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DNAの高次構造を識別する蛋白質(まとめ)

Research Project

Project/Area Number 04254103
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

京極 好正  大阪大学, 蛋白質研究所, 教授 (90012632)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 相本 三郎  大阪大学, 蛋白質研究所, 教授 (80029967)
嶋本 伸雄  国立遺伝学研究所, 助教授 (20127658)
箱嶋 敏雄  大阪大学, 薬学部, 助教授 (00164773)
西村 善文  横浜市立大学, 総合理学研究科, 教授 (70107390)
饗場 弘二  名古屋大学, 理学部, 教授 (20025662)
Project Period (FY) 1993
Project Status Completed (Fiscal Year 1993)
Budget Amount *help
¥22,800,000 (Direct Cost: ¥22,800,000)
Fiscal Year 1993: ¥3,000,000 (Direct Cost: ¥3,000,000)
Fiscal Year 1992: ¥19,800,000 (Direct Cost: ¥19,800,000)
KeywordsDNA / 高次構造 / 制御蛋白質 / 蛋白質-核酸相互作用 / RNAポリメラーゼ / 構造生物学 / X線回折 / 核磁気共鳴 / 重点領域研究 / DNA結合蛋白質 / 生物物理学 / 分子生物学 / NMR装置 / 構造解析
Research Abstract

本重点領域研究は蛋白質や核酸の立体構造にもとづいた蛋白質-核酸相互作用の機構解明を目指して、(1)制御蛋白質と制御配列との相互作用機構を分子、原子レベルで解明すること、(2)両者の相互作用の様式と相互作用の結果、誘起されるDNA、蛋白質双方の高次構造変化、物性変化の実体を明らかにすること、(3)両者の相互作用及びRNAポリメラーゼとの相互作用が制御蛋白質の機能といかに関係しているか、を解明することを主要な目標とし、構造生物物理学に属する研究者と分子遺伝学、分子生物学の研究者からなる研究組織を作り、積極的に共同研究をすすめることを行った。その結果20余の共同研究が発足し、その中で立体構造が明らかになったのが5つの系で、X線回折によるものがT4エンドヌクレアーゼV、核磁気共鳴によるものがc-Myb、POU-ホメオドメイン、GAL4のDNA結合ドメインである。結晶化されたものは10種以上ある。また、大腸菌のRNAポリメラーゼに作用する活性化、抑制因子の相互作用するサイトがαサブユニットのC末端側と同定された。これは本重点領域研究構成者の共同研究の成果である。認識されるDNAの側にも塩基配列に特異的な構造があること、蛋白質の結合によって曲がるものがあることなどが明らかとなった。
以上のような平成2〜4年度の成果をまとめた報告書を作製するとともに、反省と今後の展開を考えて「構造生物学の現在と将来」と題する研修会を湯河原で開き、今後のこの分野の発展を期した。

Report

(2 results)
  • 1993 Annual Research Report
  • 1992 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All Other

All Publications (13 results)

  • [Publications] K.Uegaki: "Characterization of the DNA binding domain of the mouse IRF-2" Protein Engineering. 6. 195-200 (1993)

    • Related Report
      1993 Annual Research Report
  • [Publications] M.Shirakawa: "Assignment of ^1H,^<15>N,and ^<13>C resonances,identicication of elements of secondary stuucture and determination of the global fold of the DNA-binding domain of GAL4" Biochemistry. 32. 2144-2153 (1993)

    • Related Report
      1993 Annual Research Report
  • [Publications] E.H.Morita: "Secondary structure of the oct-3 homeodomain as determined ^1H-^<15>N NMR spectroscopy" FEBS Letters. 321. 107-110 (1993)

    • Related Report
      1993 Annual Research Report
  • [Publications] C.Kojima: "HAL experiment,a novel filtering method,and its application to DNA assignment" J.Magn.Reson.Series B. 102. 214-217 (1993)

    • Related Report
      1993 Annual Research Report
  • [Publications] M.Amano: "Nuclear magnetic resonance study of the codon-anticodon interaction in Bombyx mori tRNA" Eur.J.Biochem.217. 131-136 (1993)

    • Related Report
      1993 Annual Research Report
  • [Publications] H.Odawara: "Dynamic properties of nucleic acids in biosupuramolecular systems,as studied by ^<31>P-NMR" J.Biochem.115. 270-278 (1994)

    • Related Report
      1993 Annual Research Report
  • [Publications] Yasuharu Serikawa: "Determination of the DNA binding site of the GAL4 protein-A photo CINDNP study" Febs Letters. 299. 205-208 (1992)

    • Related Report
      1992 Annual Research Report
  • [Publications] Kazyo Yamamoto: "Characterization of the bacterially expressed Drosophila engrailed honeodomain" J.Biochem.111. 793-797 (1992)

    • Related Report
      1992 Annual Research Report
  • [Publications] Takashi Toda: "Fission yeast pap1-dependent transcription is negatively regulated by an essential nuclear protein,crm1" Mol.Cell.Biol.12. 5474-5484 (1992)

    • Related Report
      1992 Annual Research Report
  • [Publications] Masahiro Shirakawa: "Assignment of ^1H,^<15>N and ^<13>C resonances,identificatior of elements of secondary structure and determination of the global fold of the DNA binding domain of GAL4" Biochemistry. (1993)

    • Related Report
      1992 Annual Research Report
  • [Publications] Koichi Uegaki: "Characterization of the DNA binding domain of the mouse IRF-2 protein" Protein Engineering. (1993)

    • Related Report
      1992 Annual Research Report
  • [Publications] Eugene H.Morita: "Secondary structure of the oct-3 POU-homeodomain as determined by ^1H-^<15>N NMR spectroscopy" FEBS Letters. (1993)

    • Related Report
      1992 Annual Research Report
  • [Publications] Yoshimasa Kyogoku: "Molecular Structure and LifeーMolecular Recognition of Nucleic Acids" Japan Scientific Societies Press CRC Press, 281 (1992)

    • Related Report
      1992 Annual Research Report

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Published: 1992-04-01   Modified: 2016-04-21  

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