単純ヘルペスウイルスの分子進化学的ならびに分子疫学的研究
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04670266
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| Research Category |
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Field |
Virology
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| Research Institution | Hokkaido University |
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Principal Investigator |
坂岡 博 北海道大学, 歯学部, 助教授 (40000947)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
関根 潔 北海道大学, 歯学部, 助手 (70113579)
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| Project Period (FY) |
1992
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 1992)
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| Budget Amount *help |
¥1,600,000 (Direct Cost: ¥1,600,000)
Fiscal Year 1992: ¥1,600,000 (Direct Cost: ¥1,600,000)
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| Keywords | 単純ヘルペスウイルス / 分子進化学 / 分子疫学 / 多様性 / ゲノム |
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| Research Abstract |
日本、韓国、中国、スウェーデン、米国、およびケニアで分離した各48、50、28、50、34、および32株、計242株の疫学的に関係のない単純ヘルペスウイルス1型(HSV-1)DNAを6種の制限酵素BamHI、KpnI、SalI、HindIII、XhoI、およびPvuIIで切断し、それらの切断パターンを調べた。6制限酵素によるHSV-1切断サイトは225であるが、そのうち株間で存否に差のある63サイトを選び、サイト存在の場合を0、欠如の場合を1として、全株を63桁の数字で表現し、コンピュータに入力してHSV-1ゲノムを定量的に調べた。その結果以下の成績が得られた。
(1)、63サイトのうち、39サイトで6ヶ国のうち、いずれかの2ケ国間で切断サイトに統計学的有意差(p<0、01)がみられた。
(2)、特に、韓国とケニア間で63サイト中最大の25差異がみられ、両国のHSV-1が進化遺伝学的に最も離れているものと思われた。一方、モンゴロイド(日本、韓国、中国)から得られたHSV-1間では6サイト以下、コーカソイド(スウェーデン、米国)からのHSV-1株間では3サイトしか有意差がなく、同一人種HSV-1は進化学的に近縁を思われた。
(3)、242の株は186のゲノタイプに分類された。しかし、日本、韓国、中国からの株は互に同じゲノタイプに分類されることがあった。このことは3ケ国のHSV-1に極めて類似する株の存在することを示す。
(4)、6ケ国HSV-1の63サイトについて、サイト間(63x62/2)の相関係数(r)をピアソン法で求めた。日本、韓国、中国由来のHSV-1間、スウェーデン、米国のHSV-1間で同一ペアサイトで高い相関がみられた。このことも同一人種内HSV-1ゲノムは進化学的に類似していることを示す。
(5)、6ケ国HSV-1株186ゲノタイプの分子系統樹を近糠結合法(NJ法)で構築した。
以上の分子進化学的研究はHSV-1の分子疫学的研究に貢献すると思う。
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Report
(1 results)
Research Products
(6 results)
