他の動物ロタウイルスとの関連をRNA-RNAハイブリダイゼーションで検討した。FI-14、FI-23およびH2は互いに遺伝的関連性が高いが、L338は他のウマロタウイルスとの遺伝的関連性は低いことが判明した。これら4株はいずれもヒトおよび他の動物ロタウイルスとの関連性は示されなかったが、H1株のみ、ブタロタウイルス(OSU、Gottfried、YM)と高い遺伝的関連性を示した。
2.タイ国の下痢症患者から分離したMc345およびMc323株が、ヒトロタウイルスよりもブタロタウイルスに近い遺伝子構成を有していることが示された。これらの株のVP7およびVP4遺伝子の塩基配列を決定した結果、VP7の血清型はともにヒトロタウイルスに特有のG9であったが、VP4は、他のロタウイルス株のVP4のアミノ酸配列と65.6〜82.3%と低い相同率を示し、そのなかでは、無症候性株のVP4にやや類似していた。
3.北海道の軽種馬育成牧場で分離したウマロタウイルスCH3株のVP7およびVP4遺伝子の塩基配列を決定した結果、CH3のVP7血清型はG13、VP4はH2、FI-14株と類似していることが判明した。
4.すでに決定済みのヒトロタウイルスMc35株(G10)、ウシロタウイルス3株、ウマロタウイルス5株、イヌロタウイルス2株、ネコロタウイルス2株に加え、上述の新たな株のVP4のアミノ酸配列をもとに、系統樹を作成した。
こうして、ヒトおよび各種動物ロタウイルスのVP4遺伝子を中心として遺伝的関連を明らかにすることができた。

Report

(3 results)
  • 1993 Annual Research Report
  • 1992 Annual Research Report
  • 1991 Annual Research Report
  • Research Products

    (17 results)

All Other

All Publications (17 results)

  • [Publications] Yaowapa Pongsuwanna: "Distinct yearly change of serotype dustribution of human rotavirus in Thailand as determined by ELISA and PCR." Epidemiology and Infection. 111. 407-412 (1993)

    • Related Report
      1993 Annual Research Report
  • [Publications] Michihiro Takagi: "A minor prevalent strain in a severe outbreak of foal diarrhea associated with serotype 3 rotavirus." Journal of Veterinary Medicine and Science. 55. 661-663 (1993)

    • Related Report
      1993 Annual Research Report
  • [Publications] Tomoko Urasawa: "Nucleotide sequence of VP4 and VP7 genes of a unique human rotavirus strain Mc35 with subgroup I and serotype 10 specificity." Virology. 195. 766-771 (1993)

    • Related Report
      1993 Annual Research Report
  • [Publications] Huixia Wu: "Genomic relatedness of five equine rotavirus strains with different G serotype and P type specificities." Research in Virology. 144. 455-464 (1993)

    • Related Report
      1993 Annual Research Report
  • [Publications] Huixia Wu: "Survey on the istribution of the gene 4 alleles of human rotaviruses by polymerase chain reaction." Epidemiology and Infection. (in press). (1994)

    • Related Report
      1993 Annual Research Report
  • [Publications] Koki Taniguchi: "Species specificity and interspecies relatedness in VP4 genotypes demonstrated by VP4 sequence analysis of equine,feline,and canine rotavirus strains." Virology. (in press). (1994)

    • Related Report
      1993 Annual Research Report
  • [Publications] Koki Taniguchi: "Identification of human and bovine rotavirus serotypes by polymerase chain reaction" Epideniology and Infection. 109. 303-312 (1992)

    • Related Report
      1992 Annual Research Report
  • [Publications] Shozo Urasawa: "Antigenic and genetic analyses of human rotaviruses in Chiang Mai,Thailand" Journal of Infectious Diseases. 166. 227-234 (1992)

    • Related Report
      1992 Annual Research Report
  • [Publications] Koki Taniguchi: "Independent segregation of the VP4 and the VP7 genes in bovine rotaviruses as confirmed by VP4 sequence analysis of G8 and G10 bovine rotavirus strains" Journal of General Virology.

    • Related Report
      1992 Annual Research Report
  • [Publications] Tomoko Urasawa: "Nucleotide sequence of VP4 and VP7 genes of a unique human rotavirus strain Mc35 with subgroup I and serotype 10 specificity" Virology.

    • Related Report
      1992 Annual Research Report
  • [Publications] 浦沢 正三: "ロタウイルスの血清型" ウイルス. 42. 145-153 (1992)

    • Related Report
      1992 Annual Research Report
  • [Publications] Muzahed U.Ahmed et al.: "Analysis of Human Rotavirus Strains Prevailing in Bangladesh in Relation to Nationwide Floods Brought by the 1988 Monsoon." Journal of Clinical Microbiology. 29. 2273-2279 (1991)

    • Related Report
      1991 Annual Research Report
  • [Publications] Koki Taniguchi et al.: "Molecular and Antigenic Analyses of Serotypes 8 and 10 of Bovine Rotaviruses in Thailand." Journal of General Virology. 72. 2929-2937 (1991)

    • Related Report
      1991 Annual Research Report
  • [Publications] Shozo Urasawa et al.: "Antigenic and Genetic Analysis of Human Rotaviruses Prevailing in Chiang Mai,ThailandーSome Evidence for a Close Relationship between Human and Animal Rotaviruses." Journal of Infectious Diseases.

    • Related Report
      1991 Annual Research Report
  • [Publications] Chikako Ohta et al.: "Mixed Infections of Distinct Serotype 6 Rotaviruses among Beef Calves in Hokkaido,Japan." Journal of Clinical Microbiology.

    • Related Report
      1991 Annual Research Report
  • [Publications] 浦沢 正三ほか: "RNAーPAGEパタ-ンによるロタウイルスの疫学的研究." 日本臨床 1992年特別号. (1991)

    • Related Report
      1991 Annual Research Report
  • [Publications] Koki Taniguchi et al.: "Serotyping of human and bovine rotavituses by polymerase shain reaction" Epidemiology and Infection.

    • Related Report
      1991 Annual Research Report

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Published: 1991-04-01   Modified: 2016-04-21  

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