• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

原始紅藻のゲノム情報を用いた真核生物の初期ゲノム進化の解析

Research Project

Project/Area Number 05J10695
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Biodiversity/Systematics
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

松崎 素道  The University of Tokyo, 大学院・理学系研究科, 特別研究員(PD) (00511396)

Project Period (FY) 2005 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥3,300,000 (Direct Cost: ¥3,300,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2005: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Keywords色素体 / 二次共生 / イソプレノイド / ゲノム進化 / 遺伝子レパートリー / パーキンサス / 紅藻 / イントロン / ゲノム / アラインメント
Research Abstract

本研究の目的は、単細胞紅藻Cyanidioschyzon merolaeの全ゲノム情報を足掛かりに、イントロンおよび代謝系遺伝子のレパートリーに着目し、真核生物の初期のゲノム進化の一端を明らかにすることである。
昨年度に実施したイソプレノイド代謝系7遺伝子の解析から、色素体が成立した初期の時点で遺伝子レパートリーの多様性が成立したこと、貝類の寄生虫パーキンサスにも色素体の存在が推定されることを示した。これは極めて重要な知見であることから、本年度はこの点についてさらに詳しく解析を実施し考察を進めた。その結果、珪藻・渦鞭毛藻などはかつて一次共生の色素体を持っており、いわば共生交替によって現在のような二次共生色素体を獲得した可能性が考えられた。また免疫蛍光顕微鏡法によりパーキンサスには確かに二次共生色素体が存在していることが示されたが、しかしながらそれは独自のDNAを持っていないことが示唆された。
本研究で得られた知見をまとめると以下のようになる。真核生物は一次共生により色素体を成立させたが、その際にシアノバクテリアのみでなくクラミジアなどの遺伝子をゲノム中に取り込み、それによって代謝系遺伝子は多様なレパートリーを持つことになった。そのうち一部の生物は共生交替により二次共生色素体を獲得した。時間の経過に伴って色素体DNAから細胞核ゲノムへと遺伝子が移行していくと考えられているが、パーキンサスでは確かにその移行が完了している。以上の成果は、特に代謝系遺伝子に着目して真核生物のゲノム進化の一端を明らかにしたものであり、かつ色素体の進化に関する重要な知見を得たものといえる。反面、イントロンに着目した研究については中途で割愛せざるを得なかった。

Report

(3 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2008 2007

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] A Cryptic Algal Group Unveiled:A PIastid Biosynthesis Pathway in the Oyster Parasite Perkinsus marinus2008

    • Author(s)
      松崎 素道
    • Journal Title

      Molecular Biology and Evolution 25(掲載確定)

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 貝類寄生虫パーキンサスの二次共生色素体2008

    • Author(s)
      松崎 素道
    • Organizer
      日本藻類学会第32回大会
    • Place of Presentation
      東京海洋大学(港区)
    • Year and Date
      2008-03-23
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 貝類寄生虫PerkinsusのDNA含有オルガネラ2007

    • Author(s)
      松崎 素道
    • Organizer
      第67回日本寄生虫学会東日本支部大会
    • Place of Presentation
      東京大学(文京区)
    • Year and Date
      2007-10-06
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Algae-derived isoprenoid biosynthesis pathway suggesting a plastid in an oyster parasite, Perkinsus marinus2007

    • Author(s)
      松崎 素道
    • Organizer
      Annual Meeting 2007 of Phycological Society of America and International Society of Protistologists
    • Place of Presentation
      Providence,RI,USA
    • Year and Date
      2007-08-09
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 貝類寄生虫Perkinsusのオルガネラとそのゲノム2007

    • Author(s)
      松崎 素道
    • Organizer
      第15回分子寄生虫学ワークショップ
    • Place of Presentation
      草津セミナーハウス.(草津町)
    • Year and Date
      2007-07-27
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 貝類寄生虫パーキンサスにおける藻類由来イソプレノイド生合成系2007

    • Author(s)
      松崎 素道
    • Organizer
      第3回日本進化原生生物学研究会
    • Place of Presentation
      海洋研究開発機構(横浜市)
    • Year and Date
      2007-07-07
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2005-04-01   Modified: 2024-03-26  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi