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L型DNA固定化DNAマイクロアレイの開発とCAGリピート結合分子の開発

Research Project

Project/Area Number 06J03285
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Chemistry related to living body
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

林 剛介  Osaka University, 理学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2006 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥2,800,000 (Direct Cost: ¥2,800,000)
Fiscal Year 2008: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2007: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywords翻訳活性化 / アンチセンス / PURESYSTEM / GFP / aptamer / azobenzene / photoswitch / SPR / in vitro selection / L型DNA / SPR imaging / PCR / SNP
Research Abstract

生体内で遺伝子発現を抑制する方法としてRNAi法やアンチセンス法がある。これらの方法ではmRNAに対して相補的な配列を持つ一本鎖RNAあるいはDNA(アンチセンスオリゴ)が機能の中核を担っている。アンチセンス法ではアンチセンスオリゴがmRNAと相補鎖を形成した後、RNase HによってmRNAの切断が起こる経路、または、相補鎖形成が翻訳開始複合体の形成を阻害する経路のどちらかでタンパク質の翻訳を抑制する。このように、遺伝子発現を翻訳段階で抑制する方法論は確立されてきているが、逆に、遺伝子発現を促進させる方法論はまだほとんどない。今回我々は、RNase Hが存在しない無細胞翻訳系で、GFPメッセンジャーRNAの翻訳領域に相補的なアンチセンスオリゴが、翻訳反応を促進させることを見出した。
我々は、再構成系の無細胞翻訳系であるPURESYSTEMを用いて、GFPの翻訳反応を行った。この反応系中に、GFPのmRNAに対するアンチセンスオリゴを加えると、リボソーム結合サイトや開始コドン付近にハイブリダイズするものは、翻訳されるGFPタンパク量の低下を示したのに対し、より下流にハイブリダイズするアンチセンスオリゴのいくつかは、1.5〜2倍程度の翻訳量の上昇を促す事が確認された。これは、アンチセンスオリゴのmRNAの複合体形成が、より翻訳開始複合体の形成に有利なmRNA構造を誘起したためだと考えている。これからより詳細に調査して行きたい。

Report

(3 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2009 2008 2007 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (11 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] RNA aptamers that reversibly bind photoresponsive azobenzene-containing peptide2009

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Nakatani K.
    • Journal Title

      Chemistry A European Journal 15

      Pages: 424-432

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genotyping by allele-specifc L-DNA-tagged PCR2008

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Nakatani K.
    • Journal Title

      Journal of Biotechnology 135

      Pages: 157-160

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RNA aptamers that reversibly bind to photoresponsive peptide2008

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Nakatani K.
    • Journal Title

      Nucleic Acid Symposium Series 52

      Pages: 703-704

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Journal Article] Photoregulation of a Peptide-RNA Interaction on a Gold Surface2007

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Dohno C., Nakatani K.
    • Journal Title

      Journal of American Chemical Society 129(28)

      Pages: 8678-8679

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reversible regulation of binding between a photoresponsive peptide and its RNA aptamer2007

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Dohno C., Nakatani K.
    • Journal Title

      Nucleic Acid Symposium Series 51

      Pages: 93-94

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Journal Article] Detection of L-DNA-tagged PCR products by surface plasmon resonance imaging2007

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Kobori A., Nakatani K.
    • Journal Title

      Chembiochme 8(2)

      Pages: 169-171

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Presentation] 無細胞翻訳系中でのアンチセンス核酸を用いた遺伝子発現の活性化2009

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Nakatani K.
    • Organizer
      日本化学会年会
    • Place of Presentation
      日本大学
    • Year and Date
      2009-03-27
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] アンチセンスオリゴヌクレオチドによるPUREシステム中での蛍光タンパク質の翻訳促進2008

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Nakatani K.
    • Organizer
      分子生物学学会・生化学会合同年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-10
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] ドープトセレクションを用いた光応答性リガンドに結合するアプタマーの2次構造予測2008

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Nakatani K.
    • Organizer
      The 3rd Joint Symposium on Bio-Related Chemistry
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      2008-09-19
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA aptamers that reversibly bind to photoresponsive peptide2008

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Nakatani K.
    • Organizer
      Joint symposium 18^<th> International round table on nucleosides, nucleotides, and nucleic acids
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      2008-09-10
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] アンチセンスオリゴヌクレオチドを用いた無細胞翻訳系中でのGFPメッセンジャーRNAの翻訳促進2008

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Nakatani K.
    • Organizer
      RNA学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2008-07-24
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 金表面上への光照射によるRNA-ペプチド複合体の可逆的相互作用2008

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Nakatani K.
    • Organizer
      ケミカルバイオロジー学会年会
    • Place of Presentation
      学術総合センター
    • Year and Date
      2008-05-19
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 光応答性リボスイッチを指向したRNA-リガンド間の結合制御2008

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Dohno C., Nakatani K.
    • Organizer
      日本化学会年会
    • Place of Presentation
      立教大学
    • Year and Date
      2008-03-28
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Photoswitchable Control of Binding between a Photoresponsive Peptide and the RNA Aptamer2008

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Dohno C., Nakatani K.
    • Organizer
      11th Sanken, 6th Nanotechnology Center and 1st MSTEC Internaitonal Symposium
    • Place of Presentation
      淡路島夢舞台
    • Year and Date
      2008-02-04
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Reversible regulation of binding between a photoresponsive peptide and its RNA aptamer2007

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Dohno C., Nakatani K.
    • Organizer
      5th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      東京大学安田講堂
    • Year and Date
      2007-11-22
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] RNAアプタマーとリガンドの光による可逆的結合制御2007

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Dohno C., Nakatani K.
    • Organizer
      RNA学会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場
    • Year and Date
      2007-07-29
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 光を用いたRNA-ペプチド結合のスイッチング2007

    • Author(s)
      Hayashi G., Hagihara M., Dohno C., Nakatani K.
    • Organizer
      ケミカルバイオロジー研究会
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      2007-05-10
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.sanken.osaka-u.ac.jp/labs/rbc/

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.sanken.osaka-u.ac.jp/labs/rbc/

    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2024-03-26  

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