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AAAタンパク質によるタンパク質アンフォールディングと脱凝集の分子機構の解析

Research Project

Project/Area Number 06J08040
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Chemistry related to living body
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

錦織 伸吾  Kumamoto University, 発生医学研究センター, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2006 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥3,400,000 (Direct Cost: ¥3,400,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
KeywordsAAAタンパク / ATP加水分解 / 協同性 / p97 / AAAタンパク質 / FtsH / アンフォールディング / タンパク質凝集 / ポリグルタミン
Research Abstract

p97は小胞体関連分解や膜融合、タンパク質凝集抑制など様々な細胞機能に関与するAAAファミリータンパク質である。p97はN末端ドメインと2つのAAA型ATPaseドメイン(D1およびD2)から構成され、ホモ6量体のリング構造を形成する。D1はほとんどATPase活性を示さないため、D2でATPを加水分解して機能すると考えられているが、ドメイン間およびサブユニット間でどのように協同して働いているかは不明である。そこでp97の動作原理を明らかにするため、線虫由来p97ホモログCDC-48.1を題材に、p97のATP加水分解機構を調べた。D1のヌクレオチド結合能を欠損させるとD2のATPase活性は完全に消失した。またD1の触媒残基に変異(E311Q)を導入しATP加水分解能を消失させると、D2のATPase活性は野生型の20%程度だが、E311Qに加えさらにD1のセンサー1やアルギニンフィンガーへ変異を導入すると、D2のATPase活性は野生型の80%程度まで回復した。これらの結果から、D2のATPase活性はD1のヌクレオチド結合状態によって変化し、D1がADP結合型の時、D2が活性型になると考えられた。これはD1のATPase活性を促進させるとD2のATPase活性が減少するという結果とも一致した。また、D2のATPase活性はHill係数が1.6を示し、わずかなATPアナログを添加するとATPase活性が強く阻害されることから、サブユニット間においては正の協同性をもって働いていることが分かった。
FtsHは膜結合型のプロテアーゼであり、不要タンパク質や細胞調節因子を分解またFtsHの基質分解のアンフォールディングと分解のメカニズムを明らかにするた、安定性を変化させた大腸菌およびAnabaena由来のflavodoxonを基質としてFtsHによる分解効率を調べた。その結果、基質の分解効率は基質の安定性と良い相関がみられ、FtsHの基質は基質構造の安定性に依存することが証明された。

Report

(3 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2009 2008 2006 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (3 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] p97 homologs from C. elegans, CDC-48.1 and CDC-48.2, suppress the aggregate formation of huntingtin exon1 containing expanded polyQ repeat2008

    • Author(s)
      Nishikori, S.
    • Journal Title

      Genes Cells 13

      Pages: 827-838

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] From the common molecular basis of the AAA protein to various energy-dependent and-independent activities of AAA proteins2008

    • Author(s)
      Ogura T.
    • Journal Title

      Biochemical Society Transactions 36

      Pages: 67-71

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mutational analysis of the functional motifs in the ATPase domain of C. elegans fidgetin homologue FIGL-1 : Firm evidence for an intersubunit catalysis mechanism of ATP hydrolysis by AAA ATPases.2006

    • Author(s)
      Yakushiji, Y., Nishikori, S., Yamanaka, K., Ogura, T
    • Journal Title

      Journal of structural Biology 156

      Pages: 93-100

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] タンパク質を解きほぐすAAA+シャペ口ン2006

    • Author(s)
      錦織伸吾, 小椋 光
    • Journal Title

      生物工学会誌 84

      Pages: 404-406

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Presentation] Roles of p97/VCP, a multifunctional AAA chaperone, in protein oligomerization and aggregation in neurodegenerative diseases2009

    • Author(s)
      Ogura, T.
    • Organizer
      BIT Life Sciences'2nd Annual Protein and Peptide Conference (PepCon-2009)
    • Place of Presentation
      Seoul, South Korea
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 線虫由来p97ホモログCDC-48.1のATP加水分解機構の解析2008

    • Author(s)
      錦織伸吾
    • Organizer
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Positive Cooperativity of the p97 AAA ATPase Is Critical for Cell Viability2008

    • Author(s)
      Esaki, M.
    • Organizer
      48th ASCB Annual Meeting
    • Place of Presentation
      San Francisco, USA.
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp/divisions/molecular_cell_biology/

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp/divisions/molecular_cell_biology/

    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2024-03-26  

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