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超高速DNA/RNA化学合成法の開発-酵素反応にせまる効率的核酸合成反応-

Research Project

Project/Area Number 06780462
Research Category

Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Bioorganic chemistry
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

和田 猛  東京工業大学, 生命理工学部, 助手 (90240548)

Project Period (FY) 1994
Project Status Completed (Fiscal Year 1994)
Budget Amount *help
¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 1994: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
KeywordsDNA合成 / RNA合成 / 保護基 / 分子内触媒
Research Abstract

核酸を化学合成する際にはその構成単位であるヌクレオチドユニットを逐次脱水縮合してヌクレオチド鎖を延長していくが、この縮合反応に先だってヌクレオチドに含まれる水酸基、アミノ基をはじめとする種々の官能基に保護基を導入しておく必要がある。現代の高度に精密さが要求される有機合成化学においては、保護基は単に官能基を保護するばかりでなく、それが他の官能基に変換できたり、反応の際に触媒活性中心として働くような機能を併せもつ、いわゆる機能性保護基の開発が望まれている。本研究では、核酸の化学合成における触媒活性部位をもつ新しいトリチル型の保護基を種々デザインし、これをデオキシリボヌクレオシドの5'-水酸基に導入して縮合反応における触媒活性を評価した。
分子内触媒部位としてアルキルイミダゾール残基をもつ保護基を種々合成し、デオキシリボヌクレオシドの5'-位に導入した。この誘導体をリン酸トリエステル法のビルディングブロックへと導き、5'-位に遊離の水酸基をもつヌクレオシドを縮合させて反応の進行状況を^<31>P NMRを用いて追跡した。反応が完結するまでの時間から触媒活性を評価したところ、世界最速の縮合反応を可能にする新しい保護基を見いだすことができた。
本研究で開発した触媒機能をもつ新しい保護基は、核酸分子の構築反応を分子内触媒という最も効果的な方法で活性化するために、これまでに実現できなかったような反応速度と化学量論的な反応を実現し、100量体以上のDNA/RNAの化学合成もを可能にするものと思われる。

Report

(1 results)
  • 1994 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All Other

All Publications (6 results)

  • [Publications] T.Wada,T.Moriguchi,M.Sekine: "Synthesis and Properties of N-Phosphorylated Nucleosides" J.Am.Chem.Soc.116. 9901-9911 (1994)

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      1994 Annual Research Report
  • [Publications] M.Sekine,K.Seio,T.Wada,K.Sakamoto,S.Yokoyama: "Chemical Synthesis and Properties of an Interresidually Cyclized Uridylyl-(3'-5')uridine as a Model of tRNA U Turn Structure Having a Sharp Bend" J.Am.Chem.Soc.116. 4469-4470 (1994)

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      1994 Annual Research Report
  • [Publications] T.Wada,M.Sekine: "2-(Trimethylsilyl)ethyl as a Phosphate Proteccing Group in Oligonucleotide Synthesis" Tetraheclron Lett.35. 757-760 (1994)

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      1994 Annual Research Report
  • [Publications] M.Sekine,H.Tsuruoka,S.Iimura,T.Wada: "Simultaneous Removal of Two 2-Cyano-1,1-dimethyl Groups from Big(2-Cyano-1,1-dimethylethyl)thymicline 3'-Phosphate Derivatives....." Natural Produce Lett.5. 41-46 (1994)

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      1994 Annual Research Report
  • [Publications] T.Wada,M.Tobe,T.Nagayama,M.Sekine: "Regioselective Protection of the 2'-Hydroxyl Group of N-Acyl-3iS-O-di(t-butyl)silanediylnucleoside Derivcctives by Use of t-BuMgCl...." Tetrahedron Lett.36(in press). (1995)

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  • [Publications] T.Wada,K.Inageda,K.Aritomo et.al.: "Structural Characterization of Cydic ADP-Ribose by NMR Spectroscopy" Nucleosides Nucleotides. 14(in press). (1995)

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      1994 Annual Research Report

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Published: 1994-04-01   Modified: 2016-04-21  

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