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大腸菌アルキル化DNA修復酵素の三次元構造と機能

Research Project

Project/Area Number 05270209
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

山縣 ゆり子  大阪大学, 薬学部, 助手 (40183678)

Project Period (FY) 1993
Project Status Completed (Fiscal Year 1993)
Budget Amount *help
¥2,000,000 (Direct Cost: ¥2,000,000)
Fiscal Year 1993: ¥2,000,000 (Direct Cost: ¥2,000,000)
KeywordsDNA修復酵素 / 3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼ / Ada蛋白 / X線結晶構造解析
Research Abstract

大腸菌には、強力な突然変異、致死作用を有するアルキル化剤によるDNAの損傷に特異的に働くDNA修復酵素が3種(3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼIとII、およびAda蛋白)存在する。本研究の最終目的は、X線結晶構造解析法でこれら蛋白質の3次元構造を決定し、それぞれのアルキル化DNA塩基の認識機構、酵素反応機構を原子レベルで解明することであり、本年度はそれぞれの蛋白質について、以下の研究成果を得た。
〈3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼII〉
X線構造解析に適した結晶を得、2.0A分解能のX線回折強度データを精度良く測定した。立体構造既知の関連蛋白質がない場合、重原子同型置換法で構造解析を進めるため、重原子同型結晶の探索を行なったところ、水銀、白金、金、イリジュウム化合物が、構造解析に有効であることが判明した。それぞれの誘導体結晶のX線回折データを測定し、多重同型置換法を用いて解析、2.8A分解能の電子密度図作成に成功した。電子密度図から、本蛋白質は5本のβ鎖からなるβ-シートと約10本のα-ヘリックスで構成される新しいα+β構造をとっていることが明らかとなった。
〈3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼI、Ada蛋白〉
両蛋白質を大腸菌中で大量産生させ、純度良く精製し、X線解析に適した結晶を作成するため結晶化条件を種々検討し、両者共に結晶を得たが、X線回折実験を行なうにはまだ小さい。

Report

(1 results)
  • 1993 Annual Research Report
  • Research Products

    (5 results)

All Other

All Publications (5 results)

  • [Publications] M.Otsuti et al.: "Structure of p-Isopropylcalix(4)arene-Toluene(1:1)Complex" Acta Crystallographica. C49. 639-641 (1993)

    • Related Report
      1993 Annual Research Report
  • [Publications] M.Yamaki et al.: "Blespirol,A Phenanthrene with a Spirolactone Ring from Bletilla Striata" Phytochemistry. 33. 1497-1498 (1993)

    • Related Report
      1993 Annual Research Report
  • [Publications] Y.Yamagata et al.: "Conformation of 3-Substituted Purine Nucleoside Studied by X-ray Crystallography and Theoretical Calculations" Nucleosides & Nucleotides. (in press). (1994)

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      1993 Annual Research Report
  • [Publications] S.Fujii et al.: "Novel Molecular Conformation of(R,S)-Hesperetin" Chem.Pharm.Bull.(in press). (1994)

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      1993 Annual Research Report
  • [Publications] I.Terashima et al.: "Demethylation of O^6-Methlguanine in DNA by O^6-Methylguanine-DNA Methyltransferase:Synthesis and Chracterization of O^6,9-Dimethylguanine that is Coordinated with cis-Platin at N7-Position" Chem.Pharm.Bull.(in press). (1994)

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      1993 Annual Research Report

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Published: 1993-04-01   Modified: 2016-04-21  

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