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モルテン・グロビュール状態における分子内運動のO-ROESY法による研究

Research Project

Project/Area Number 07280207
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionGifu University

Principal Investigator

桑田 一夫  岐阜大学, 医学部, 助教授 (00170142)

Project Period (FY) 1995
Project Status Completed (Fiscal Year 1995)
Budget Amount *help
¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
Fiscal Year 1995: ¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
KeywordsO-ROESY / 緩和行列 / スペクトル密度関数 / オーダーパラメーター / 緩和時間 / モルテン・グロビュール
Research Abstract

O-ROESY法のための完全緩和行列法のプログラム(1.CORMA-O-ROESY,2.MARDIGRA-O-ROESY及び3.NONLINEAR-O-ROESY)をFortranで作成した。1は蛋白質または核酸のpdbフォーマット・ファイルから2次元O-ROESYスペクトル強度を算出する。2は、2次元O-ROESY実験から得られた強度から各核間ベクトルの交差緩和時間を完全緩和行列法により算出する。3は2の出力より、スペクトル密度関数(Lipari-Szabotype)のオーダー・パラメーター及び内部回転緩和時間を算出する。2種類の青磁場を用いた場合の3の出力のユニークネスは完全探索法により確認した。
またO-ROESY法は未だ理論的に曖昧な部分があったので、れらの点を出来るでけ解決した。即ち、スカラー・カップリングの影響及び遅い(msecオーダー)の運動の影響である。前者はオフ・レゾナンス・ラジオ波照射場では、現実的に無視出来るようになる事が示された。また後者に関しては、O-ROESY法を通じて系統的に観測可能である事が示された。同時にO-ROESY法の量子電磁気力学(QED)的な計算法が、パルスEPRやPHOTON ECHOの様な時間分解光供鳴法に対しても一般に適用出来る事が分かった。
実験では,チトクロームCのa.天然状態、b.モルテン・グロピュール状態、c.変性状態について1次元及び2次元O-ROESY測定を行った。1次元スペクトルによる緩和時間解析では、bでは、aやcよりも部分的に緩和時間の短い成分が存在する事が分かった。
NMR的にみた場合、これが疎水性コアに由来するのかどうか、現在検討している。

Report

(1 results)
  • 1995 Annual Research Report
  • Research Products

    (2 results)

All Other

All Publications (2 results)

  • [Publications] 桑田 一夫: "蛋白質・核酸系の核磁気緩和現象(I)" 生物物理. 35. 19-23 (1995)

    • Related Report
      1995 Annual Research Report
  • [Publications] Kazuo Kuwata: "Polariztion-Operator Formalism Description of the Off-Resonance ROESY Experiment" J.Magn.Reson.114. 219-229 (1995)

    • Related Report
      1995 Annual Research Report

URL: 

Published: 1995-04-01   Modified: 2016-04-21  

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